Linux下Palabos源码编译安装及使用

目录

软件介绍

基本依赖

其它可选依赖

一、源码下载

二、解压缩（通过方式1下载源码.zip格式）

三、编译安装

3.1 自带算例

​3.2 自行开发算例

四、简单使用

4.1 串行运行

4.2 并行运行

4.3 查看结果

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软件介绍

        Palabos是一款基于LBM（格子Boltzmann方法）的开源软件，也是为数不多的基于LBM方法的计算流体力学软件，由来自不同国家的多位学者合作开发完成，主要用于流体模拟。Palobos集成了多个LBM模型。它采用c++编写，可实现MPI并行，并采用了多种优化措施。它能将计算结果输出为VTK形式，并采用诸如paraview等开源的后处理软件进行数据分析处理。

        Palabos的主要特点在于，其在并行结构上采取并行机制与模型分离的方式，使得应用建模与并行机制不相关。这也使得PalaBos的易于扩展。

基本依赖

1、C++编译器；

2、clang-format代码格式化工具；

3、make自动化编译工具；

4、cmake跨平台安装工具。

以上依赖项可以通过以下命令安装：

sudo apt install gcc clang clang-format cmake make

其它可选依赖

1、OpenMPI：用于并行计算；

2、imagemagick：用于计算生成GIF图片；

3、HDF5：用于输出HDF5文件；

4、ccache：用于加速编译过程。

以上依赖项可以通过以下命令安装：

sudo apt install libopenmpi-dev imagemagick libhdf5-dev libhdf5-mpi-dev ccache

一、源码下载

方式1：通过访问Palabos官网下载。

方式2：通过git下载。使用命令行跳转到需要存储Palabos源码的文件夹，如E:\software

cd /mnt/e/software

        命令行输入：

git clone https://gitlab.com/unigespc/palabos.git

二、解压缩（通过方式1下载源码.zip格式）

unzip palabos-master.zip

三、编译安装

3.1 自带算例

        Palabos提供了多个算例，如图所示：

        用户可以对不同的算例进行单独编译，形成单个算例对应的可执行文件。以cavity2D为例，编译步骤如下。

        第一步：进入算例所在文件夹。

cd /mnt/e/software/palabos-master/examples/showCases/cavity2d/build/

        第二步：使用cmake构建。

cmake ..

        第三步：算例编译。

make

        编译完成：

3.2 自行开发算例

        软件支持自定义开发，需要在二次开发的路径下使用cmake工具进行构建，流程与自带算例编译相同。

四、简单使用

4.1 串行运行

        以经典CFD算例——方腔驱动流（顶盖驱动流）为例： 

./cavity2D

        计算完成：

4.2 并行运行

         Palabos支持并行运行，运行方式为（以4核运行cavity2D为例）：

mpirun -np 4 ./cavity2D

4.3 查看结果

        可在当前算例文件夹下查看计算过程中保存的GIF图片和VTK文件。

cavity2D

        也可以利用Paraview等后处理软件查看VTK文件，如下图

cavity2D

         下图为cavity3D计算结果在paraview软件中的显示：

cavity3D