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RSS订阅原创 绘制遗传图谱工具——MapChart
计算遗传距离可以使用Joinmap，但是该软件绘制的连锁图不太个性化，因此我们使用joinmap计算出遗传距离后可以使用MapChart绘制连锁图。
2022-03-02 21:14:22
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原创 使用python脚本结合Excel筛选功能对BSA结果进行候选基因筛选
使用python脚本结合Excel筛选功能对BSA结果进行候选基因筛选拟解决问题-对BSA返回结果数据进行筛选获得候选基因BSA返回的测序文件，将两个文件的SNPindex值与基因注释结合起来，这样就能直接使用Excel的筛选功能找到候选基因ID。两个.xlsx文件，比如Delta-SNPindex.xlsx和exonic_variant_function.xlsxpd.merge(df1, df2, how = ‘inner’, on = ['col1‘， ’col2‘， ‘col3’], indi
2021-12-06 15:23:45
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原创 Excel对遗传学质量基因进行卡方分析
使用Excel对遗传学中质量性状判断进行卡方检测：卡方值（X2）=（实际值-理论值）2/理论值。有很多人不知道什么是卡方值，什么是值。这次记住了，卡方值长得像X的平方。以单个基因控制的性状为例，F2中黄瓜有毛：黄瓜无毛=3：1。F2中共统计240株，有毛175，无毛65。df（自由度）为1，什么是自由度，请看下面。下面是具体的步骤：1.求出理论值有毛180，无毛60.2.求出卡方值，卡方值近似0.56X2=（175-180）（175-180）/ 180 + （ 65-60）（65-60）/
2020-11-19 22:59:18
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原创 MemoryError: Unable to allocate 137.MiB
参考了别人的文章，最实用的方法是将“dtype"或者”astype“修改为"dtype=32"(默认为dtype=64),"astype=32".用这种方法解决了手绘实例中的问题。
2020-07-19 11:00:33
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原创 python生成词云出现的问题：待解决
第一个问题：看到网上有人说是因为scipy库版本的原因，将矩形框中的语句换成"from imageio import imread"就行了，（因此我在命令行使用"pip install imageio"）确实未出现importError，如P1.（P1）但是出现了下面的问题：如P2（P2）现在还解决不了这个问题，但是不能一直纠结于此，先慢慢学习，随后有能力再解决。...
2020-06-17 15:47:39
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原创 python基础，斜杠与反斜杠的区别。
在嵩天教授的jieba库之hamlet与threekingdoms词频统计实例中，遇到了以下两个问题：1.无法读取带有BOM的utf-8 txt文件（指threekingdom实例）2.读取文件时斜杠与反斜杠的效果不同（hamlet实例中用反斜杠"\", threekingdom实例中用斜杠"/")解决问题：1.有网友提出同codecs库转化格式，但是自己不会安装codecs库，于是我在文本工具中将“带有BOM的utf-8"文件另存为”utf-8"文件以后，认为没问题了，但是还是出现了问题，
2020-06-13 16:03:17
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原创 Python 中ls.sort (key = lambda x:x[1],reverse=True) 排序问题
在嵩天教授的jieba库使用之hamlet文本词频统计实例中，使用了以下语法：ls.sort(key = lambda x:x[1], reverse=True)这里的理解是，按照列表维度（指数组中第0，1，2个元素）进行排序，默认为从小到大，'reverse=True'则意味着从大到小。关于维度，形象地理解如下:ls = [('s','he',3), ('q', 'she', 2), ('p', 'they', 1)]中，x:x[0]相当于按's', 'q', 'p'进行排序，其中x可以换
2020-06-13 12:02:26
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原创 安装pyinstaller遇到的问题
pip install pyinstaller显示提醒！WARNING:…which is not on the PATH使用 pyinstaller时报错：NameError：no nodule named ‘pyinstaller’请问该怎么解决？
2020-06-10 11:28:47
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空空如也
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