利用量子计算之力，加速药物发现

 

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传统药物的研发相当耗时，发现新的分子先导物的前置时间平均长达48个月。富士通希望利用量子计算的能力来加速这一进程，并认识到这需要与药物行业专家合作。

通过Polaris，它将富士通的数字退火器与Polaris的量子力学和分子力学（QM/MM）模拟相结合，以扩大可搜索化学空间的大小。 

关于客户：Polaris是一家初创企业，旨在通过快速创建所有人类蛋白质、疾病途径、基因突变和病原体的药物蓝图，促进全球健康。该公司将量子计算、人工智能和精准医学的力量结合在一起，研究化学空间，以创造针对特定蛋白质和疾病的新型分子药物。

挑战：利用量子计算、机器学习和QM/MM加速药物发现过程，以对抗疾病。
解决方案：将富士通的Digital Annealer与Polaris的化学和机器学习算法的平台相结合，以加速药物发现。 “我们在化学和机器学习方面的专业知识，加上富士通的技术和经验，意味着我们可以迅速识别可行分子。”——Polaris创始人兼CEO Shahar Keinan

揭开病毒的秘密

在2019冠状病毒病(COVID-19)大流行期间，人们痛苦地意识到，新药的开发不仅非常昂贵，而且非常耗时。如果新药未能获得政府卫生机构的市场批准，就会产生很高的商业风险。如果能够同时提高药物研发的速度和准确性，那么开发新药物以对抗新型病毒大流行的能力就会大大提高。

 

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致病病原体通常含有负责传播感染的特定蛋白质，阻断这些蛋白质是阻止疾病的关键。药物发现过程的早期阶段包括识别小分子，这些小分子可以通过与这些蛋白质结合来阻止它们。

然而，要评估的分子数量几乎是无限的，而只有一小部分分子会与蛋白质结合——找到正确的分子就像在整个星系中寻找一颗恒星。目前的数据库搜索解决方案只能审查多达数千万个分子，而现有的过程至少需要两年时间。

“传统方法需要筛选数千个候选分子，以确定哪些可能适合测试，而我们可以通过采用化学、机器学习算法以及量子计算等新技术，在更短的时间内筛选数万亿分子。”Polaris的创始人兼CEO Shahar Keinan解释道，“然而，全面转向量子计算目前还不够成熟，因此我们需要找到具有合适能力的合作伙伴，这使我们通过Sia partners的医疗团队引入了富士通。”

富士通与Sia Partners合作，利用其量子启发的数字退火机进行商业应用。Polaris代表了一个初创企业的完美例子，它提供了与富士通互补的技能和技术，使其中每一方都能以敏捷和高效的方式合作。

Sia Partners高级经理马修·瓦林(Matthieu Vallin)表示:“就像一些更灵活的企业一样，富士通正在改变，它不需要在企业内部建立一切。”“我们建议富士通与合适的合作伙伴一起进入市场，放弃自建整个业务生态的想法。与初创企业合作，比在公司内部从零开始更能快速进入新市场。”

加快了拯救生命的疗法进入市场的时间

 

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作为新药物发现平台的第一个试点，Polaris和富士通专注于登革热治疗药物，该疾病每年感染1亿人，造成2.2万人死亡。富士通和Polaris的解决方案在历史上需要花费数年的时间，现在只需几天就能审查数万亿个分子，比传统方式加速了10000倍，这成功将药物开发第一阶段的时间从24个月以上缩短到8个月。最近，该技术被应用于COVID-19药物的研发。

富士通创新与医疗总监Patrick Stephenson表示:“通过对Polaris采取开放创新的方式，我们已经能够激活现有的药物研发市场，并建立基于信任的可持续合作关系。”“富士通和Polaris之间的紧密关系和共同目标使双方的合作保持在正轨上——每天的虚拟会议，使双方在交付项目成果方面保持协调一致。”

Keinan解释道:“我们在化学和机器学习方面的专业知识，加上富士通在解决商业挑战方面的技术和经验，意味着我们可以有效地加快研究进程，更快地识别可行分子。”

利用量子启发分析平台来应对复杂性

富士通的量子启发数字退火器是药物发现平台的核心，它使用一个量子启发的经典数字电路架构，来解决复杂的组合优化问题。它比目前其他可用的替代方法快1万倍，而且没有目前阶段的量子计算方法所需的额外复杂技术和成本。

该平台从一个包含数万亿个分子的虚拟数据库中识别出可行的分子，并评估它们的质量。利用药物靶标的结构信息和一套物理化学约束条件对先导物进行评估。然后，利用Polaris机器学习算法对输出进行优化和排序，以获得目标分子的物理化学性质，并通过QM/MM模拟获得该分子与受体蛋白的绑定亲和性。在7周内，该平台就生成了一份最终的高质量分子列表，优先用于合成和体外测试。

Keinan总结道:“我们与富士通的合作展示了下一代技术如何改变医学等关键科学，提高我们消除疾病的潜力。”“我们相信，这种灵活的方法将改变我们治疗疾病的方式，并导致根除登革热等常见的致命病毒。通过共同努力，我们可以对人类产生真正积极的影响，并为更健康的社会作出贡献。”

编译：王珩

编辑：慕一