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原创 从 NCBI 上下载基因组、cds、pep以及注释文件以大黄鱼为例

选择genome 后面搜索栏输入该物种拉丁学名。选择download下载基因组。选择下载的基因组及其注释文件。

2023-10-17 15:06:13 1374

原创 从Ensembl下载基因组

植物参考基因组:http://plants.ensembl.org/index.html。动物参考基因组:http://asia.ensembl.org/index.html。其他真菌细菌等参考基因组:http://ensemblgenomes.org/下载cds需要先选择parent directory(返回上一级)基因注释文件gff和gtf文件需要在上界面点。下滑菜单common name发现大黄鱼。选择gff3 gtf下载所需基因注释文件。选择进入cds、pep文件下载。

2023-10-17 14:14:34 1636

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