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RSS订阅原创 轻松搞定模型训练的数据训练集和测试集
在机器学习中，将数据拆分为训练集和测试集是一个非常重要的步骤，它有助于评估模型的泛化能力，确保模型在未见过的数据上也能表现良好。
2024-05-29 10:00:27
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原创 机器学习复现案例
小分子药物通过结合微管蛋白的秋水仙碱位点来进行抗癌治疗是一个很有前景的策略。本文研究了1076种不同的抑制剂，并使用了三种机器学习方法（朴素贝叶斯、单树、随机森林）建立了468个模型，这些模型的预测准确率超过了85.12%。通过虚拟筛选，发现了化合物23g，这种新型抗癌剂对多种肿瘤细胞系（MDA-MB-231、HeLa、A549、HepG2、CNE2、HCT116）表现出显著的抑制效果。
2024-05-29 09:57:10
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原创 使用循环神经网络（RNN）对车辆轨迹数据进行建模和预测，采用长短期记忆网络（LSTM）模型
在实际应用中，可以将模型的实时预测结果进行动态展示，以实时监测车辆的运动路径和预测效果。可以将实时的车辆位置和预测的轨迹路径显示在地图上，并随着时间的推移更新显示，使用户能够实时了解车辆的行驶情况。：如果你想要一个包含来自自动驾驶汽车的大量传感器数据的数据集，用于训练和评估自动驾驶算法，那么选择 Waymo 的开放数据集可能是一个很好的选择。：如果你想要一个广泛用于自动驾驶汽车开发的数据集，包括车辆行驶轨迹、传感器数据等，那么选择 Udacity 提供的数据集可能是一个不错的选择。
2024-04-23 10:04:26
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原创 SMILES字符串的可视化过程
创建一个Jupyter Notebook文档，将代码和说明整理在一起。这个Jupyter Notebook演示了如何从SMILES字符串中绘制分子结构，并显示相应的ZINC ID。运行这个Jupyter Notebook将显示每个SMILES表示的分子结构，并打印相应的ZINC ID。2. 定义SMILES字符串和对应的ZINC ID。3. 可视化分子结构并显示ZINC ID。# 可视化SMILES表示的分子结构。
2024-04-19 11:37:16
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原创 循环神经网络模型训练药物小分子前期一些准备与建议
1. **数据获取**：- 从公共数据库（如ChEMBL、PubChem、ZINC等）或专有数据库中获取数据。这些数据库通常提供了大量的小分子化合物信息，包括其结构、生物活性等。- 你可以使用相应的数据库的网站界面或 API 来获取数据，或者下载已准备好的数据文件。2. **数据预处理**：- 去除重复项：如果数据集中存在重复的分子结构，通常需要去除重复项以避免对模型训练的影响。- 处理缺失数据：检查数据集中是否有缺失值，并根据需要进行处理。
2024-04-18 14:48:51
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原创 TensorFlow使用循环神经网络模型训练数据步骤
首先，你需要安装 TensorFlow 库。： 使用 TensorFlow 构建神经网络模型。你可以使用 TensorFlow 的高级 API，如 Keras，或者直接使用 TensorFlow 的低级 API 构建自定义模型。： 准备训练和测试数据集。你可以使用 TensorFlow 提供的数据集加载器，或者手动加载和预处理数据。： 使用准备好的数据集训练模型。通过调用模型的fit方法来训练模型，并传入训练数据和标签。： 在训练完成后，使用测试数据集评估模型的性能。通过调用模型的evaluate。
2024-04-17 16:01:23
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原创 使用 pip 安装 TensorFlow教程
如果系统返回了张量，则意味着您已成功安装 TensorFlow。这样可以确保您升级并使用 Python pip，而不是系统 pip。使用特定于 shell 的命令激活该虚拟环境：根据环境选择其中一个执行。创建一个新的虚拟环境，方法是选择 Python 解释器并创建一个。在不影响主机系统设置的情况下，在虚拟环境中安装软件包。Python 虚拟环境用于将软件包安装与系统隔离开来。系统会自动安装软件包依赖项。如果不是在虚拟环境中，请针对下面的命令使用。如果已安装这些软件包，请跳至下一步。：必须使用最新版本的。
2024-04-16 16:25:43
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原创 使用循环神经网络模型深度学习药物小分子数据库
使用循环神经网络（RNN）模型进行深度学习药物小分子数据库：确保对药物小分子数据库进行适当的数据预处理。这可能包括处理缺失数据、标准化化学结构表示形式等。：在RNN模型中，您可以选择不同的结构，如基本的RNN、长短期记忆网络（LSTM）或门控循环单元（GRU）。根据您的数据特点和任务需求，选择最合适的模型架构。：除了药物的结构表示外，还可以考虑其他特征，如药物的物理化学性质、生物活性数据等。这些特征可能会增强模型的性能。：确保使用适当的损失函数、优化器和学习率调度策略进行模型训练。
2024-04-15 10:04:10
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原创 循环神经网络（RNN）和长短期记忆网络（LSTM）
循环神经网络（RNN）和长短期记忆网络（LSTM）是用于处理序列数据的深度学习模型，它们在生物医学领域的应用非常广泛，特别是在基因组学、蛋白质结构预测、药物发现等方面。
2024-04-11 17:56:26
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原创 从分子到画面：使用Anaconda安装PyMOL的终极指南
当我们需要在生物信息学或分子生物学领域进行可视化和分析工作时，PyMOL是一个强大的工具。PyMOL是一个开源的分子可视化软件，允许用户可视化分子结构、进行蛋白质建模、分析生物分子等。本文将介绍如何使用Anaconda来下载和安装PyMOL。
2023-11-29 16:06:26
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原创 无需纠结！轻松安装PlotJuggler：Linux上的数据可视化与分析工具
PlotJuggler是一个强大的开源工具，特别适用于ROS（机器人操作系统）用户，用于可视化和分析数据。然而，有时在安装PlotJuggler时可能会遇到一些挫折，但不必担心。本篇博客将为你提供一种简单而有效的方法来在Linux上安装PlotJuggler，无需纠结于安装问题。
2023-09-27 14:34:02
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原创 自动驾驶技术：未来道路的引导者
自动驾驶是一项革命性的技术，它涉及到计算机科学、人工智能、机器学习和工程学的前沿知识。本文将带您深入了解自动驾驶技术的各个方面，从其基本原理到最新的发展趋势，以及它对我们的生活和社会所产生的深远影响。
2023-09-22 17:40:22
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空空如也
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