用Python按照规则写入csv文件

读取txt文件,将每一个簇按照ID互相组合,写入csv文件。
这是为了记录每一个蛋白和哪些蛋白具有100%的相似性,是一个全排列的问题。

import csv
f = open('seq_sim.csv', 'w', encoding = 'utf-8',newline='') 
csv_writer = csv.writer(f)
csv_writer.writerow(['100% Identity Protein ID', 'Database ID', 'Name', 'Organism'])

with open('cd3.txt', 'r') as f:
    lines = f.readlines()
    for line in lines:
        if line[0] != '>':
            list = line.split()
            for i in range(len(list)):
                for j in range(len(list)):
                    if i == j:
                        continue
                    csv_writer.writerow([list[i], list[j]])
                    print(list[i], '***', list[j])


其中newline=’’,将空行去掉了,具体可以看下面的格式,因为我用的是Python3,所以使用的是这种方法,python2是将’w‘改为了’wb‘。
参考博客:
https://blog.csdn.net/lbj1260200629/article/details/89600055

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