问题
给你1个文件bigdata
,大小4663M,5亿个数,文件中的数据随机,如下一行一个整数:
6196302
3557681
6121580
2039345
2095006
1746773
7934312
2016371
7123302
8790171
2966901
...
7005375
现在要对这个文件进行排序,怎么搞?
内部排序
先尝试内排,选2种排序方式:
3路快排:
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 |
|
归并排序:
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 |
|
数据太多,递归太深 ->栈溢出?加大Xss?
数据太多,数组太长 -> OOM?加大Xmx?
耐心不足,没跑出来.而且要将这么大的文件读入内存,在堆中维护这么大个数据量,还有内排中不断的拷贝,对栈和堆都是很大的压力,不具备通用性。
sort命令来跑
1 |
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跑了多久呢?24分钟.
为什么这么慢?
粗略的看下我们的资源:
1. 内存
jvm-heap/stack,native-heap/stack,page-cache,block-buffer
2. 外存
swap + 磁盘数据量很大,函数调用很多,系统调用很多,内核/用户缓冲区拷贝很多,脏页回写很多,io-wait很高,io很繁忙,堆栈数据不断交换至swap,线程切换很多,每个环节的锁也很多.
总之,内存吃紧,问磁盘要空间,脏数据持久化过多导致cache频繁失效,引发大量回写,回写线程高,导致cpu大量时间用于上下文切换,一切,都很糟糕,所以24分钟不细看了,无法忍受.
位图法
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 |
|
nice!跑了190秒,3分来钟.
以核心内存4663M/32
大小的空间跑出这么个结果,而且大量时间在用于I/O,不错.
问题是,如果这个时候突然内存条坏了1、2根,或者只有极少的内存空间怎么搞?
外部排序
该外部排序上场了.
外部排序干嘛的?
内存极少的情况下,利用分治策略,利用外存保存中间结果,再用多路归并来排序; map-reduce的嫡系.
1.分
内存中维护一个极小的核心缓冲区memBuffer
,将大文件bigdata
按行读入,搜集到memBuffer
满或者大文件读完时,对memBuffer
中的数据调用内排进行排序,排序后将有序结果写入磁盘文件bigdata.xxx.part.sorted
.
循环利用memBuffer
直到大文件处理完毕,得到n个有序的磁盘文件:
2.合
现在有了n个有序的小文件,怎么合并成1个有序的大文件?
把所有小文件读入内存,然后内排?
(⊙o⊙)…
no!
利用如下原理进行归并排序:
我们举个简单的例子:
文件1:3,6,9
文件2:2,4,8
文件3:1,5,7第一回合:
文件1的最小值:3 , 排在文件1的第1行
文件2的最小值:2,排在文件2的第1行
文件3的最小值:1,排在文件3的第1行
那么,这3个文件中的最小值是:min(1,2,3) = 1
也就是说,最终大文件的当前最小值,是文件1、2、3的当前最小值的最小值,绕么?
上面拿出了最小值1,写入大文件.第二回合:
文件1的最小值:3 , 排在文件1的第1行
文件2的最小值:2,排在文件2的第1行
文件3的最小值:5,排在文件3的第2行
那么,这3个文件中的最小值是:min(5,2,3) = 2
将2写入大文件.也就是说,最小值属于哪个文件,那么就从哪个文件当中取下一行数据.(因为小文件内部有序,下一行数据代表了它当前的最小值)
最终的时间,跑了771秒,13分钟左右.
less bigdata.sorted.text
...
9999966
9999967
9999968
9999969
9999970
9999971
9999972
9999973
9999974
9999975
9999976
9999977
9999978
...