linux系统下调用的第一个jar包

linux系统下调用的第一个jar包

如何生成jar包

选择文件,点击Project Structure…

选择Artifacts,点击左上角+号,选择JAR后选择Empty下面的指令

从Main Class中选择你要生成jar包的文件

完成上述jar包的配置之后,一定要选择界面上面的Build,在选择Build Artifacts…


在这里插入图片描述
完成上述jar操作之后,就会在目录生成out文件夹,即下面含有jar包

在linux系统下调用jar包

上传jar包,初学者,我是选择输入“rz”命令,选择文件上传

调用jar命令:java -jar MSA.jar (这里我的jar包名称是MSA.jar)

运行中的一些注意点

1、在java文件中调用linux指令:
String command = “HHsuite/hhsuite-3.0-beta.3-Linux/bin/hhblits -i ./linlinzhneg/Protein/” ;
Process pro = Runtime.getRuntime().exec(new String[]{"/bin/sh", “-c”, command});
command是linux指令,getRuntime().exec()执行外部指令,即调用linux下工具
{"/bin/sh", “-c”, command},是执行外部程序的三个参数,//需要指定参数一:命令位置;参数二:-c表示先执行第一个参数;参数三:你的命令
windows下操作命令是:{ “cmd”, “/c”, cmds }
2、因为我这里要调用linux里面的工具,所以很多地方不能在本地测试,但是建议能测试的地方一定要在本地测试,以防出现不应该的错误
3、command指令可以直接在linux系统中进行检验,看可能执行命令,建议将可执行的指令直接复制到你的java代码中,执行命令的在那个文件夹下,建议执行jar包也在该文件下,否则就关注路径问题
4、千万要注意路径问题,尽量用pwd复制路径,我就是因为路径一个字母写错,检查了好久,当显示文件打不开是就要注意路径的选择问题
5、小白学习之路,感谢我的partner对我的帮助

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