Kubernetes节点扩容规模至2500的历程


我们使用Kubernetes做深度学习的研究已经超过两年。尽管我们最大的工作量直接管理裸云VM,但是Kubernetes提供了快速的迭代周期、具有合理的扩展性以及不含样板代码(a lack of boilerplate),所以在Kubernetes上进行的实验大多都达到了我们预期。我们现在运行着几个Kubernetes集群(一些在云上,一些在物理机机上),其中最大的已经超过2500节点。这些集群运行在Azure提供的D15v2和NC24 组合虚拟机上。

达到现在这个节点规模,我们也经历过很多问题。比如许多系统组件引起的问题:包括etcd、Kubernetes的master节点、Docker镜像获取问题、Network问题、KubeDNS,甚至是我们机器上的ARP缓存。我认为分享这些我们遇到的具体问题,以及我们是怎么解决这些问题是很有意义的。
etcd


在我们集群到500个节点之后,我们的researchers开始从kubectl命令行工具得到定时超时的警告。 我们尝试添加更多Kubernetes master(运行kube-apiserver的VM)。 这似乎暂时解决了这个问题,但是一连经历10次后,我们意识到这只是在处理症状,而没发现真正的原因(相比之下,GKE使用32位单核虚拟机支撑500个节点)。

这让我们非常怀疑是提供Kube master中央状态存储区的etcd集群出了问题。 从Datadog看来,尽管每台机器都使用能够达到5,000 IOPS的P30 SSD,但是在运行我们的etcd副本的DS15v2机器上,我们看到写入有几百毫秒的延迟。

这些延迟峰值阻塞了整个集群!

在fio[1]的基准测试中,我们发现etcd只能使用大约10%的IOPS,因为写延迟是2ms,etcd是连续的I/O,因此引起一连串的延迟。

然后,我们将每个节点的etcd目录移动到本地临时磁盘,这是一个直接连接到实例的SSD,而不是网络连接。切换到本地磁盘带后写延迟达到200us,etcd恢复正常!

直到我们达到大约1,000个节点以前,我们的集群运行良好。在1,000这一点上,我们再次看到了etcd的提交高延迟。这一次,我们注意到kube-apiservers从etcd上读取了超过500MB/s。我们设置了Prometheus来监视apiservers,还设置了--audit-log-path和--audit-log-maxbackup标志,以便在apiserver上启用更多的日志记录。这就出现了一些缓慢的查询和对事件列表API的过度调用。

根本原因:Fluentd和Datadog监控进程的默认设置是从集群中的每个节点查询apiservers(例如,现在已解决的问题[2])。 我们只是简单地改变了这些调用的过程,使apiservers的负载变得稳定。

etcd出口从500MB / s 下降到几乎为0(上图中的负值表示出口)

另一个有用的调整是将Kubernetes事件存储在一个单独的etcd集群中,以便事件创建中的峰值不会影响主要etcd实例的性能。 要做到这一点,我们只需将--etcd-servers-overrides标志设置为如下所示:
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