Tetgen软件学习和使用

最新推荐文章于 2024-06-16 10:15:41 发布
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本文链接：https://blog.csdn.net/Shrekul/article/details/108597008
版权

Tetgen剖分四面体网格学习

Tetgen安装

以下用到的所有安装包下载链接

Windows系统下安装

1.下载好tetgen的源代码

从CSDN链接或者官网连接直接下载即可。

2. 进行源代码编译

我使用的是Visual Studio 2013进行的编译，操作如下：
用VS2013进行源代码编译教程
添加好下载的源码，如下图所示：
用VS2013进行源代码编译教程
然后点击项目名称右键，选择如下图所示的操作，添加_CRT_SECURE_NO_WARNINGS，就可以进行编译了，不然会报错。
用VS2013进行源代码编译教程
编译好后，会生成tetgen.exe文件，如下图：
用VS2013进行源代码编译教程
上面这些做好就可以使用了这个tetgen.exe 进行操作了。

Ubuntu操作系统下进行安装

在终端直接一条命令就可以：

sudo apt install tetgen

ubuntu系统和wsl子系统下安装tetgen

TetGen简单使用

1. Windows操作系统下使用

用管理员命令打开PowerShell:

Wndows下TetGen使用教程
运行如下两行代码：

cd D:\tetgen\
.\tetgen.exe -p example.poly

其结果如下：

Opening example.poly.
Delaunizing vertices...
Delaunay seconds:  0
Creating surface mesh ...
Surface mesh seconds:  0.001
Constrained Delaunay...
Constrained Delaunay seconds:  0
Removing exterior tetrahedra ...
Exterior tets removal seconds:  0
Optimizing mesh...
Optimization seconds:  0

Writing example.1.node.
Writing example.1.ele.
Writing example.1.face.
Writing example.1.edge.

Output seconds:  0.004
Total running seconds:  0.005

Statistics:

  Input points: 28
  Input facets: 23
  Input segments: 44
  Input holes: 2
  Input regions: 2

  Mesh points: 28
  Mesh tetrahedra: 68
  Mesh faces: 160
  Mesh faces on facets: 50
  Mesh edges on segments: 44

Wndows下TetGen使用教程

2. Ubuntu操作系统下使用

切换到example所在的目录，输入命令行：

tetgen -p example.poly

结果如下：

Opening example.poly.
Delaunizing vertices...
Delaunay seconds:  0
Creating surface mesh ...
Surface mesh seconds:  0
Constrained Delaunay...
Constrained Delaunay seconds:  0
Removing exterior tetrahedra ...
Exterior tets removal seconds:  0
Optimizing mesh...
Optimization seconds:  0

Writing example.1.node.
Writing example.1.ele.
Writing example.1.face.
Writing example.1.edge.

Output seconds:  0
Total running seconds:  0

Statistics:

  Input points: 28
  Input facets: 23
  Input segments: 44
  Input holes: 2
  Input regions: 2

  Mesh points: 28
  Mesh tetrahedra: 68
  Mesh faces: 160
  Mesh faces on facets: 50
  Mesh edges on segments: 44

Ubuntu操作系统下使用

3. 文件在Windows下用Tetview打开

命令行操作如下：

.\tetview-win.exe example.1.ele

效果是这样的：
Windows下使用tetview

TetGen详细操作

TetGen文件格式说明

下表列出TetGen使用的所有格式。所有文件都是ASCII码形式，可能包含有以#为前缀的
注释。点，四面体，面，洞和最小体积约束编号必须是连贯的，开始编号为1或者0。然而，
所有的输入文件必须是一致的。当读.node（.poly,.smesh）时，TetGen自动检测你选择的文
件。当其他程序调用TetGen时，如果你想要对象的编码从0开始，那么使用-z命令。

文件类型输入或者输出属性
.nodeinput/output节点列表文件
.polyinputPLC.
.smeshinput/outputPLC.
.eleinput/output四面体文件
.faceinput/output三角形面文件
.edgeinput/output边界
.volinput最大体积列表
.varinput约束列表
.neighoutputA list of neighbors

1. .node文件

第一行：<点个数><维数(3)><属性个数><边界标识(0或者1)>
剩下的行为点列表：
<点编号><x><y><z>[属性][边界标识]

例如：

   158373  3  0  1  #表示有158373个点，维数是三维，属性个数为0，边界标识为1
   1    -10000  -10000  -10000    1   # 表示点号为1，三维坐标是(-10000,-10000,-10000)，边界标识是1
   2    -10000  10000  -10000    1
   3    10000  10000  -10000    1
   4    10000  -10000  -10000    1
   5    -10000  -10000  10000    1
   6    -10000  10000  10000    1
   7    10000  10000  10000    1
   8    10000  -10000  10000    1
   9    -10000  -10000  0    1
  10    -10000  10000  0    1
  • 属性为与点关联的浮点型物理量值(例如：质量、导电性等)，并不加修改的复制到格网中。如果-p,-q,-a或者-i是选择的，每个Steiner点添加到格网中默认属性值为0。
  • 如果指明了’-w’(权重Delaunay四面体剖分)项，第一个属性为相应点的权重。
  • 如果第一行的第四部分值为1，文件中最后一列为边界标识。边界标识用于识别边界点(点在PLC面上)，除了TetGen禁用了-B了开关，否则TetGen生成的.node文件包含边界标识。

边界标识在输出文件.node文件是选择如下：

  • 如果在输入文件中点指定了非零边界标识，那么它在输出文件中将有相同的标识。
  • 另外，如果节点在PLC表面上带有一个非零边界标识，那么这个表面上的节点将指定相同的标识。如果节点在若干的表面上，节点的边界标识在这些表面标识中任意选择。
  • 如果节点在格网的边界上，那么节点的标识指定为1。
  • 其他点分配标识为0
  • TetGen可以决定那些点在边界上，输入边界标识为0(或者没有使用标识)将结果在输出所有点的边界标识为1。

2. .poly文件

  • 一个.poly文件表示一个PLC(piecewise linear complex [分段线性复合体])作为附加信息。尽管这儿没有限制PLC的表面TetGen需要PLC表示的完整的面边界格网范围。
  • .poly文件格式包含了四部分，点列表，面列表，洞(体)点集列表和范围属性列表。前三部分是必须的，第四部分是可选的。

这四部分详细描述如下:

  1. 节点列表 所有节点的列表和它与.node具有完全相同的个数。<点个数>可以设置为0，指明这些点集存放在分离的.node文件中。

    第一行: <点个数> <维数 (3)> <属性个数> <边界标识 (0 or 1)>
下面为点的列表:
<点编号> <x> <y> <z> [属性] [边界标识]
...

  2. 面列表 每个面包含一个共面直线图(PSLG, planar straight line graph)，它是一个可以包含线段，单点和洞的多边形。多边形(polygons)列表包含面。每个多边形有n个角点，n≥1。它可以退化，当n=1时表示点，当n=2时表示线段。格式如下：

    某一行: <多边形个数s> [洞个数] [边界标识]
下面是多边形列表：
<角点个数> <角点 1> <角点 2> ... <角点 #>
...
下面是洞列表
<洞编号> <x> <y> <z>
...

 ```shell
 # poly文件示例
 # Part 1 - node list 第一部分：点列表
 # node count, 3 dim , no attribute, no boundary marker
 256	3	0	0
 1	36.0	0.0	0
 2	35.95663642338621	1.7664362757870484	0
 3	35.82665016019909	3.528617051864182	0
 4	35.61035435873212	5.282297080393023	0
 5	35.308270094516296	7.023251592580617	0
 6	34.92112511500358	8.7472864765175	0
 7	34.44985208635952	10.450248381160645	0
 8	33.89558634658875	12.128034722119923	0
 9	33.25966317040632	13.776603565143231	0
 10	32.54361455244396	15.391983363490155	0
 11	31.74916551654078	16.970282525735914	0
 ...
 # Part 2 - face list  第二部分：面列表
 130	1  # 面个数  有边界标识
 # facet count, boundary marker
 1	0	1  # 一个多边形，没有洞，边界标识1， 下面是这么多点构成的一个圆柱面
 128	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	18	19	20	21	22	23	24	25	         26	27	28	29	30	31	32	33	34	35	36	37	38	39	40	41	42	43	44	45	46	47	48	49	50	51	52	53	54	55	56	57	58	59	60	61	62	63	64	65	66	67	68	69	70	71	72	73	74	75	76	77	78	79	80	81	82	83	84	85	86	87	88	89	90	91	92	93	94	95	96	97	98	99	100	101	102	103	104	105	106	107	108	109	110	111	112	113	114	115	116	117	118	119	120	121	122	123	124	125	126	127	128	
 1	0	4  # 一个多边形，没有洞，边界标识4
 4	1	2	130	129  # 4个点(1,2,130,129)构成的面
 1	0	4
 4	2	3	131	130
 1	0	4
 4	3	4	132	131
 1	0	4
 4	4	5	133	132
 1	0	4
 4	5	6	134	133
...

下图就是该文件的具体图例
在这里插入图片描述

3. .smesh文件

4. .ele文件

5. .face文件

    # face文件示例
    8800  1   # 8800个面，没有洞，有边界标识
    1   2595  1194  2593    4  # 第一个面  三个节点组成  边界标识为4
    2   1908  1210  1906    4
    3   1203  2595  2597    4
    4    427   429  2335    4
    5     57  4340  5196    1
    6   3345  1714  3347    4
    7    648  2622  3220    1
    8   1338   582   581    4
    9    471  3845  3846    4
    ...

6. .edge文件

7. .vol文件

8. mtr文件

9. var文件

10. .neigh文件

Tetgen生成输入文件程序例子

  • 看了前面这么多介绍，可能大家还是不怎么会生成自己的模型文件，这里给出一个生成自己模型文件的python程序，大家可以按照自己的需要来修改。
import os
import sys
import time
import math
import numpy as np

nn=4
dlz = [0 for col in range(nn)]
dlz=[20000, 2000, 10000, 20000]
dlx=40000
dly=40000
sumdlz=sum(dlz)

print('The length of the cuboid %0.3f' % dlx)
print('The width of the cuboid is %0.3f' % dly)
print('The height of the cuboid is %0.3f' % sumdlz)

boxname = 'cuboid' + '-' + str(dlx) + '-' + str(dly)  + '-' + str(sumdlz) + '.poly'
boxf = open(boxname,'w')

nx=100
ny=50
nodenum_part=2*(nx+ny)
nodenum=(nn+1)*nodenum_part
dlz1=np.append(0,dlz)

for i in range(0, nn):
   dlz1[i+1]=dlz1[i]+dlz1[i+1]
       

#save the information of nodes  储存所有节点信息
node = [[0 for col in range(4)] for row in range(nodenum)]
for i in range(0,nodenum):
   node[i] = [i+1,0,0,0]  # 第一个值储存节点编号 

for i in range(0, len(dlz1)):
   for j in range(0, int(ny/2)):  # 底面上节点的三维坐标
       node[i*nodenum_part+j][1:] = [dlx/2, j*dly/ny, dlz1[i]-sumdlz]
   for j in range(int(ny/2), int(ny/2+nx/2)):
       node[i*nodenum_part+j][1:] = [dlx/2-(j-int(ny/2))*dlx/nx, dly/2, dlz1[i]-sumdlz]
   for j in range(int(ny/2+nx/2), int(ny/2+nx)):
       node[i*nodenum_part+j][1:] = [-(j-int(nx/2+ny/2))*dlx/nx, dly/2, dlz1[i]-sumdlz]
   for j in range(int(ny/2+nx), int(ny+nx)):
       node[i*nodenum_part+j][1:] = [-dlx/2, dly/2-(j-int(nx+ny/2))*dly/ny, dlz1[i]-sumdlz]
       
   for j in range(int(nx+ny), int(nx+ny+ny/2)):  
       node[i*nodenum_part+j][1:] = [-dlx/2, -(j-int(nx+ny))*dly/ny, dlz1[i]-sumdlz]
   for j in range(int(nx+ny+ny/2), int(nx+ny+ny/2+nx/2)):
       node[i*nodenum_part+j][1:] = [-dlx/2+(j-int(nx+ny+ny/2))*dlx/nx, -dly/2, dlz1[i]-sumdlz]
   for j in range(int(nx+ny+ny/2+nx/2), int(nx+ny+ny/2+nx)):
       node[i*nodenum_part+j][1:] = [(j-int(nx+ny+nx/2+ny/2))*dlx/nx, -dly/2, dlz1[i]-sumdlz]
   for j in range(int(nx+ny+ny/2+nx), int(nx+ny+ny+nx)):
       node[i*nodenum_part+j][1:] = [dlx/2, -dly/2+(j-int(nx+ny+nx+ny/2))*dly/ny, dlz1[i]-sumdlz]
       
#save the information of facets   存储面的信息     
facenum = nn*nodenum_part + nn + 1  # 侧面的面单元和每个立方体的上底面和下底面的和 
   
faceAll = [[0 for col in range(6)] for row in range(facenum-nn-1)]  # 初始化面的数据
  
for j in range(0,nn):
   for i in range(0, nodenum_part-1):
       faceAll[j*nodenum_part+i] = [4, j*nodenum_part+i+1, j*nodenum_part+i+2, j*nodenum_part+i+2+nodenum_part, j*nodenum_part+i+1+nodenum_part, j+nn+2]
   faceAll[(j+1)*nodenum_part-1] = [4, (j+1)*nodenum_part, j*nodenum_part+1, (j+1)*nodenum_part + 1, (j+2)*nodenum_part, j+nn+2]


face = [[0 for col in range(5)] for row in range(facenum-nn-1)]  # 初始化面
faceMark = [[0 for col in range(3)] for row in range(facenum-nn-1)]  # 初始化面标记
   
for i in range(0,facenum-nn-1):
   face[i] = faceAll[i][0:5]
   faceMark[i] = [1,0,faceAll[i][-1]]


meshsize = [-1] # the size of mesh 


numVolumMark = nn # nn regions 
SolventMark = [4, 0.1, 1, 10] # the region mark is 1
region = [[0 for col in range(6)] for row in range(numVolumMark)]
for i in range(0,len(region)):
   region[i] = [i+1,0,0,0,0,0]

for i in range(0,len(region)):
   region[i][1] = (node[i*nodenum_part][1] + node[int(nodenum_part/2+(i+1)*nodenum_part)][1])/2        
   region[i][2] = (node[i*nodenum_part][2] + node[int(nodenum_part/2+(i+1)*nodenum_part)][2])/2
   region[i][3] = (node[i*nodenum_part][3] + node[int(nodenum_part/2+(i+1)*nodenum_part)][3])/2
   region[i][4] = SolventMark[i]
   region[i][5] = meshsize[0]
   
line = '# Part 1 - node list\n'
boxf.write(line)
line = '# <# of points> <dimension 3> <# of attributes> <boundary markers>\n'
boxf.write(line)
line = str(nodenum) + '\t' + '3' + '\t' + '0' + '\t' + '1' + '\n'
boxf.write(line)
for i in range(0, nodenum):
   line = str(node[i][0]) + '\t' + str(node[i][1]) + '\t' + str(node[i][2]) + '\t' + str(node[i][3]) + '\t' + str(0) + '\n'
   boxf.write(line)
   
line = '# Part 2 - face list\n'
boxf.write(line)
line = str(facenum) + '\t' + '1' + '\n'
boxf.write(line)
line = '# facet count, boundary marker\n'
boxf.write(line)
line = '#(Eg.) one polygon, no hole, boundary market is 1\n'
boxf.write(line)

for j in range(0,nn):
   line = str(1) + '\t' + str(0) + '\t' + str(j+1) + '\n'
   boxf.write(line)
   line = str(nodenum_part) + '\t'
   for i in range(j*nodenum_part, (j+1)*nodenum_part):
       line += str(i+1) + '\t'
   line += '\n'
   boxf.write(line)
   for k in range(j*nodenum_part, (j+1)*nodenum_part):
       line = str(faceMark[k][0]) + '\t' + str(faceMark[k][1]) + '\t' + str(faceMark[k][2]) + '\n'
       boxf.write(line)
       line = str(face[k][0]) + '\t' + str(face[k][1]) + '\t' + str(face[k][2]) + '\t' + str(face[k][3]) + '\t' + str(face[k][4]) + '\n'
       boxf.write(line)

# the boundary mark of the top facet is 
line = str(1) + '\t' + str(0) + '\t' + str(nn+1) + '\n'
boxf.write(line)
line = str(nodenum_part) + '\t'
for i in range(nn*nodenum_part, (nn+1)*nodenum_part):
   line += str(i+1) + '\t'
line += '\n'
boxf.write(line)
       
       

line = '# Part 3 - hole list\n'
boxf.write(line)
line = '# <# of polygons> <# of holes> <boundary marker>\n'
boxf.write(line)
line = '0' + '\n'
boxf.write(line)


line = '# Part 4 - region list\n'
boxf.write(line)
line = '#<region #> <x> <y> <z> <region attribute> <region volume constraint>\n'
boxf.write(line)
line = str(numVolumMark) + '\n'
boxf.write(line)
for i in range(0,len(region)):
       line = str(region[i][0]) + '\t' + str(region[i][1]) + '\t' + str(region[i][2]) + '\t' + \
       str(region[i][3]) + '\t' + str(region[i][4]) + '\t' + str(region[i][5]) + '\n'
       boxf.write(line)
boxf.close()
   
   
#boxmeshfile = 'cylinder_' + str(dx) + '_' + str(dy) + '-' + 'refined1'+ '.mesh'
cmd = 'tetgen.exe -pq1.3iaAV -k ' + boxname
os.system(cmd)

该程序运行完成后会生成如下几个文件：
在这里插入图片描述
其效果图是这样：

在这里插入图片描述
在这里插入图片描述

  • 大家在看懂程序后可以生成自己想要的任意层状介质的poly文件，和剖分文件。希望这个程序对大家学习和使用有所帮助。
VincentFu2017
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TetGen中文用户手册
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tetview配合tetgen使用。TetView is a small graphic program for viewing tetrahedral meshes and piecewise linear complexes. It is created sepcifically for viewing and analyzing the input and output files of TetGen. However, it has the general features for viewing geometry objects and triangular and tetrahedral meshes.
空间点集的三角剖分工具——四面体生成器（TetGen）和三维三角剖分包（CGAL）
yangjj2005的博客
05-19 6257
TetGen - Tetrahedral Generator TetGen是一款四面体网格生成器。它创建多面体域的三维三角剖分。它能生成具有良好形状的单元网格，单元大小适合于几何特征或用户提供的尺寸函数。它在科学计算的各种应用中都有应用，如计算机图形学(CG)、计算机辅助设计(CAD)、几何处理(参数化和计算机动画)和物理模拟(有限元分析)。 TetGen的功能 对于一组3d(加权)点，TetGen生成Delaunay和 weighted Delaunay四面体网格以及它们的对偶，Voronoi图
三角面片(.obj,.ply,.stl)生成四面体网格(tetgen格式)
qq_40621963的博客
04-15 1787
三角面片mesh(.obj,.ply,.stl)生成四面体网格(tetgen格式)
Tetgen学习，算法篇
qq_44624867的博客
11-25 1165
tetgen源码学习
专注网格剖分 - TetGen,NETGEN,Steller
weixin_34144848的博客
08-29 1003
提要 记得大三那一年有一门课叫做高等有限元，最后的作业就是网格剖分算法的实现，我和同学一起花了些时间做了一个Qt程序，他写算法，我写界面，最后成绩竟然出奇的拿了90多... 今天要介绍的这款软件TetGen就是一款网格剖分的软件，算是力学计算中的前处理,他能够将输入的三维模型剖分成一个个的单元，如下图： 最左边...
tetview-linux
09-29
tetgen剖分后的三维模型观测。
meshpy:适用于Python的2D3D简单网格生成器接口（Triangle，TetGen，gmsh）
03-08
MeshPy：从Python生成简单网格 MeshPy为Python提供了高质量的三角形和四面体网格生成。 这种类型的网格主要用于有限元仿真代码中，但也有许多其他应用，从计算机图形学到机器人技术。 为了产生二维和三维网格，MeshPy提供的Python接口到三个广泛关注的网格生成器，由J. Shewchuk， 由杭司前二者都包含在包中稍微修改的版本。 包括用于后者的通用网格读取器，以及从Python脚本运行gmsh的简便方法。 有关Christophe 和Jean-Francois Remacle的的界面，请参见gmsh_interop < >。 除了C ++编译器和有效的Python安装，MeshPy没有任何依赖关系。 在安装meshpy之前，您可以使用以下命令安装pybind11： pip install pybind11 从0.91.2版开始，MeshPy还可以与Pyth
Tetgen1.6版本中文用户手册
03-02
Tetgen1.6版本中文用户手册
tetgen资源.rar
09-15
tetgen资源.rar是一个压缩包，包含了tetgen的安装源码、tetview软件以及相关的文档，旨在帮助用户学习和使用tetgen进行四面体网格剖分。tetgen是一款强大的三维几何建模工具，主要用于生成高质量的有限元分析所需的...
tetgen 1.5
03-02
tetgen 1.5是该软件的一个版本，可能包含了对前一版本的改进和优化。由于你在描述中提到在官方网站下载页面遇到问题，这可能是因为网站服务器暂时不可用，或者链接已过期，使得获取最新版本变得困难。不过，你最终...
替丁（tetgen）：使用fade3d进行Delaunay四面体化
02-10
【替丁（tetgen）与Delaunay四面体化】 在三维几何建模和数值计算领域， Tetgen 和 Delaunay ...通过对 `tetgen-main` 文件的学习和实践，开发者能够熟练掌握 Tetgen 库的使用，从而实现更精确和高效的数值计算。
Tetgen网格划分程序1.50
04-10
总的来说，Tetgen是一款强大的工具，它的开源性质使得开发者和研究人员能深入学习网格划分算法，改进现有技术，或者将其集成到自定义的工作流程中。对于希望理解和掌握三维网格生成的人来说，Tetgen是一个不容忽视的...
e2aps:上-开源
04-27
【标题】"e2aps: 上 - 开源" 在IT领域，开源软件是现代技术发展的重要...需要注意的是，使用开源软件时，用户应确保遵循开源许可证的规定，尊重开发者的工作，并尽可能参与社区回馈，以保持软件的活力和可持续发展。
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