后缀自动机学习小记

好像很久没有写blog了…

看的是CLJ的ppt，所以整篇的思路与ppt差不多

例题

【SPOJ】 Longest Common Substring II
题目大意：给出N(N <= 10)个长度不超过100,000的字符串，求他们的最长公共连续子串。
限制：
Time limit: 0.236s
Source limit: 50000B
Memory limit: 1536MB

分析

哈希

首先想到用二分+hash，这里不细讲了
但是O($LlogL$)的时间过不了这题

考虑更快的数据结构

由于字符串总长可以达到$10^6$，不能用后缀数组，考虑$O(N)$的算法

后缀自动机

预备

对于一个自动机A，若它能识别字符串S，则A(S)=True，否则A(S)=False
定义init为初始状态，end为结束状态集合，定义函数trans(s,str)表示状态s加入字符串str后到达的状态

定义Reg(s) 表示对于状态s开始能识别的字符串集合，即满足trans(s,str)∈end的字符串str的集合

定义

待处理字符串为S，下标从0开始
定义S[i,j]表示S的下标i..j-1的字串；Suffix(i)=S[i,|S|]；Suf为S的后缀集合，即Suffix(i)∈Suf [0≤i＜|S|]
Fac表示S的连续字串集合

S的后缀自动机（SAM）能识别S的所有后缀，但是我们要使它变成线性的，才能实现$O(n)$

转变为线性

right

定义st(str) 表示trans(init,str)

对于字符串a和b，如果b∈Reg(st(a)) ，即a的状态字符串ab能被SAM识别，那么ab是S的一个后缀，b也是一个后缀

所以，对于a=S[l..r] ，a能识别Suffix(r+1)

假设a在S中出现位置集合为{[l1,r1]，[l2,r2]……[ln,rn]}，Reg(st(a))就是{Suffix(r1)，Suffix(r2)……Suffix(rn)}

令right(a)={r1，r2……rn}，可以看出Reg(ST(a))由right(a)决定
一个显然的性质是，如果b是a的后缀，right(a)∈right(b)
令right(s) 表示状态s识别的所有子串的right的并集

对于r∈right(s)，只要再给定一个长度len，就可以确定一个子串S[r-len,r]
如果长度l,r是合适的，那么长度m[l≤m≤r]也合适，
即对于任意一个r∈right(s) ， right(S[r-m,r])是right(s)的子集
因此这个len是一个区间，记这个区间为[$min(s)$,$max(s)$]

对于两个right不同的状态a,b，它们的right分别记为ra,rb，如果ra∩rb≠∅，令r∈ra∩rb

由于ra≠rb，它们能确定的子串也不同，len区间[$min(a)$,$max(a)$]与[$min(b)$,$max(b)$]也不相交

所以可以令$max(a)$<$min(b)$，那么right(b)⊊right(a)

因此，对于任意两个right，它们要么不相交，要么一个是另一个的子集

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parent树

right集合是构成一棵数的，称其为parent树
假设字符串长度为n，那么parent树的叶子节点只有n个，并保证然后每个非叶子节点至少有2个儿子，那么树的大小是线性的

对于状态s，令fa表示parent树上它的父亲，即它的祖先中子树最小（right最小）的
因为fa的儿子至少有2个，即包含了其它状态s’，满足s’∩s=∅，所以right(fa)∩right(s)=right(s)≠right(fa)，并且max(fa)=min(s)-1

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边的线性

从上面可以确定状态的线性，现在看边的线性
令c=trans(a,b)[b为字符]，如果c不在end里，就不要这条边
如果c∈end，就状态a向状态c连一条标号为b的边

先得到SAM的一个生成树，以init为root，然后考虑非树边的构造：
对于init到一个end状态的一条路径：init到a的路径+(a—>c)+c到一个end状态的路径，这个路径是S的一个后缀
因此，一个非树边可能对应到多个后缀，如果将每个这样的后缀（只）对应上它经过的第一个非树边，那么同时非树边至少被一个后缀所对应。
因为后缀只有n个，所以非树边数不会超过n

构造

假设弄出来字符串T的SAM，在T后面加入字符x，令L=|T|
字符串Tx的后缀即T的后缀+x，所以可以用上次的结果来构造

设一个p，使right(p)={L}，然后考虑可以表示T的后缀的节点v1，v2…vk，那么v1=p，为了方便，令vi=parent(vi-1)（parent树上的父节点），那么vk为init，并有right={r1，r2…rn-1，rn==L}
添加了x后，令np表示st(Tx)，则right(np)={L+1}
如果从在SAM(T)中vi出发没有标号为x的边，那么v的right集合没有一个i[1≤i< n] 使T[ri+1]==x。
由于v1,v2…的right逐渐变大，对于vp出发有标号为x的边，vp+1…vk也有这样的边
对于vi[i< p]，它的right中只有rn是满足T[rn+1]=x的（rn=L），所以让它向np连一条标号为x的边

对于vp,令q=trans(vp,x)，显然q的right={r(i)+1}[i< n , T[ri]=x]
如果max(q)==max(vp)+1，就可以直接让parent(np)=q并直接结束：
假设vp…ve是一段有标号为x，指向q的边的v
如果max(q)==max(vp)+1，此时vp+1…ve中转移到q的串必定是p转移到q的串的后缀，所以这些字符串也必定出现在位置L+1（这句话有点难理解），就可以令right(q)=right(q)∪{L+1}
所以当Max(q)=Max(vp)+1，parent(np)=q

如果max(q)≠max(vp)+1，对于出现在vp前面任何一个节点vi，可以证明从vi转移到q的串一定不会出现在位置L+1。 如果还是令right(q)=right(q)∪{L+1}，就导致有些转移到q的串，它的right对不上
所以把q拆开，新建nq，前一部分的v的right不变，后一部分v的right要扩充，这样可以直接使right(nq)=right(q)∪{L+1}，然后
由于right(q)⊊right(nq)，parent(q)=nq，同时parent(np)也指向nq
因为nq代替了q，所以对于vp…ve改指向nq

然后就构出了SAM(Tx)

回到例题

只要把n个字符串弄到自动机里，并在过程中标记一下就可以做出来了，时间复杂度$O(L)$

附上sam主要部分的代码

struct SAM
{
    int sum,Max[maxM],Parent[maxM],e[maxM][10];
    void insert(int last,int ch)
    {
        int p=last,np=++sum;
        Max[np]=Max[p]+1;
        for (;p>=0 && !e[p][ch];p=Parent[p]) e[p][ch]=np;
        if (p<0) Parent[np]=0;else
        {
            int q=e[p][ch];
            if (Max[p]+1==Max[q]) Parent[np]=q;else
            {
                int nq=++sum;
                memcpy(e[nq],e[q],sizeof(e[q]));
                Parent[nq]=Parent[q];Max[nq]=Max[p]+1;
                Parent[np]=Parent[q]=nq;
                for (;p>=0 && e[p][ch]==q;p=Parent[p]) e[p][ch]=nq;
            }
        }
    }
}S;