和鲸101计划:解读BrainPy,数字化大脑计算基建

导读:

2023 和鲸社区年度科研闭门会以“对话 AI for Science 先行者,如何抓住科研范式新机遇”为主题,邀请了多个领域的专家学者共同探讨人工智能在各自领域的发展现状与未来趋势。

在脑科学领域,数字化大脑通过数学模型和计算机仿真对大脑进行精确的建模和重构,可以更好地理解和探索大脑的神经活动和功能。

以《BrainPy:迈向数字化大脑的计算基础设施》为题,来自北京大学心理与认知科学学院博士后王超名,介绍了为大尺度脑动力学建模提供计算基础设施的 BrainPy 项目,可弥补现有国内外软件存在的一系列问题,包括容纳最新的 AI 编译方法、兼容 AI 训练算法、提供独特的稀疏与事件驱动算子、多尺度建模范式、大尺度建模算法,帮助大脑研究者进行高效的大脑建模和模拟。


分享嘉宾|王超名

北京大学心理与认知科学学院博士后

北京大学博雅博士后,北京大学理学博士,研究领域为计算认知神经科学与大尺度脑仿真,合作导师为北京大学心理与认知科学学院吴思教授。开发的通用脑动力学编程框架 BrainPy,三年内下载量突破十万次,广泛应用于国内外脑动力学建模。研究成果近期发表于 eLife、frontiers 等杂志。荣获北京大学优秀毕业生、北京大学校长奖学金、国奖奖学金等荣誉。

01 数字化大脑的进展与关键技术挑战

数字化大脑一直是全人类很重要的一个梦想。

假如能实现大脑数字化,人类就能去开展很多很重要的研究,比如可以基于虚拟大脑分析大脑认知功能的机理、进行个性化脑疾病的诊断或治疗,支持更 powerful 的类脑人工智能,或者推动脑机接口研究的发展。

我们自己认为,在未来的 5-10 年内,数字化大脑会迎来革命性的突破,主要原因就是数据的爆发式增长和技术的快速发展。

一方面,全球主要的经济体都在开展脑计划。比如 2005 年开始,瑞士洛桑理工学院的科学家 Henry Markman 推动了蓝脑计划,通过计算机重构仿真的方式去模拟大脑;后面欧洲、美国、日本都推出了他们自己的脑计划,并且都是重大投资;中国在 2021 年也推出了我们自己的脑计划。

随着脑计划的发展,我们在各个尺度都有很多数据的积累,包括像 Nature 、 Science 这种期刊也有一些专栏报道目前脑计划的进展。以现在最新的全脑连接组为例, 2019 年, Nature 上发表了一篇线虫连接组的文章,我们已经能够去拿到几百个神经元的全脑连接组;然后在今年,Science 上有关于果蝇全脑连接组的文章,已经能拿到十几万神经元的全脑的精细连接;像我们合作的实验室——上海神经所,他们也有斑马鱼全脑连接组,期望是在明年能够推出。另外,今年各个重要的 AI 机构或研究机构,像艾伦研究所、Google,都分别启动了小鼠或猕猴的脑连接图谱项目。

随着数据爆发式地增长,我们接下来要做的事情就是去做全脑的

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