mpich配置

环境

mpich需要在每个机器上进行配置
操作都是相同的

需要实现安装gcc

mpich安装

关闭防火墙，免密码登陆

见torque配置

下载，解压

下载地址：http://www.mpich.org/downloads/

• 解压到文件夹中：

tar -zxvf mpich-3.2.tar.gz

我的路径是`/home/qsb/mpich`

编译安装

./configure
make
sudo make install

• 修改环境变量

sudo vim /etc/profile

export MPI_ROOT=/home/qsb/mpich
export PATH=$MPI_ROOT/bin:$PATH
export MANPATH=$MPI_ROOT/man:$MANPATH

• 查看是否安装成功

which mpiexec

显示路径就应该是你的安装路径

配置文件

需要一个machinefile文件

可以放在conf目录或者mpich目录下都可
格式：hostname:线程数

vim machinefilemachinefile

10.113.10.1:4
10.113.10.2:4
10.113.10.3:4
10.113.10.4:4
10.113.10.5:4

每台主机需要相同的machinefile文件

测试

单点运行

mpirun -np 4 ~/mpich/examples/cpi

多点并行

注意：多点并行的前提是每个节点下面都要有同一个文档（路径完全相同）
所以最好是配置共享文件夹（后面有）

mpiexec -n 4 -f ~/machinefile ~/mpich/examples/cpi

要想真正使用四台机器，需要-n参数稍大一点

（-n 16）

mpich 编译运行c语言文件（多点并行）

简单的打印”hello world”

#include <mpi.h>
#include <stdio.h>
#include <math.h>
int main(int argc,char* argv[])
{
    int myid, numprocs;
    int namelen;
    char processor_name[MPI_MAX_PROCESSOR_NAME];

    MPI_Init(&argc,&argv);/* 初始化并行环境 */
    MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD,&myid);/* 当前进程的ID号 */
    MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD,&numprocs);/* 进程的总? */
    MPI_Get_processor_name(processor_name,&namelen);/* 当前处理器的名称 */

    fprintf(stderr,"Hello World! Process %d of %d on %s\n",
                  myid, numprocs, processor_name);

    MPI_Finalize();/* 结束并行环境 */
    return 0;
}

编译运行

mpicc -o hello hello.c
mpirun -np 4 -f machinefile ./hello

补充：配置共享文件夹

共享目录：/data/sharefold

• 安装NFS
  其实有可能自带，如果使用的时候出现
  ntf unknow type
  最好还是安装一下

yum install nfs-utils
yum install portmap

• 配置NFS服务器
  我是在lk上面配置的

vim /etc/exports

#共享文件夹路径 其他主机地址||权限
/data/sharefold 10.113.10.1/5(insecure,rw,async,no_root_squash)

/data/sharefold  -->共享的文件夹路径
10.113.10.1/5    -->允许访问的IP号，当然也可以具体指定一个，比如192.168.2.11
(rw,sync,no_root_squash)  -->权限，和地址之间没有空格

• 使配置生效
  exportfs -r

• 重启服务
  sudo service nfs start

• 在其他主机上挂载共享文件夹
  最好是在其他主机上创建一个同名文件夹

sudo mount -t nfs 10.113.10.1:/data/sharefold /data/sharefold