基于conda的geopandas 的安装和使用笔记

镜像准备

将镜像源替换为国内镜像，可大幅度提升python包的下载速度

• pip国内镜像
  • 在用户文件夹下新建pip文件夹，在pip文件夹中新建txt文件，将下面代码复制进去，并重命名为pip.ini

[global]
index-url = https://pypi.douban.com/simple
[install]
trusted-host=pypi.douban.com
timeout = 150

• conda国内镜像
  • 直接在用户文件夹下新建txt文件，将下面代码复制进去，并重命名为.condarc

channels:
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/msys2/
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/pytorch/
show_channel_urls: true
always_yes: true
ssl_verify: true

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anaconda虚拟环境管理技巧

• 查看环境

conda env list

• 查看所在环境中的包

conda list

• 安装/卸载包

conda install 包名称 # conda找不到时 可以用pip install
conda uninstall 包名称 # 卸载包时也会卸载对应的依赖包

• 新建虚拟环境

conda create -n 环境名 python=3.7.6 # -n是指name, 也可用--name，python为可选项

• 克隆虚拟环境

conda create -n 新环境名 --clone 原环境名

• 删除虚拟环境

conda remove -n 环境名  --all

• 导出虚拟环境

activate 环境名
conda env export > 文件名.yaml

• 导入虚拟环境

conda env create -f 文件名.yaml

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安装geopandas

本文的按装方法是直接安装geopandas的开发环境，这样避免了直接通过conda install geopandas导致部分包不兼容的问题，避免了没必要的报错。

• 将下面代码保存为environment.yml文件

name: geopandas-dev
channels:
  - https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/menpo/
  - https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
  - https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/msys2/
  - https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
  - https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
  - https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
dependencies:
    - python==3.8.2
    # required
    - fiona>=1.8.21
    - pandas>=1.3.0
    - pyproj>=2.6.1
    - shapely>=1.8.0

    # geodatabase access
    - psycopg2>=2.5.1
    - SQLAlchemy>=1.3.12

    # geocoding
    - geopy

    # plotting
    - descartes>=1.0
    - matplotlib>=3.2.0

    # spatial access methods
    - rtree>=0.9.7

• 通过本地yml文件创建环境，文件夹中的environment.yml文件应该是开发环境，安装出来的环境名称为geopandas-dev，如果出现HTTPERROR，右键-打开方式-记事本（或任何一种编辑软件如notepad++），将channels部分更改为上面的conda国内镜像

conda env create -f environment.yml

• 切换到安装好的环境geopandas-dev并安装一下geopandas（安装的环境是开发用的环境，是没有geopandas的，需要手动安装一下）

activate geopandas-dev
# conda install geopandas
pip install geopandas==0.10.2

• 安装ipykernel（用于在jupyter中切换环境）

python3.8及以下可安装nb_conda

conda install ipykernel

• 在base环境安装ipykernel（防止从Anaconda的快捷方式中启动jupyter notebook时不能切换环境）

python3.8及以下可安装nb_conda

activate base
conda install ipykernel

• 克隆一份环境，原来的名字太长了，改个短一点的叫做gs，环境是没有rename的功能的，想改名称只能克隆一份，然后把原来的删掉

conda create -n gs --clone geopandas-dev

• 激活/退出环境，环境之间切换是不用退出的，直接激活另一个就可以，所以退出环境的功能基本上用不着

activete gs
conda deactivate

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虚拟环境的使用

在命令行里使用虚拟环境

activate gs  # 激活虚拟环境gs
python xxxx.py

bat文件通过conda环境运行

• bat文件运行脚本内容：

ECHO Running Admin shell
call C:\ProgramData\Anaconda3\Scripts\activate.bat gs
python XXXX.py  # 如果在运行后不想自动关闭窗口加上参数 -i  即：`python -i xxxx.py`

上面的三行分别为：

1. 启动shell
2. 切换到名为‘gs’的环境，注：写正确anaconda文件夹中的activate.bat的路径
3. 运行 XXXX.py的python脚本

在pycharm使用conda环境

conda env list可以查看环境所在的位置

λ conda env list
#conda environments:

base                  *  C:\ProgramData\Anaconda3
geopandas-dev            C:\ProgramData\Anaconda3\envs\geopandas-dev
gis                      C:\ProgramData\Anaconda3\envs\gis
gs                       C:\ProgramData\Anaconda3\envs\gs
py36                     C:\ProgramData\Anaconda3\envs\py36

打开Pycharm的设置页面：
file–setting–project–齿轮–add（如图所示）

conda environment – existing environment – 三个点

输入环境路径，选择python.exe

在jupyter里使用conda环境

• 在jupyter notebook中切换虚拟环境
  切换到要使用的虚拟环境，并安装ipykernel，该操作在每个环境里只需要运行一次

python3.8及以下可安装nb_conda

activate 环境名
conda install ipykernel

• 在jupyter新建脚本时即可选择环境：
  
• 代码中也可以切换环境：
  
• 小技巧：通过桌面图标运行jupyter notebook
  新建文本文件，保存以下代码：

ECHO Running Admin shell
start jupyter notebook

将后缀改为.bat，双击运行即可
如果base环境有问题，要通过虚拟环境来运行，可以加一行

ECHO Running Admin shell
call C:\ProgramData\Anaconda3\Scripts\activate.bat gs
start jupyter notebook

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未完待续