学习笔记——Linux系统下安装seadas-ocssw模块，并对GOCI数据处理得到Rrc数据

        目前，我在做有关湖泊水色遥感方面的工作。现在需求是要对GOCI数据进行处理得到Rrc数据，利用Rrc数据对影像进行去云、去云阴影、耀斑和藻华像元等。参考GOCI相关的文献，其中均是使用Seadas对GOCI数据进行处理得到Rrc。

        我的电脑操作系统是Windows，安装了Seadas软件发现没法对GOCI数据进行处理。对数据处理主要用到的是seadas-ocssw模块，但是seadas-ocssw模块在windows系统无法使用，只能在Linux和Mac系统使用。

        因此，参考CSDN上面有关的博客，借用虚拟机使用seadas-ocssw模块。

一、在虚拟机中安装Linux系统

       首先我们需要下载虚拟机，官网给的是使用Orcale VM，但其实是个虚拟机都能用。虚拟机下载网址：VM VirtualBox | 虚拟化 | Oracle 中国

准备工作：

虚拟机下载完成后，需要准备一些东西：

1、Linux系统安装的驱动程序 

下载网址：Download Ubuntu Desktop | Ubuntu

2、Seadas安装包（Linux系统） 

   下载网址： NASA Ocean Color

   下载seadas_9.0.1_linux64_installer.sh

   提前准备好，省得在虚拟机中下载了。（我之前选择在虚拟机中下载，容易中途下载是失败，可能是我的网络问题。）

正式安装：

参考的教程：超级详细的 VirtualBox 虚拟机安装 及入门教程-CSDN博客

        虚拟机安装我是参考了一个博主的教程，他写的很全面。但是我在Linux中使用seadas-ocssw过程中，发现完全用不到那么复杂的设置。

        以下是我的简化版本：

1、新建一个虚拟电脑

2、安装设置

虚拟电脑名称与操作系统

名称：给你新建的虚拟电脑命个名，我直接就用seadas-ocssw

文件夹：应该是你新建的虚拟电脑的相关文件存储的路径，可以更改成其他盘（随便选一个存储空间大的盘，因为基本不会对里面的内容进行更改）。

虚拟光盘：这就是准备工作中提前下载的Linux系统安装的驱动光盘，这里先不选择

类型：选择Linux

版本：选择完类型，直接默认就行

设置完毕，直接下一步

硬件设置

这里是运行内存和CPU设置，位于绿色末端就行。

虚拟硬盘

最好分配多一些空间，因为在安装完毕seada-ocssw后基本就占用了23G内存。设置成100GB就差不多。

点击下一步，然后会给一个你设置的详情。点击完成。

3、设置驱动光盘

        进入到新建的虚拟电脑seadas-ocssw的设置页面，选择存储。

       选择控制器：IDE，点击小红框。

点击注册：

选择在准备工作中，提前下载的Linux系统安装的驱动光盘。

4、启动虚拟电脑，并安装Linux系统

虚拟机，启动!!!

点击第一个就行

随后进入到Linux的安装界面

在设置完，语言、键盘布局后，直接下一步到设置账户界面，继续下一步到安装。

到此，Linux系统安装完毕!

二、在Linux系统中安装Seadas和seadas-ocssw

共享文件夹设置

在安装Seadas之前，需要设置一下共享文件夹。

第一步：安装增强功能

点击完毕后，在左侧会出现一个小光盘，点进去然后在里面打开终端。

在终端中输入：

chomd +x autorun.sh

注: autorun.sh文件是一个脚本，chmod +x autorun.sh 这个命令是给脚本权限，然后才能运行脚本

需要安装一个包：bzip2

sudo apt-get install bzip2

继续输入:

./autorun.sh

注： ./autorun.sh 这个命令是运行脚本

输入完毕会让你输入密码，就是你安装系统设置的密码

第二步：选择要共享的文件夹

如图，进入共享文件夹设置界面

点击右上角，进行添加。

最下方红框，是所需勾选的选项。

到这里，已经设置完毕！

第三步：如何在Linux中打开并将本机数据导入到虚拟机

在虚拟机中打开共享文件夹：打开文件夹—> 其他位置——>选择你共享的文件夹（需要输入密码）

这样就打开了本机的文件夹，把需要的文件复制到虚拟机中就ok了。

安装SeaDAS

这里需要用到在准备工作时下载的linux版的Seadas安装（seadas_9.0.1_linux64_installer.sh）。

通过共享文件夹，将安装包移动到虚拟机中 （/home/lic/）

安装:在放置seadas安装包的文件夹（/home/lic/）下打开终端，输入以下代码

sh seadas_9.0.1_linux64_installer.sh

会跳转一个seadas安装界面，默认安装即可。

打开seadas，需要进入/home/lic/SeaDAS/bin路径下，在终端中输入

sh seadas

安装seadas-ocssw模块

 在seadas界面，SEADAS_Toolbox->install/update seadas process

进入到以下界面，选择你需要处理的数据，点击Run即可。

注：跟网络有关，网速差下载的贼慢还容易报错（连接超时）。

三、Seadas和seadas-ocssw模块的环境设置

Python设置

        刚安装好的Ubuntu系统，能够识别Python3命令，但是在安装OCSSW的时候，它只调用Python命令，不进行配置将会出错。

        方法：通过修改环境变量文件 '.bashrc'，输入代码打开环境变量文件。如果没有gedit库先安装一下（sudo apt install gedit）。

gedit ~./bashrc

在文件夹中添加一行 ：alias python='python3'

重新加载.bashrc文件

source ~/.bashrc

Seadas环境设置

      这里就是将seadas的文件路径写入到环境变量文件中，而且可以直接在命令行输入seadas打开SeaDAS。

打开环境变量文件：

gedit ~./bashrc

在底部添加：

export SEADAS_HOME=/home/lic/SeaDAS #注：就是你的seadas文件安装的位置
export PATH=$SEADAS_HOME/bin:$PATH

重新加载.bashrc文件

source ~/.bashrc

检验一下

在命令行中输入：seadas，就可以直接打开seadas软件

Seadas-ocssw模块环境设置

同seadas环境设置差不多

打开环境变量文件：

gedit ~./bashrc

在底部添加：

​export OCSSWROOT=$SEADAS_HOME/ocssw  
source $OCSSWROOT/OCSSW_bash.env

重新加载.bashrc文件

source ~/.bashrc

四、使用seadas-ocssw模块中的l2gen在命令行中处理数据

        检查一下，seadas-ocssw模块是否安装成功。在命令行中输入：l2gen。

这里就是安装好了！

        关于处理部分，可以参考Chatgpt给出的答案。

        我是对GOCI数据L1B级数据处理，得到Rrc数据。

        首先，创建一个参数文件，goci_rrc.txt

touch goci_rrc.txt  #创建文件
gedit goci_rrc.txt  #打开文件

        goci_rrc.txt，即参数文件设置：

• ifile：输入的 GOCI .h5 文件。
• ofile：输出的 Level-2 文件，文件名可以根据实际情况调整。
• l2prod：要生成的 Level-2 产品，这里是 Rayleigh-corrected reflectance Rrc。

        开始处理：

l2gen par=goci_rrc.txt

        如果是要进行批处理和规定处理的研究区范围，也可参考Chatgpt的给出的脚本。

       到这里就结束了，如果这篇文档对你有帮助，点个赞吧。

五、参考：

seadas安装编译教程-CSDN博客