单链表中老师永远不会讲的环状问题

单链表判断环状问题

一、判断单链表中有无环

1.定义两个快慢指针,fast和slow
2.从头开始遍历,fast一次走两步,slow一次走一步
3.当它俩相遇的时候,说明该链表有环
注意:不能让fast一次走三步,有可能导致fast与slow擦肩而过,相遇的时间不确定,甚至永远相遇不了,所以说fast一次走两步是最合适也是最快的方法
上代码

 public boolean hasCycle() {
 
        Node fast = this.head;
        Node slow = this.head;
        
        while (fast != null && fast.next != null) {
        //当fast为空说明链表已经遍历完了
            fast = fast.next.next;
            slow = slow.next;
            if(fast == slow) {
                return true;
            }
        }
        //代码走到这一行说明链表遍历完它俩还没相遇,所以无环
        return false;
    }

二、找出链表进入环状的入口点

这就需要推到一个数学公式来证明,很少有人会完完整整给你推导
重点来了
判断链表环状的入口点的数学推导过程
1.定义快慢指针fast,slow,fast一次走两步,slow一次走一步
2.第一次相遇:fast所走路程:X+L+NC slow所走路程:X+L
3.fast 所走路程是slow的2倍,所以X+L+NC=2(X+L)
化简得X+L= NC ==> X+L = C
4.可知,如果fast和slow相遇之后,把fast拉到起点,fast与slow一起走,一次走一步,当它俩再次相遇,这个相遇点就是该链表环状的入口点

上代码

public Node detectCycle() {

        Node fast = this.head;
        Node slow = this.head;

        while (fast != null && fast.next != null) {

            fast = fast.next.next;
            slow = slow.next;

            if(fast == slow) {
            //当fast与slo第一次相遇之后把fast拉到起点
               fast = this.head;
               while (fast != slow) {
               //fast在起点,slow在第一次相遇点,一起开始一次走一步
                   fast = fast.next;
                   slow  = slow.next;
               }
               //代码走到这说明fast与slow再次相遇
               return fast;
            }
        }
        return null;

    }
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Bowtie2可以用于鉴定环状RNA(circular RNA)序列。环状RNA是一类特殊的非编码RNA分子,其具有环状结构而不是线性结构,常常通过背靠背或头对头的方式连接在一起形成环状分子。环状RNA在细胞生物学和分子医学领域具有重要的生物学功能和研究价值。 在使用Bowtie2进行环状RNA鉴定时,需要先准备好参考基因组文件和环状RNA测序数据文件。参考基因组文件需要进行索引,可以使用Bowtie2提供的索引工具进行处理。然后,可以使用Bowtie2进行比对,比对结果可以输出为SAM或BAM格式的文件,方便后续的分析和处理。 需要注意的是,环状RNA的测序数据通常会比较短,并且包含反向互补序列。为了提高比对准确性,可以使用Bowtie2的--norc参数禁止反向互补比对,或使用--local参数进行局部比对,从而减少误差率和虚假比对的发生。 下面是一个简单的示例代码,用于使用Bowtie2进行环状RNA鉴定: ```python import subprocess # 定义参考基因组文件路径 genome_file = "ref_genome.fa" # 定义环状RNA测序数据文件路径 fastq_file = "circRNA.fastq" # 进行Bowtie2比对 cmd = "bowtie2 -x {0} -U {1} --norc -S output.sam".format(genome_file, fastq_file) subprocess.call(cmd, shell=True) ``` 在上述代码,"ref_genome.fa"为参考基因组文件,"circRNA.fastq"为环状RNA测序数据文件。程序会运行Bowtie2软件进行比对,并将比对结果输出到"output.sam"文件。需要注意的是,该代码示例使用了Python的subprocess模块来调用系统命令,因此需要保证Bowtie2软件已经安装并配置好了环境变量。

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