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原创 设置配置路径(os模块)

import os 导入操作系统 一、常见的函数列表os.sep:取代操作系统特定的路径分隔符os.name:指示你正在使用的工作平台。比如对于Windows,它是'nt',而对于Linux/Unix用户,它是'posix'。os.getcwd:得到当前工作目录,即当前python脚本工作的目录路径。os.getenv()和os.putenv:分别用来读取和设置环境变量os.listdir():返回指定目录下的所有文件和目录名os.remove(file):删除一个文件os.sta.

2021-02-14 09:10:13 1511 1

原创 生物入门必须掌握的30个Linux命令

生物入门必须掌握的30个Linux命令学习生物信息,Linux是必须掌握的内容,其实常用的Linux命令也就30个左右,而且这些命令都是单词的简写,记忆起来并不困难。这里列出了常用的30个命令。1、cdcd:Change directory修改工作目录,cd和ls应该是使用最多的两个命令,尤其是对于Linux目录结构不熟的用户。cd / #进入根目录cd - #返回上次的目录cd #返回home目录cd ~ #返回home目录cd ../ # 返回上一级目录2、lsls:L

2021-02-03 19:12:21 408

原创 数据分析-最常用pandas代码笔记

# Pandas 基本介绍# Numpy 和 Pandas 有什么不同# 如果用 python 的列表和字典来作比较, 那么可以说 Numpy 是列表形式的,没有数值标签,而 Pandas 就是字典形式。# Pandas是基于Numpy构建的,让Numpy为中心的应用变得更加简单。# 要使用pandas,首先需要了解他主要两个数据结构:Series和DataFrame。import pandas as pdimport numpy as nps = pd.Series([1,3,6,n.

2021-01-30 23:15:08 173

原创 数据分析-最常用numpy代码笔记

#numpy笔记:import numpy as np #为了方便使用numpy 采用np简写# numpy 的几种属性array = np.array([[1,2,3],[2,3,4]])#列表转化为矩阵 print(array) """ array([[1, 2, 3], [2, 3, 4]]) """print('number of dim:',array.ndim) # 维度# number of dim: 2print('shape :',array.shape) .

2021-01-30 23:13:47 206

原创 生信分析之R语言绘图整理

####################################### 第二节 #######################################data() #查看数据库class(rivers) #"numeric",plot(rivers) #散点图hist(rivers) #直方图class(state.abb) #"character"字符串pie(table(state.abb))pie(table(stat.

2021-01-25 23:57:55 2029

原创 R语言从零到进阶学习笔记(带注释)

#-------------------------------------------#Chapter 06 举个例子#-------------------------------------------#getwd() #获得当下路径setwd('/Users/marscolono/Downloads/RData') #设定路径df <- read.table("ToothGrowth.csv",sep = ",",header = T) #读取tabletable(df$supp,

2021-01-17 00:07:06 562

原创 如何在R语言中稳定安装clusterprofile

安装clusterprofiler总是报错,那我们如何安装呢?#如何在R语言中安装clusterprofile#步骤1if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocManager")BiocManager::install(version = "3.11")#步骤2if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) instal

2021-01-13 17:13:47 3714

原创 Linux你必须记住的命令总结

1、ls命令 cd /root ls #显示当前目录下所有的非隐藏文件 ls -a #显示当前目录下所有文件,包含隐藏文件 ls -l #显示当前目录下所有的非隐藏文件的详情 ls -al #显示当前目录下所有文件,包含隐藏文件 的详情 ls -lh #以列表形式显示当前目录下所有的非隐藏文件的大小(K M T) ls -alh #以列表形式显示所有文件,包含隐藏文件的文件大小(K M T) 常用的组合: ls ll #等价于 ls -l ls

2021-01-10 21:45:56 184

原创 python多进程代码举例multiprocess

**实现从‘延时摄影’文件夹中复制文件到‘test’文件夹**#!/usr/bin/env python3import osimport multiprocessingdef copy_file(file_name, source_dir ,dest_dir): #复制操作 #拼接文件路径和目标路径: source_path = source_dir+'/'+file_name dest_dir = dest_dir+'/'+file_name #打开源文件和目标文件: w

2021-01-09 13:52:33 215 2

原创 莫烦pytorch(AI)整理笔记分

**莫烦pytorch(AI)整理笔记分**自学以及交流学习—#------------------------------------------------------import torchimport numpy as npnp_data = np.arange(6).reshape((2, 3))torch_data = torch.from_numpy(np_data)tensor2array = torch_data.numpy()print( '\nnumpy

2021-01-03 13:32:51 578

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