libsvm代码阅读:关于Cache类的分析

update:2014-2-27 LinJM @HQU  『 libsvm专栏地址:http://blog.csdn.net/column/details/libsvm.html 』

下面来分析Cache类的源码,该类位于svm.cpp中。这个类的主要功能是:负责运算所涉及的内存管理,包括申请、释放等。

简单来说:这个Cache类,首先通过Cache构造函数申请一块空间,这块空间的大小是:L个head_t大小的空间。然后get_data函数保证结构head_t中至少有len个float的内存,并且将可以使用的内存块的指针放在data指针中;而swap_index函数则是用于交换head[i]和head[j]。

Cache类的定义如下:

class Cache
{
public:
	Cache(int l,long int size);
	~Cache();

	// request data [0,len)
	// return some position p where [p,len) need to be filled
	// (p >= len if nothing needs to be filled)
	int get_data(const int index, Qfloat **data, int len);
	void swap_index(int i, int j);	
private:
	int l;
	long int size;//所指定的全部内存,据说用Mb做单位
	//结构head_t用来记录所申请内存的指针,并记录长度,而且通过双向的指针,形成链表,增加寻址的速度
	struct head_t
	{
		head_t *prev, *next;	// a circular list是一个双向链表,非循环链表
		Qfloat *data;
		int len;		// data[0,len) is cached in this entry
	};

	head_t *head;//变量指针,该指针记录程序中所申请的内存。
	head_t lru_head;//双向链表的表头
	void lru_delete(head_t *h);//从双向链表中删去某个元素的链接,一般是删去当前所指向的元素
	void lru_insert(head_t *h);//在链表后面插入一个新的链接
};
主要包含:

  1. 两个int变量,分别是l和size,l是样本个数,size是指定的全部内存;
  2. 一个构造函数Cache,该函数根据样本数l申请L个head_t的空间;
  3. 一个析构函数~Cache,不用多说;
  4. 一个双向链表的结构head_t;
  5. 一个get_data函数,具体下文再说;
  6. 一个swap_index函数,交换两个head_t的值;
  7. 一个双向链表的删除函数lru_delete,一个插入函数lru_insert;
  8. 一个变量指针head,该指针指向程序中所申请的内存。

关于上面的结构体head_t,它是一个双向链表方便前后内存的访问,在文献LIBSVM:A  Libray for SVM中如下说法:



构造函数的代码如下:

Cache::Cache(int l_,long int size_):l(l_),size(size_)
{
	//calloc函数的功能与malloc函数的功能相似,都是从堆分配内存该函数与malloc函数的一个显著不同时
	//是,calloc函数得到的内存空间是经过初始化的,其内容全为0。
	head = (head_t *)calloc(l,sizeof(head_t));	// initialized to 0
	size /= sizeof(Qfloat);//先将原来byte数目转化为float的数目。
	size -= l * sizeof(head_t) / sizeof(Qfloat);//扣除掉L个head_t的内存数目
	size = max(size, 2 * (long int) l);	// cache must be large enough for two columns
	lru_head.next = lru_head.prev = &lru_head;
}
该函数根据实参:样本数L,申请L个head_t的空间,初始化为0;size的处理是:先将输入的size值(byte单位)转化为float的数目,然后再减去L个head_t所占的空间;其中lru_head因为尚没有head_t中申请到内存,故双向链表指向自己。

析构函数的代码如下:

Cache::~Cache()
{
	for(head_t *h = lru_head.next; h != &lru_head; h=h->next)
		free(h->data);
	free(head);
}
这个很简单,不用多说。


双向链表的删去函数代码:

void Cache::lru_delete(head_t *h)
{
	// delete from current location
	h->prev->next = h->next;
	h->next->prev = h->prev;
}
该函数用于后面swap_index函数断开双向链表的实现。只是断开链接,没有删去数据。


双向链表的插入函数代码:

void Cache::lru_insert(head_t *h)
{
	// insert to last position
	h->next = &lru_head;
	h->prev = lru_head.prev;
	h->prev->next = h;
	h->next->prev = h;
}
该函数用于后面swap_index函数恢复前面断开连接的两个数据的实现。


get_data函数的代码:

int Cache::get_data(const int index, Qfloat **data, int len)
{
	head_t *h = &head[index];
	if(h->len) lru_delete(h);
	int more = len - h->len;
	//因为shrink后h->len可能变小,那么more>0,现在要做的就是重新filled,即把内存变成len那么大(主要是通过realloc实现的)
	if(more > 0)
	{
		// free old space,这一步一般不会运行
		while(size < more)   //size为所指定的全部内存
		{
			head_t *old = lru_head.next;
			lru_delete(old);
			free(old->data);
			size += old->len;
			old->data = 0;
			old->len = 0;
		}

		// allocate new space
		h->data = (Qfloat *)realloc(h->data,sizeof(Qfloat)*len);//把内存扩大到len
		size -= more;
		swap(h->len,len);
	}

	lru_insert(h);
	*data = h->data;
	return len;
}

该函数主要的就是每个head[i]具有len大小的内存空间。关于realloc函数是扩大内存用的。


swap_index函数的代码:

void Cache::swap_index(int i, int j)
{
	if(i==j) return;

	if(head[i].len) lru_delete(&head[i]);//断开双向链表
	if(head[j].len) lru_delete(&head[j]);//断开双向链表
	swap(head[i].data,head[j].data);
	swap(head[i].len,head[j].len);
	if(head[i].len) lru_insert(&head[i]);
	if(head[j].len) lru_insert(&head[j]);

	if(i>j) swap(i,j);
	for(head_t *h = lru_head.next; h!=&lru_head; h=h->next)
	{
		if(h->len > i)
		{
			if(h->len > j)
				swap(h->data[i],h->data[j]);
			else
			{
				// give up
				lru_delete(h);
				free(h->data);
				size += h->len;
				h->data = 0;
				h->len = 0;
			}
		}
	}
}
这个函数就是交换head_t[i]和head_t[j]的内容。首先将head_t[i]和head_t[j]从双向链表中脱离出去,然后交换它们的内容,最后重新把它们恢复到链表中。

完整代码如下:

//
// Kernel Cache
//
// l is the number of total data items
// size is the cache size limit in bytes
//
//类Cache负责运算所涉及的内存的管理,包括申请、释放等
class Cache
{
public:
	Cache(int l,long int size);
	~Cache();

	// request data [0,len)
	// return some position p where [p,len) need to be filled
	// (p >= len if nothing needs to be filled)
	int get_data(const int index, Qfloat **data, int len);
	void swap_index(int i, int j);	
private:
	int l;
	long int size;//所指定的全部内存,据说用Mb做单位
	//结构head_t用来记录所申请内存的指针,并记录长度,而且通过双向的指针,形成链表,增加寻址的速度
	struct head_t
	{
		head_t *prev, *next;	// a circular list是一个双向链表,非循环链表
		Qfloat *data;
		int len;		// data[0,len) is cached in this entry
	};

	head_t *head;//变量指针,该指针记录程序中所申请的内存。
	head_t lru_head;//双向链表的表头
	void lru_delete(head_t *h);//从双向链表中删去某个元素的链接,一般是删去当前所指向的元素
	void lru_insert(head_t *h);//在链表后面插入一个新的链接
};

Cache::Cache(int l_,long int size_):l(l_),size(size_)
{
	//calloc函数的功能与malloc函数的功能相似,都是从堆分配内存该函数与malloc函数的一个显著不同时
	//是,calloc函数得到的内存空间是经过初始化的,其内容全为0。
	head = (head_t *)calloc(l,sizeof(head_t));	// initialized to 0
	size /= sizeof(Qfloat);//先将原来byte数目转化为float的数目。
	size -= l * sizeof(head_t) / sizeof(Qfloat);//扣除掉L个head_t的内存数目
	size = max(size, 2 * (long int) l);	// cache must be large enough for two columns
	lru_head.next = lru_head.prev = &lru_head;
}

Cache::~Cache()
{
	for(head_t *h = lru_head.next; h != &lru_head; h=h->next)
		free(h->data);
	free(head);
}

void Cache::lru_delete(head_t *h)
{
	// delete from current location
	h->prev->next = h->next;
	h->next->prev = h->prev;
}

void Cache::lru_insert(head_t *h)
{
	// insert to last position
	h->next = &lru_head;
	h->prev = lru_head.prev;
	h->prev->next = h;
	h->next->prev = h;
}

//该函数保证head_t[index]中至少有len个float的内存,并且将可以使用的内存块的指针放在data指针中,返回值为申请到的内存
int Cache::get_data(const int index, Qfloat **data, int len)
{
	head_t *h = &head[index];
	if(h->len) lru_delete(h);
	int more = len - h->len;

	if(more > 0)
	{
		// free old space
		while(size < more)   //size为所指定的全部内存
		{
			head_t *old = lru_head.next;
			lru_delete(old);
			free(old->data);
			size += old->len;
			old->data = 0;
			old->len = 0;
		}

		// allocate new space
		h->data = (Qfloat *)realloc(h->data,sizeof(Qfloat)*len);
		size -= more;
		swap(h->len,len);
	}

	lru_insert(h);
	*data = h->data;
	return len;
}

void Cache::swap_index(int i, int j)
{
	if(i==j) return;

	if(head[i].len) lru_delete(&head[i]);//断开双向链表
	if(head[j].len) lru_delete(&head[j]);//断开双向链表
	swap(head[i].data,head[j].data);
	swap(head[i].len,head[j].len);
	if(head[i].len) lru_insert(&head[i]);
	if(head[j].len) lru_insert(&head[j]);

	if(i>j) swap(i,j);
	for(head_t *h = lru_head.next; h!=&lru_head; h=h->next)
	{
		if(h->len > i)
		{
			if(h->len > j)
				swap(h->data[i],h->data[j]);
			else
			{
				// give up
				lru_delete(h);
				free(h->data);
				size += h->len;
				h->data = 0;
				h->len = 0;
			}
		}
	}
}


本文地址:http://blog.csdn.net/linj_m/article/details/19571663

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