LIDC-IDRI图像解读和预处理

最新推荐文章于 2024-05-18 12:00:20 发布
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文章标签： 肺癌 DICOM

LIDC-IDRI数据集的相关处理，值得学习！
https://www.jianshu.com/p/9c1facf70b01  点击打开链接
不过TCIA自家的downloader实在是难用，下载出错的文件，不能重新下载，而下载列表管理起来也很不方便。

虽然安装在linux上，下载地址却只能选windows本地，呵呵
如有大神看到，希望指导小弟一波，感激不尽

DICOM支持的设备类型（中英文对照）：






胸部影像诊断: https://wenku.baidu.com/view/18bec5394693daef5ef73ddb.html 胸部影像诊断

MerryYoung
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python对医学图像的基本处理_图像识别 | 使用Python对医学Dicom文件的预处理（含代码）...
weixin_39749501的博客
12-03 1352
前沿在处理医学图像时，常常会遇到以Dicom格式保存的医学图像，如CT、MRI等。Dicom文件是需要专门的软件或者通过编程，应用相应的库进行处理。为了能够更好地服务下游任务，例如分割或检测腹腔CT图像中某个病灶组织，需要先将Dicom图像进行读取，脱敏，调窗等步骤，以便于后续的编辑。本文使用python对医学Dicom文件进行相应的处理，相比于封装好的软件，笔者认为自己动手的可操作性更强。目录1...
x光肺部分割数据集_LIDC-IDRI肺结节Dicom数据集解析与总结
weixin_39922374的博客
12-18 3279
一、数据源训练数据源为LIDC-IDRI，该数据集由胸部医学图像文件(如CT、X光片)和对应的诊断结果病变标注组成。该数据是由美国国家癌症研究所(National Cancer Institute)发起收集的，目的是为了研究高危人群早期癌症检测。该数据集中，共收录了1018个研究实例。对于每个实例中的图像，都由4位经验丰富的胸部放射科医师进行两阶段的诊断标注。在第一阶段，每位医师分别独立诊断并标注...
基于LIDC-IDRI肺结节肺癌数据集的人工智能深度学习分类良性和恶性肺癌（Python 全代码）全流程解析（二）
a721867783的博客
04-14 2455
通过切片和提取，我们获取了肺癌的恶性程度评级，这些评级在1到5之间。我们将大于3的评级归类为恶性，小于3的评级归类为良性。为了让模型更好地理解这些标签，我们用1表示良性，0表示恶性，最后将标签数据转换为one-hot编码格式。这个模型的输入是来自三个不同角度的图像和对应的标签。这些矩阵随后被堆叠，并放入一个列表中，以便于深度学习模型的读取和处理。该函数会返回模型的结构以及模型训练的记录信息。模型的评估我们首先使用了，分类模型训练的损失函数和准确率来评估模型的训练过程。之后我们还会介绍模型的评估的其他指标。
Matlab肺结节分割源程序，基于LIDC-IDRI数据集，使用传统方法，带GUI界面，可视化标注，评价分割效果
最新发布
mEgMqpFtLGde的博客
05-18 387
总的来说，本文围绕Matlab肺结节分割(肺结节提取)源程序展开，并详细介绍了使用传统图像分割方法，在LIDC-IDRI数据集上进行肺结节分割的工作流程。通过本文的介绍，读者可以了解到如何实现肺结节的分割，并通过IOU、DICE和PRE三个参数来评价分割效果的好坏。通过这些方法的组合使用，我们能够消除图像中的噪声、增强肺结节的边缘特征，并使得分割结果更加准确。接下来是肺结节分割的关键步骤。这一步骤基于阈值分割的方法，通过设定合适的阈值，我们可以将肺质与背景分割开来，为后续的肺结节分割提供清晰的图像。
LIDC数据集XML标注信息的介绍+处理
yuzeyuan12的博客
03-09 2813
LIDC数据集共有1012例数据（CT数据文件类型为Dicom），这里不讲Dicom的数据读取，只介绍XML标注文件及处理方法。 每例数据下面有两个文件夹，其中一个文件夹是侧面的CT（里面大概只有1-2个文件），一般不采用这个文件夹中的数据参与训练；另一个文件是肺尖——肺底方向的横向切片，为全肺切片。 文件夹中包含一个标注信息文件，（一般命名为 XXX.xml），XML中包含大量的标注信息。接下来对这部分标注信息进行介绍及给出相关处理代码。 标注信息包含三类：<unblindedReadNodu
TCIA (The Cancer Imaging Archive)--医学影像数据集
qq_44896301的博客
11-21 6819
TCIA (The Cancer Imaging Archive)：是一个包含常见肿瘤（肺癌、前列腺癌等）医学图像及相应临床信息（治疗方案细节、基因、病理等）的大规模公用数据库，其影像模态包括MRI、CT等，图像格式均为DICOM，并且网站内数据在持续增加。它是癌症研究的医学图像的开放获取数据库。大多数数据包括以DICOM格式存储的CT，MRI和核医学（例如PET）图像，但也提供或链接许多其他类型的支持数据，以增强研究效用。-----------------（这个医学影像数据集列表已经找好了，放在u盘里）
利用深度学习对医学CT图像（LIDC-IDRI）中的肺结节进行良恶性判断
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From Zero to Hero
03-29 3万+
肺癌是最常见的癌症，目前，CT可用于帮助医生在早期阶段检测肺癌。 在许多情况下，识别肺癌的诊断取决于医生的经验，这可能会忽略一些患者并导致一些问题。 在许多医学影像诊断领域，深度学习已被证明是一种流行且有效的方法。 本文主要基于LIDC-IDRI这一公开数据集，对其进行了肺结节的提取，并利用CNN对其分类训练，从而辅助医生作出判断。 由于篇幅较长，将分为2篇博客，这篇主要介绍数据处理，即肺结节的提...
LIDC-IDRI.rar
05-05
LIDC-IDRI数据集由胸部医学图像文件(如CT、X光片)和对应的诊断结果病变标注组成。该数据是由美国国家癌症研究所(National Cancer Institute)发起收集，该数据集中，共收录了1018个研究实例。对于每个实例中的图像，...
TCIA_LIDC-IDRI_02_24_2020.tcia
04-14
这是一个lidc数据集的原文件，想给没有下载途径的朋友，欢迎大家下载使用，希望对大家的研究学习有帮助。|
LIDC-IDRI-Semantic-Processing:用于从LIDC-IDRI创建DICOM数据的语义标签图的管道
04-08
LIDC-IDRI-语义处理 用于从LIDC-IDRI创建DICOM数据的语义标签图的管道。
LIDC-IDRI数据集
03-26
LIDC-IDRI原数据集处理太麻烦了，下载感觉都比较费劲；（github有个代码可以处理获得比较精确的mask，但是本身LIDC-IDRI原数据集就很大，下载感觉有些费事，所以也就没去尝试） LUNA16数据集我根据网上DSB tutorial...
lidc 肺结节 CT 数据集 工具包
04-09
lidc 数据集 工具包。提取lidc数据集中的注解文档，然后在DICOM数据中获取到肺结节病灶
LIDC_IDRI肺结节.rar
03-07
基于原始dcm数据（100多G），根据良恶性程度（1-5） 利用matlab分割出肺结节图片数据（jpg），可以用于后续的分类检测，除此之外，还包括分割好的肺实质图片和xml，可用于检测
LIDC-IDRI数据集处理--相关资料
qq_39319907的博客
01-05 4681
LIDC-IDRI肺结节Dicom数据集解析与总结 LIDC-IDRI肺结节公开数据集Dicom和XML标注详解
LIDC数据集肺区分割
dgh_dean的博客
02-27 7472
在使用LIDC数据集做肺结节检测时对肺区进行分割后效果会好很多，主要是减少肺区以外的组织对检测的干扰。 方法比较简单： 首先是阈值分割，设置CT值为480HU作为阈值对CT图像进行分割，得到二值图像，然后使用flood fill填充方法对肺区以外的部分进行填充，接下来使用形态学方法腐蚀掉肺区中的残余部分，最终将得到的结果作为掩模与原图像叠加得到肺区图像。 MATLAB代码： d
LIDC-IDRI肺结节数据集xml解释及读取
sunyao_123的博客
05-24 1万+
LIDC-IDRI 链接 这篇博客也有介绍 下边介绍该数据集的xml格式及用python读取.xml_path = ‘xml说明文件绝对路径’ with open(xml_path, 'r') as xml_file: markup = xml_file.read() xml = BeautifulSoup(markup, features="xml")使用 Beaut
医学图像数据集和处理工具【总结】
weixin_34352449的博客
10-21 1164
一 数据集http://brainweb.bic.mni.mcgill.ca/brainweb/ BrainWeb:Simulated Brain Databasehttp://brainweb.bic.mni.mcgill.ca/brainweb/selection_ms.html MRI datasets（上面的一部分）adni.loni.ucla.eduAlzheim...
LIDC-IDRI肺结节公开数据集Dicom和XML标注详解
jessican_uestc的博客
10-12 2万+
LIDC-IDRI肺结节公开数据集Dicom和XML标注详解  字数统计: 4,209字   |    阅读时长: 21分   Medical Image1 Dicom LIDC Xml 文章首发于简书：LIDC-IDRI肺结节公开数据集Dicom和XML标注详解，现在搬运至博客。 一、数据来源 　　数据集采用为 LIDC-IDRI (The Lung Image Database...
DeepLearning | Zero shot learning 零样本学习AWA2 图像数据集预处理
冯良骏 的 博客
12-23 1万+
因为有打算想要写一组关于零样本学习算法的博客，需要用到AWA2数据集作为demo演示 之前想只展示算法部分的代码就好了，但是如果只展示算法部分的代码可能不方便初学者复现，所以这里把我数据预处理的方法也说一下，博客的最后会给一个处理好的数据下载地址，之后的博客都会利用该博客的方法作为数据预处理 我会对AWA2数据集做一个详细的介绍，对数据集有一个好的理解本身也有助于算法的学习和实现 AWA2 图像数...
lidc-idri数据预处理
08-22
预处理LIDC-IDRI数据集需要将原始的胸部医学图像文件（.dcm）转换为常用的图像格式，如JPEG或PNG。这可以通过使用图像处理软件或库，例如MicroDicom viewer，对原始图像进行批量转换来实现。在转换过程中，需要注意保持图像质量和分辨率的稳定性。转换后的图像可以作为训练数据输入到神经网络等模型中进行进一步的分析和处理。总之，LIDC-IDRI数据集的预处理包括将.dcm文件转换为常用图像格式，并确保图像质量和分辨率的稳定性。<span class="em">1</span><span class="em">2</span><span class="em">3</span> #### 引用[.reference_title] - *1* [LIDC-IDRI.rar](https://download.csdn.net/download/aristocles118/12390876)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v93^chatsearchT3_2"}}] [.reference_item style="max-width: 50%"] - *2* *3* [利用深度学习对医学CT图像（LIDC-IDRI）中的肺结节进行良恶性判断](https://blog.csdn.net/bluesliuf/article/details/88900809)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v93^chatsearchT3_2"}}] [.reference_item style="max-width: 50%"] [ .reference_list ]

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