R语言临床预测模型的评估和验证指标实战:综合判别改善指数IDI
在临床医学研究中,评估和验证预测模型的性能是非常重要的。而在R语言中,我们可以使用不同的指标来评价和验证模型。本文将介绍一种常用的评价指标——综合判别改善指数(Integrated Discrimination Improvement,IDI),并提供相应的R代码示例。
综合判别改善指数(IDI)是一种用于衡量预测模型性能改善的指标。它基于“预测模型是否对事件和非事件样本进行了更好的排序”的假设。IDI的计算需要计算两个模型之间的差异,通常是基准模型和改进模型之间的差异。
下面是一个使用IDI评估两个预测模型的简单示例:
# 导入所需的包
library(pROC)
# 生成虚拟数据
set.seed(123)
n <- 1000
event <- rbinom(n, 1, 0.3)
predictor1 <- rnorm(n)
predictor2 <- rnorm(n)
baseline_model <- glm(event ~ predictor1, family = binomial())
improved_model <- glm(event ~ predictor1 + predictor2, family = binomial())
# 计算预测结果
baseline_prob <- predict(baseline_model, type &