一篇文章彻底搞懂 TiDB 集群各种容量计算方式

TiDB_PingCAP

于 2024-02-16 15:51:24 发布

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文章标签：数据库 tidb TiDB 云原生开源

本文链接：https://blog.csdn.net/TiDB_PingCAP/article/details/136129510

版权

作者丨hey-hoho

来自神州数码钛合金战队

神州数码钛合金战队是一支致力于为企业提供分布式数据库 TiDB 整体解决方案的专业技术团队。团队成员拥有丰富的数据库从业背景，全部拥有 TiDB 高级资格证书，并活跃于 TiDB 开源社区，是官方认证合作伙伴。目前已为 10+ 客户提供了专业的 TiDB 交付服务，涵盖金融、证券、物流、电力、政府、零售等重点行业。

背景

TiDB 集群的监控面板里面有两个非常重要、且非常常用的指标，相信用了 TiDB 的都见过：

○ Storage capacity：集群的总容量

○ Current storage size：集群当前已经使用的空间大小

当你准备了一堆服务器，经过各种思考设计部署了一个 TiDB 集群，有没有想过这两个指标和服务器磁盘之间到底是啥关系？

反正我们经常被客户问这个问题，以前虽然能说出个大概，总体方向上没错，但是深究一下其实并不严谨，这次翻了源码彻底把这个问题搞清楚。开始之前再卖一个关子，大家可以看看自己手上的集群监控有没有这种情况：

TiKV 实例的已用空间（store size）+ 可用空间（available size） ≠ 总空间（capacity size）

盘越大越明显。

再仔细点看，监控上显示的总容量大小和 TiKV 实例所在盘大小也不匹配。

是不是有“亿点”意外。

结论先行

○ PD 监控下的 Storage capacity 和 Current storage size 来自各个 store 的累加，这里 store 包含了 TiKV 和 TiFlash

○ Current storage size 包含了多个数据副本（TiKV 和 TiFlash 的所有副本数），非真实数据大小

○ TiKV 实例容量统计的是 TiKV 所在磁盘的整体大小与 raftstore.capacity 参数较小的值，同时监控用的 bytes(SI) 标准显示，就是说不是用 1024 做的转换而是 1000，所以和 df -h 输出的盘大小有差距

○ TiKV 实例的已用空间只统计了 data-dir 下的部分目录，非整个 data-dir 或整块盘

○ 基于前两条，可用空间也就不等于总空间减去已用空间了

看到的现象

本文描述的内容基于以下集群：

[tidb@localhost ~]$ tiup cluster display tidb-test
tiup is checking updates for component cluster ...
Starting component `cluster`: /home/tidb/.tiup/components/cluster/v1.13.0/tiup-cluster display tidb-test
Cluster type:       tidb
Cluster name:       tidb-test
Cluster version:    v6.5.5
Deploy user:        tidb
SSH type:           builtin
Dashboard URL:      http://x.236:2379/dashboard
Grafana URL:        http://x.242:3000
ID          Role        Host    Ports        OS/Arch       Status   Data Dir     Deploy Dir
--          ----        ----    -----        -------       ------   --------     ----------
x.242:3000   grafana     x.242  3000         linux/x86_64  Up       -            /data/tidb-deploy/grafana-3000
x.235:2379   pd          x.235  2379/2380    linux/x86_64  Up       /data/tidb-data/pd-2379               /data/tidb-deploy/pd-2379
x.236:2379   pd          x.236  2379/2380    linux/x86_64  Up|L|UI  /data/tidb-data/pd-2379               /data/tidb-deploy/pd-2379
x.237:2379   pd          x.237  2379/2380    linux/x86_64  Up       /data/tidb-data/pd-2379               /data/tidb-deploy/pd-2379
x.242:9090   prometheus  x.242  9090/12020   linux/x86_64  Up       /data/tidb-data/prometheus-9090       /data/tidb-deploy/prometheus-9090
x.235:4000   tidb        x.235  4000/10080   linux/x86_64  Up       -            /data/tidb-deploy/tidb-4000
x.236:4000   tidb        x.236  4000/10080   linux/x86_64  Up       -             /data/tidb-deploy/tidb-4000
x.237:4000   tidb        x.237  4000/10080   linux/x86_64  Up       -             /data/tidb-deploy/tidb-4000
x.241:9000   tiflash     x.241  9000/8123/3930/20170/20292/8234  linux/x86_64  Up /data/tiflash/tidb-data/tiflash-9000  /data/tiflash/tidb-deploy/tiflash-9000
x.238:20160  tikv        x.238  20160/20180  linux/x86_64  Up       /data/tidb-data/tikv-20160            /data/tidb-deploy/tikv-20160
x.239:20160  tikv        x.239  20160/20180  linux/x86_64  Up       /data/tidb-data/tikv-20160            /data/tidb-deploy/tikv-20160
x.240:20160  tikv        x.240  20160/20180  linux/x86_64  Up       /data/tidb-data/tikv-20160            /data/tidb-deploy/tikv-20160

各节点磁盘情况（来自 TiDB Dashboard 统计）：

在此之前，我一直以为 PD 监控面板下的集群总空间是 PD 读取了所有 TiKV+TiFlash 实例部署盘的累计大小，所以我尝试把上图的 4 个存储节点的磁盘容量相加发现并不等于集群总容量（文章开头的图片有显示），差了 100 多个 G：

○ Dashboard 上 4 个存储节点磁盘容量均为 475.8G，累计容量 475.8G * 4 = 1903.2G

○ Grafana 显示的单个 TiKV 实例：510.9G，总空间：2.04 T

再和操作系统显示的磁盘容量对比，发现能和 Dashboard 显示的对应上：

[tidb@localhost ~]$ df -h
Filesystem               Size  Used Avail Use% Mounted on
/dev/mapper/centos-root  476G  347G  110G  77% /
devtmpfs                  31G     0   31G   0% /dev
tmpfs                     31G  4.0K   31G   1% /dev/shm
tmpfs                     31G  3.1G   28G  10% /run
tmpfs                     31G     0   31G   0% /sys/fs/cgroup
/dev/sda1                477M  138M  310M  31% /boot

但仔细看容量单位的区别，发现 Dashboard 显示的是 GiB ，Grafana 显示的是 GB ，两者是有区别的。尝试在系统中用 GB 显示磁盘大小：

[tidb@localhost ~]$ df -H
Filesystem               Size  Used Avail Use% Mounted on
/dev/mapper/centos-root  511G  372G  118G  77% /
devtmpfs                  34G     0   34G   0% /dev
tmpfs                     34G  4.1k   34G   1% /dev/shm
tmpfs                     34G  3.3G   30G  10% /run
tmpfs                     34G     0   34G   0% /sys/fs/cgroup
/dev/sda1                500M  145M  325M  31% /boot

这里输出的 511G 能和 Grafana 监控对应上，同时按 4 个 511G 的存储节点计算也能和总容量对应上。

但是用同样的方法并不能解释 TiKV 已用空间的偏差问题，检查结果如下：

# 输出内容为240节点tikv数据目录大小，但监控显示tikv已用空间333.7GB
[tidb@localhost ~]$ du -sh /data/tidb-data/tikv-20160
329G    /data/tidb-data/tikv-20160
[tidb@localhost ~]$ du -sh --si /data/tidb-data/tikv-20160
353G    /data/tidb-data/tikv-20160

总结一下看到的现象：

○ Dashboard 上显示的 TiKV 盘大小（GiB）是实际部署盘的总大小，Grafana 也是部署盘的总大小但单位是 GB

○ Grafana 集群总容量是所有存储节点部署盘的累计大小（GB）

○ TiKV 实例已用空间大小计算方式未知（要搞清楚只能扒源码了）

不同进制转换带来的影响

这里简单提一下 GB 和 GiB 的区别，帮助大家理解。

○ GB 是按 10 进制来转换，也就是说 1GB=1000MB，市面上厂商宣传的大小都是 10 进制，可理解为商业标准

○ GiB 是按 2 进制来转换，也就是说 1GiB=1024MiB，计算机系统只认这个，可理解为事实标准

那么当你买了一台 128G 存储的手机，实际使用中会发现空间“缩水”了，U 盘、硬盘等也类似。

与这两个进制差异有关的还有两个行业标准，即 byte(SI) 和 byte(IEC) ，感兴趣的可以去查一下历史，这里只需要知道：

○ byte(SI) 对应十进制

○ byte(IEC) 对应二进制

Grafana 里面可以使用编辑监控面板调整显示单位，例如：

如果把单位统一的话，前 2 个现象就很好解释了。

但需要注意的是，在 Grafana 中并不是所有面板都采用了 byte(SI) ，甚至同一个指标也出现不同面板显示的单位不一样，比如 Overview 下面的 TiDB 分组内存面板使用十进制，System Info 分组内存面板使用二进制，用的时候要小心。

TiKV 的数据文件

要搞清楚 TiKV 的已用空间是怎么计算的，先提一下 TiKV 相关的数据文件。大家都知道 TiKV 底层用的 RocksDB 作为持久层，并且 raft 日志和实际数据分别对应一个 RocksDB 实例，那么看看 TiKV 的数据目录到底放了啥东西，以前面的集群为例：

[tidb@localhost ~]$ cd /data/tidb-data/tikv-20160
[tidb@localhost tikv-20160]$ ll -h
total 14G
drwxr-xr-x 2 tidb tidb 1.1M Dec 22 15:22 db
drwxr-xr-x 4 tidb tidb 132K Dec 21 18:20 import
-rw-r--r-- 1 tidb tidb  20K Nov 15 14:47 last_tikv.toml
-rw-r--r-- 1 tidb tidb    0 Nov 15 14:53 LOCK
-rw-r--r-- 1 tidb tidb 301M Mar  3  2023 raftdb-2023-03-03T17-32-13.506.info
...
-rw-r--r-- 1 tidb tidb 301M Nov 13 21:51 raftdb-2023-11-13T21-51-00.249.info
-rw-r--r-- 1 tidb tidb  31M Nov 15 14:47 raftdb.info
drwxr-xr-x 2 tidb tidb 4.0K Dec 22 00:08 raft-engine
-rw-r--r-- 1 tidb tidb 301M Jan 18  2023 rocksdb-2023-01-18T10-12-55.000.info
...
-rw-r--r-- 1 tidb tidb 301M Dec  7 03:01 rocksdb-2023-12-07T03-01-02.905.info
-rw-r--r-- 1 tidb tidb 197M Dec 22 17:11 rocksdb.info
drwxr-xr-x 2 tidb tidb 4.0K Dec 21 16:27 snap
-rw-r--r-- 1 tidb tidb 4.8G Nov 15 14:53 space_placeholder_file

几类文件解读一下：

○ db 目录，这是最终数据的存放目录， db 在源码中写死无法修改

○ rocksdb[-xxx-xxx].info 文件，数据 RocksDB 实例的日志文件，已经按日期归档好的可手动删除

○ raft-engine 目录，这是 raft 日志存放目录，受参数 raft-engine.dir 控制，没有开启 Raft Engine 特性时名称默认为 raft ，受参数 raftstore.raftdb-path 控制

○ raftdb[-xxx-xxx].info 文件，raft 日志 RocksDB 实例的日志文件，已经按日期归档好的可手动删除

○ import 目录，看名字是和导入相关，具体什么作用未知

○ space_placeholder_file 文件，预留空间的临时文件（TiKV 磁盘告警救急用，磁盘越大这个文件越大），相关参数 storage.reserve-space

○ last_tikv.toml 和 LOCK 文件，看名字猜测就行

从前面的观察来看，被监控统计到的 TiKV 已用空间比整个数据目录要小，那么可以推测出只统计了数据目录下的部分文件或目录，具体是哪些就要从源码里寻找答案。

Show Me The Code

TiDB 的监控数据分为两类，一类是服务器环境信息（CPU、内存、磁盘、网络等），一类是 TiDB 运行指标（Duration、QPS、Region 数、容量等）。前者通过与 Prometheus 配套的标准探针采集，即 node_exporter 和 black_exporter ，后者通过在源码中类似埋点方式采集数据然后由 Prometheus 来拉取。

import (
    ...
    "github.com/prometheus/client_golang/prometheus"
    "github.com/prometheus/client_golang/prometheus/collectors"
    ...
)

var (
    // PanicCounter measures the count of panics.
    PanicCounter *prometheus.CounterVec

    // MemoryUsage measures the usage gauge of memory.
    MemoryUsage *prometheus.GaugeVec
)

以集群总容量这个指标入手，看看在源码中它是如何采集的。对应的公式：

pd_cluster_status{k8s_cluster="$k8s_cluster", tidb_cluster="$tidb_cluster", instance="$instance",type="storage_capacity"}

用关键字 storage_capacity 去 PD 源码里搜索找到如下代码：

func (s *storeStatistics) Collect() {
    placementStatusGauge.Reset()

    metrics := make(map[string]float64)
    ...
    metrics["storage_capacity"] = float64(s.StorageCapacity)

    for typ, value := range metrics {
        clusterStatusGauge.WithLabelValues(typ).Set(value)
    }
    ...
}

数据来自 storeStatistics 的 StorageCapacity 字段，根据引用关系继续往上翻：

func (s *storeStatistics) Observe(store *core.StoreInfo) {
    ...
    // Store stats.
    s.StorageSize += store.StorageSize()
    s.StorageCapacity += store.GetCapacity()
    ...
}

从这里可以看出总容量（Storage capacity）和总已用空间（Current storage size）都是从各个 store 累加得来，并不是 pd 直接从存储节点计算。

继续看 GetCapacity() 是如何实现：

func (ss *storeStats) GetCapacity() uint64 {
    ss.mu.RLock()
    defer ss.mu.RUnlock()
    return ss.rawStats.GetCapacity()
}
func newStoreStats() *storeStats {
    return &storeStats{
        rawStats:     &pdpb.StoreStats{},
        avgAvailable: movingaverage.NewHMA(60), // take 10 minutes sample under 10s heartbeat rate
    }
}

这里 rawStats 是一个 pdpb.StoreStats 类型，引用了另一个仓库： https://github.com/pingcap/kvproto 。最终实现为：

// https://github.com/pingcap/kvproto/blob/master/pkg/pdpb/pdpb.pb.go#L4371C1-L4376C2
func (m *StoreStats) GetCapacity() uint64 {
    if m != nil {
        return m.Capacity
    }
    return 0
}

从调用关系来看，说明 PD 采集的数据都是来自 TiKV 上报（heartbeat）。继续追踪 TiKV 源码，以 heartbeat 为突破口：

pub fn handle_store_heartbeat(
        &mut self,
        mut stats: pdpb::StoreStats,
        is_fake_hb: bool,
        store_report: Option<pdpb::StoreReport>,
    ) {
        ...
        let (capacity, used_size, available) = self.collect_engine_size().unwrap_or_default();
        if available == 0 {
            warn!(self.logger, "no available space");
        }

        stats.set_capacity(capacity);
        stats.set_used_size(used_size);
        stats.set_available(available);
        ...
  }

这里的 stats 正是一个 pdpb::StoreStats 类型，我们想要分析的 3 个指标都在这，继续看他们的出处 collect_engine_size() :

fn collect_engine_size<EK: KvEngine, ER: RaftEngine>(
    coprocessor_host: &CoprocessorHost<EK>,
    store_info: Option<&StoreInfo<EK, ER>>,
    snap_mgr_size: u64,
) -> Option<(u64, u64, u64)> {
    if let Some(engine_size) = coprocessor_host.on_compute_engine_size() {
        return Some((engine_size.capacity, engine_size.used, engine_size.avail));
    }
    let store_info = store_info.unwrap();
    // 这里跟根据kv engine的目录（${data_dir}/db）获取了所在磁盘的信息
    let disk_stats = match fs2::statvfs(store_info.kv_engine.path()) {
        Err(e) => {
            error!(
                "get disk stat for rocksdb failed";
                "engine_path" => store_info.kv_engine.path(),
                "err" => ?e
            );
            return None;
        }
        Ok(stats) => stats,
    };
    // total_space得到磁盘的总容量，参考API：https://docs.rs/fs2/latest/fs2/fn.total_space.html
    let disk_cap = disk_stats.total_space();
    // 计算得出tikv实例的容量，用磁盘容量与参数设置的容量（raftstore.capacity）相比
    // 如果没有设置raftstore.capacity参数，或者是磁盘容量小于设置的容量，那么取磁盘容量，否则取设置的容量，本质就是取较小的那个
    let capacity = if store_info.capacity == 0 || disk_cap < store_info.capacity {
        disk_cap
    } else {
        store_info.capacity
    };
    // 计算已用大小，快照大小（snap目录） + kv engine大小（db目录） + raft engine大小（raft-engine目录）
    let used_size = snap_mgr_size
        + store_info
            .kv_engine
            .get_engine_used_size()
            .expect("kv engine used size")
        + store_info
            .raft_engine
            .get_engine_size()
            .expect("raft engine used size");
    // 计算逻辑可用空间，总容量-已用空间
    let mut available = capacity.checked_sub(used_size).unwrap_or_default();
    // We only care about rocksdb SST file size, so we should check disk available
    // here.
    // 最终可用空间是取逻辑可用和磁盘可用的较小值
    available = cmp::min(available, disk_stats.available_space());
    Some((capacity, used_size, available))
}

核心逻辑分析都写在注释里，值得认真一看！

以为扒到这里就 happy ending 了，但是偶然又发现了另一个方法让我陷入沉思：

    fn init_storage_stats_task(&self, engines: Engines<RocksEngine, ER>) {
        ...
        self.background_worker
            .spawn_interval_task(DEFAULT_STORAGE_STATS_INTERVAL, move || {
                let disk_stats = match fs2::statvfs(&store_path) {
                    Err(e) => {
                        error!(
                            "get disk stat for kv store failed";
                            "kv path" => store_path.to_str(),
                            "err" => ?e
                        );
                        return;
                    }
                    Ok(stats) => stats,
                };
                let disk_cap = disk_stats.total_space();
                let snap_size = snap_mgr.get_total_snap_size().unwrap();

                let kv_size = engines
                    .kv
                    .get_engine_used_size()
                    .expect("get kv engine size");

                let raft_size = engines
                    .raft
                    .get_engine_size()
                    .expect("get raft engine size");
               ...
                let placeholer_file_path = PathBuf::from_str(&data_dir)
                    .unwrap()
                    .join(Path::new(file_system::SPACE_PLACEHOLDER_FILE));

                let placeholder_size: u64 =
                    file_system::get_file_size(placeholer_file_path).unwrap_or(0);
                // 这里的已用空间计算方式与heartbeat有区别，把space_placeholder_file文件算进去了，还加了raft engine单独部署的逻辑
                let used_size = if !separated_raft_mount_path {
                    snap_size + kv_size + raft_size + placeholder_size
                } else {
                    snap_size + kv_size + placeholder_size
                };
                let capacity = if config_disk_capacity == 0 || disk_cap < config_disk_capacity {
                    disk_cap
                } else {
                    config_disk_capacity
                };

                let mut available = capacity.checked_sub(used_size).unwrap_or_default();
                available = cmp::min(available, disk_stats.available_space());
                ...
            })
    }

init_storage_stats_task 在 tikv 启动时被调用，就是说这是几个指标在初始化时的计算方式，整体逻辑与 heartbeat 上报并无区别，但已用空间计算方式有轻微差异：

○ space_placeholder_file 被算进去了

○ 如果 raft engine 使用了单独的部署目录（代码里叫 path_in_diff_mount_point），那么 raft 日志的大小是不算在 tikv 已用空间内的

看起来前后计算不一致，但是由于 heartbeat 是持续更新的，最终是以 heartbeat 上报的为准。

○ PD 源码仓库： https://github.com/tikv/pd

○ TiKV 源码仓库： https://github.com/tikv/tikv

结尾

结论已经在文章开头给出了，希望大家看了本文都能对 TiDB 集群的各种空间计算有了清晰的认识。

本文只讨论的 TiKV 的容量计算细节，TiFlash 的计算方式也类似，我对比了 Ti F lash 的数据目录大小和监控显示已用大小 10 多 G 的差距，应该也是只计算了部分目录，但是总容量还是算的整块盘。不太熟悉 c++，留给其他大佬去探索吧。

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一篇文章彻底搞懂 TiDB 集群各种容量计算方式

本文只讨论的 TiKV 的容量计算细节，TiFlash 的计算方式也类似，我对比了 Ti F lash 的数据目录大小和监控显示已用大小 10 多 G 的差距，应该也是只计算了部分目录，但是总容量还是算的整块盘。不太熟悉 c++，留给其他大佬去探索吧。○ TiKV 实例容量统计的是 TiKV 所在磁盘的整体大小与 raftstore.capacity 参数较小的值，同时监控用的 bytes(SI) 标准显示，就是说不是用 1024 做的转换而是 1000，所以和 df -h 输出的盘大小有差距。
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