anaconda 环境下 R 安装 USAboundaries

1. 问题

可能由于 naconda 中 USAboundaries 包过于久远，使用 conda install -c conda-forge r-usaboundaries 无法安装 USAboundaries

2. 解决方案

根椐 github 上的介绍，USAboundaries 的安装应分为两步：

• 首先安装 USAboundaries 程序
• 其次安装地图数据 UASboundariesData

devtools::install_github("ropensci/USAboundaries")
devtools::install_github("ropensci/USAboundariesData")

问题在于使用devtools 命令无法安装地图数据

为解决该问题使用本地安装的方式来安装地图数据：

• 首先从 github 下载地图数据
• 其次使用 devtools 命令进行本地安装
  

devtools::install_local("<zip所在目录>/USAboundariesData-main.zip")

• 使用 .packages(all.available = T) 查看效果
  

library(USAboundaries)
library(sf)
c18df <- us_states(map_date = as.Date("1820-01-01"))
ggplot() +
    geom_sf(data = c18df, color = "gray50", fill = NA)

3. 关于 R 包的管理

安装 R 包的几种方式：

• 从CRAN 安装

install.packages ("<pkg_name>")

• 从bioconductor安装
• R 版本小于3.5

source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("<pkg_name>")

• R 版本大于3.5

BiocManager::install("devtools")

• 从 GitHub 安装第三方包
  devtools 有两种方式：

其中A表示要从GitHub上安装的软件包的名称，B表示开发该程序包的作者

devtools::install_github("A", "B")

devtools::install_gtihub("B/A")

remotes 可以从 Biocondictor 维护的 GitHub 库中安装第三方包

remotes::install_git('https://git.bioconductor.org/packages/<pkg_name>')

• 本地安装
  （1）R 自带的安装方式

install.packages("<pag_name>",repos = NULL,type = "source")

（2）devtools 安装

devtools::install_local("<pkg_name>")

对 R 包进行管理

• 查看当前加载的包

(.packages())

• 御载当前加载的包

detach("<pag_name>")

• 查找安装的包

find.package("<pkg_name>")

• 查看包的安装位置

.libPaths()

• 查看所有已安装的包

.packages(all.available = T)