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RSS订阅原创 从大脑图谱/ROI中提取BOLD信号
在功能连接（Functional Connectivity，FC）构建过程中，由于FC中元素数目是节点数目的平方关系，所以在计算FC之前进行数据降维是一个常见的选择。一般会将体素级/顶点级BOLD信号（在2mm的图像分辨率下大脑皮层有约十万个体素）降维到ROI级BOLD信号（ROI数目一般在几十到几百）。关于ROI的选择，最常用的是使用已经定义好的大脑图谱，常见的有：Glasser-360图谱[1]，Schaefer-400图谱[2]。
2024-09-11 16:23:37
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原创 二分K均值bi-kmeans
对K个质心的初始选取比较敏感，如果初始质心选取得不好有可能陷入局部最小值，这个问题可以通过跑多次Kmeans来选取最优结果尽可能避免。（1）将数据看成一个簇，对数据进行二分类Kmeans进行初始化。（2）找到最大SSE所在的簇，对该簇进行二分类Kmeans。可以通过运行多次二分Kmeans，找到最优的结果。（3）每次增加一个簇，直到达到所要求的簇数。
2023-04-24 15:41:25
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原创 计算两组数据聚类结果的Dice系数
对于由kmeans得到的聚类结果，每类的具体标签号是无意义的，为了衡量多个结果之间的相似性，利用邻接矩阵，计算邻接矩阵的Dice系数来衡量聚类结果的相似性。
2023-03-19 16:48:39
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原创 matlab稀疏矩阵的转换和存取
在matlab中，sparse()函数可以将矩阵转为稀疏矩阵，但存储和读取很麻烦，所以根据稀疏矩阵的非零值的坐标和值将其提取出来并按照正常矩阵的读取是更方便的实现方法
2022-11-29 18:17:51
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原创 第二章 弛豫和共振信号的检测
本章介绍了核磁共振中很重要的一个概念——弛豫，并且介绍了由弛豫产生的自由感应衰减信号，了解这两个概念是了解磁共振成像原理的基础
2022-11-17 14:50:09
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原创 龙格库塔4阶求解酶动力学方程
RK4求解酶动力学方程，由两个部分构成：主函数RK4用于进行迭代求解，子函数f用于存储微分方程。function RK4clear;clc;% define initial valuesE0=1; k3=150/60; % define step width and initial values of C,Sh=0.001; % step width is 0.001st=0:h:30; % range is 0-30sn=length(t);
2022-10-25 13:17:14
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空空如也
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