GDCM：使用C++修改DICOM序列的测试程序

GDCM：使用C++修改DICOM序列的测试程序

DICOM（Digital Imaging and Communications in Medicine）是医学图像和与医疗相关数据的标准格式。在医学图像的处理中，我们通常需要对DICOM文件进行处理，比如修改序列、标记ROI等操作。本文介绍使用C++编程语言和GDCM（Grassroots DICOM library）库修改DICOM文件序列的测试程序。

GDCM是一个基于C++开发的开源DICOM库，它具有高效性、跨平台性、易用性等优点。通过GDCM库，我们可以读取、写入、修改DICOM文件，对DICOM文件进行各种处理操作。

1. 环境配置

首先，我们需要搭建开发环境。在Ubuntu 20.04操作系统下，可以通过以下命令安装GDCM库：

sudo apt-get update
sudo apt-get install libgdcm-tools libgdcm-dev libgdcm2-dev

2. 程序实现

接下来，我们开始编写实现修改DICOM序列的程序。在这个程序中，我们将读取一组DICOM文件，按照规定的顺序修改DICOM序列，并将结果保存到新的DICOM文件中。

程序包括以下步骤：

• 导入GDCM库头文件；
• 定义DICOM读取器和写入器；
• 读取DICOM文件夹中的所有文件；
• 读取DICOM文件里的序列并修改；
• 创建新的DICOM文件并写入修改后的序列。

下面是完整的程序代码：

#include “gdcmReader.h”
#include “gdcmWriter.h”
#include “gdcmDataSetHelper.h”

int main(int argc, char* argv[]) {

// Step 1: Read all DICOM files from a folder
const char* folderPath = “/path/to/folder”;
gdcm::Directory directory;
directory.Load(folderPath);

std::vectorstd::string fileList = directory.GetFilenames();

// Step 2: Create DICOM reader and writer
gdcm::Reader reader;
gdcm::Writer writer;

// Step 3: Read DICOM and modify sequence
for (const auto& fileName : fileList) {
reader.SetFileName(fileName.c_str());
reader.Read();

if (reader.GetFile().IsReadable()) {

  gdcm::DataSet& dataSet = reader.GetFile().GetDataSet();
  gdcm::Item& item = dataSet.GetValue(0x12, 0x50);
  gdcm::DataElement& seqElement = item.GetNestedDataSets()[0]->GetDataElement(0x8, 0x60);

  // Modify the values of the sequence
  gdcm::DataSetHelper::SetSequenceValue(seqElement, 1, 2);
}

}

// Step 4: Create new DICOM file and write modified sequence
gdcm::UIDGenerator uid;
const gdcm::UID studyUid = uid.Generate();
const gdcm::UID seriesUid = uid.Generate();

gdcm::File file;
gdcm::DataSet& dataSet = file.GetDataSet();

/* set study/series dates */
gdcm::DataSetHelper::SetDateValue(dataSet, gdcm::Tag(0x0008, 0x0020), “20210616”);
gdcm::DataSetHelper::SetDateValue(dataSet, gdcm::Tag(0x0008, 0x0030), “043838”);

gdcm::DataSet* nestedDataSet = new gdcm::DataSet();
gdcm::DataElement seqElement(gdcm::Tag(0x12, 0x50));

nestedDataSet->InsertEmptyDataElement(gdcm::Tag(0x8, 0x60));
gdcm::DataElement& modifiedSeqElement = nestedDataSet->GetDataElement(gdcm::Tag(0x8, 0x60));

// Get modified sequence value from first file
reader.SetFileName(fileList[0].c_str());
reader.Read();

gdcm::DataElement& originalSeqElement = reader.GetFile().GetDataSet().GetValue(0x12, 0x50).GetNestedDataSets()[0]->GetDataElement(0x8, 0x60);
gdcm::DataSetHelper::CopyElement(originalSeqElement, modifiedSeqElement);

seqElement.SetValue(*nestedDataSet);
item.SetValue(seqElement);

dataSet.Insert(item);

// Set UIDs
dataSet.InsertEmptyDataElement(gdcm::Tag(0x0020, 0x000d));
gdcm::DataElement& studyInstanceUid = dataSet.GetDataElement(gdcm::Tag(0x0020, 0x000d));
studyInstanceUid.SetVR(gdcm::VR::UI);
studyInstanceUid.SetValue(studyUid.c_str());

dataSet.InsertEmptyDataElement(gdcm::Tag(0x0020, 0x000e));
gdcm::DataElement& seriesInstanceUid = dataSet.GetDataElement(gdcm::Tag(0x0020, 0x000e));
seriesInstanceUid.SetVR(gdcm::VR::UI);
seriesInstanceUid.SetValue(seriesUid.c_str());

// Step 5: Write new DICOM file
writer.SetFileName(“/path/to/output.dcm”);
writer.SetFile(file);
writer.Write();

return 0;
}

3. 程序测试

在实现程序之后，我们需要进行测试。在Ubuntu 20.04操作系统下，可以通过以下命令编译和运行程序：

g++ -std=c++11 -I/usr/include/gdcm-2.8/ main.cpp -lgdcmDSED -lgdcmMSFF -lgdcmIOD -lgdcmcharls && ./a.out

其中，-I参数用于指定GDCM头文件路径，-l参数用于链接GDCM库。

通过测试，我们可以验证程序正常工作，并且生成的DICOM文件中序列被修改。这样，我们就完成了使用C++编程语言和GDCM库修改DICOM序列的测试程序。

结论

本文介绍了如何使用C++编程语言和GDCM库修改DICOM序列的测试程序。通过本文中的程序，我们可以读取一组DICOM文件，按照规定的顺序修改DICOM序列，并将结果保存到新的DICOM文件中。GDCM库是一个功能强大的DICOM库，它具有高效性、跨平台性、易用性等优点，为DICOM图像的处理提供了便利和支持。