Ubuntu下MPICH、Docker、SSH免密配置

今天上课开始搭建实验环境，真是遇到各种坑，正好要整理实验报告，就顺便理理思路，创建一个新的用户再来实现一遍吧。

操作系统：Ubuntu 14.04

首先创建了一个新的用户

1、安装MPICH

MPI参考文章

（1）到官网下载安装包并解压

tar mpich-3.2.1.tar.gz

（2）进入解压文件夹中的mpich-3.2.1文件夹，执行以下命令

./configure --prefix=/home/lxt/mpich --disable-fortran

其中/home/lxt/mpich文件夹是在用户目录下

（3）编译和安装（时间较长）

make
make install

没有报错即可。

（4）修改环境变量

vim ~/.bashrc

在.bashrc文件的末尾添加：

export PATH=/home/zxy_lxt/mpich/bin:$PATH

使之生效

source ~/.bashrc

（5）写个测试用例测试一下配置是否成功

#include <stdio.h>
#include <mpi.h>
int main(int argc, char** argv){
	MPI_Init(&argc,&argv);
	printf("Hello world.\n");
	MPI_Finalize();
	return 0;
}

使用mpi命令编译和运行

2、安装Docker，并运行Ubuntu镜像

参考文章：安装docker

（1）更新apt包索引

sudo apt-get update

（2）安装以下包以使apt可以通过HTTPS使用存储库（repository）：

sudo apt-get install -y apt-transport-https ca-certificates curl software-properties-common

（3）添加Docker的GPG密钥：

curl -fsSL http://mirrors.aliyun.com/docker-ce/linux/ubuntu/gpg | sudo apt-key add -

（4）使用下面的命令来设置stable存储库：

sudo add-apt-repository "deb [arch=amd64] http://mirrors.aliyun.com/docker-ce/linux/ubuntu $(lsb_release -cs) stable"

（5）再更新一下apt包索引

sudo apt-get update

（6）安装最新版本的Docker CE：

sudo apt-get install -y docker-ce

（7）查看安装的docker版本

docker --version

（8）运行docker

sudo service docker start

（9）检查docker运行状态

sudo service docker status

由于docker只能用root用户权限进行操作，或者使用sudo命令暂时借用root权限，所以在此提供一种免sudo得方法：

sudo usermod -aG docker $USER

将当前用户添加到docker用户组中，docker用户组中的所有用户均有特权使用docker服务。

（10）启动dcoker可以运行其自带的hello-world程序：  

sudo docker run hello-world

（11）添加ubuntu镜像

sudo docker pull ubuntu

这一步比较慢，因为是从官网上下载镜像，失败一般是网络问题，多次尝试或者更改镜像仓库即可（其它仓库下载时需要指定完整的仓库注册服务器地址）

sudo docker pull dl.dockerpool.com:5000/ubuntu

（12）使用镜像

完成上述步骤后，即可随时使用该镜像了，例如创建一个容器，让其中运行 bash 应用。

sudo docker run -t -i ubuntu /bin/bash

3、配置SSH免密登录服务器

SSH免密登录参考文章