程序设计实习2015年期末考试 E.DNA(状态压缩dp+特殊处理+预处理)

最新推荐文章于 2019-07-12 18:25:34 发布

pku_zzy

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分类专栏： Algorithm

本文链接：https://blog.csdn.net/PKU_ZZY/article/details/51648392

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该博客讨论了一道程序设计实习题目，涉及DNA单链的最短长度计算。通过状态压缩动态规划解决，同时需要特殊处理和预处理来确保正确性。作者在遇到困难后反思并找到了解决问题的关键，即判断新基因片段是否被前面的片段包含，避免错误的组合。

摘要由CSDN通过智能技术生成

程序设计实习2015年期末考试 E.DNA(状态压缩+特殊处理+预处理)
总时间限制: 6000ms 内存限制: 1024kB

描述
考虑一段DNA单链，上面有N个基因片段。这里的基因片段可重叠（例如AGCTC包含AGC和CTC），不可倒置（例如AGCTC不包含TCG）。要问这样的单链最短长度是多少。

输入
输入的第一行是一个正整数T（不超过13），表示数据组数。每组数据若干行，其中第一行一个正整数N（不超过9），表示基因片段的数目，接下来N行每行一个基因片段，由AGCT四个字母组成，且长度介于1和15之间（含两端）。

输出
每组数据输出一样，表示最短的单链长度包含这N个基因片段。

样例输入

1
5
TCGG
GCAG
CCGC
GATC
ATCG

样例输出

11

这个题一看到就想到状态压缩dp，但是光组成状态这一个维度是不够的，因为同一个状态由于排列不同添加一个DNA片段代价不一样，所以我第一反应添加了另外一个维度——结尾的字符串。但是WA，当时想到一个问题，万一最后一个DNA片段长得一个片段解决不了要多个呢，那么这个状态压缩岂不是得改成dfs了，心凉了半截，改为dfs，TLE。陷入了死胡同。
其实，我之所以状态压缩也许只是我觉得似乎是状态压缩，并没有自己的思考，我连上一个问题都没想明白就开始写，就算对了也是瞎蒙的。痛定思痛想了想，想明白了这个问题：
如果在ABC这个串后面加了一个D，D在BC内是一个子片段，虽然算不出正确结果，但是由于必然计算过AB+D+C=ABC这一形式的状态压缩dp局部解，所以ABC+D这个错误解答不会影响。但是，如果D是C的一个子片段，那么问题就很产生了，为了避免这个错误，要特殊处理，读入一个片段后判断是否被前面的串包含，包含则删去，这样算法才具有了正确性。
特殊处理后本题算法就有了正确性保证，预处理dis[i][j]表示i后接上j可以重叠长度。一个小技巧，合理调用< string.h>内的库函数strstr()可以节省查找子串代码量，性能也不差。