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原创 R包安装报错及解决方法

前言:记录那些我遇到的关于R包的乱七八糟的错误:1、报错“Warning: unable to access index for repository https://mirrors.bfsu.edu.cn/CRAN/src/contrib: cannot open URL 'https://mirrors.bfsu.edu.cn/CRAN/src/contrib/PACKAGES'”解决方法:> options(repos='http://cran.rstudio.com/'..

2022-03-17 09:33:26 4355 1

原创 MR分析(一):SNP数据质控

刚拿到手一个范围大约600KB的基因座的遗传数据。356个SNP1.对个体数据进行质控:排除missing值>0.5的个体2.检查遗传数据的性别是否与样本一致3.对遗传数据进行质控:3.1 哈温伯格定律检验:> library(SNPassoc)> idx <- grep("^rs", colnames(a)) #选择所有有“rs”的列> a.s <- setupSNP(data=a, colSNPs=idx, sep="") #识别

2022-01-18 18:41:48 3044 1

原创 魔鬼R包—SNPassoc的下载与安装

前言部分一般2-3段:内容包括研究因素、研究结局、两者研究现状并提出研究问题和意义。

2022-01-04 16:48:41 2161 2

空空如也

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