使用BrainStrom进行脑电溯源可视化

最近在做LORETA脑电溯源,找了很多资料下了一些软件比如LORETA和一些matlab插件都难用的很,最后找到了brainstorm进行了一些溯源,最后效果还不错,记录一下操作过程。
一开始找到了2019版的brainstorm但是没办法更新,可能是因为网的原因一更新就卡死。
我又找到了2023最新的brainstorm,终于可以用了。

链接:https://pan.baidu.com/s/1G5gsA0sMHKaLJCcoasdyEA?pwd=515w
提取码:515w

使用教程

  • 导入文件夹后命令行直接使用
    在这里插入图片描述
  • 界面
    插件界面
  • 第一步创建protocol
    File->Create protocol->
    在这里插入图片描述
    这里没有自己的anatomy,建议最好使用默认anatomy
    在这里插入图片描述
  • 导入脑电数据
    导入数据可以是FMRI,可以是EEG,我是EEG数据。
    在这里插入图片描述
    选择自己数据的选项采样率单位什么的。
    在这里插入图片描述
    导入数据后格式如下:
    在这里插入图片描述
  • 选择电极文件
    我的数据是128导的,所以我选择了默认提供的BioSemi 128 A1模板
    在这里插入图片描述
  • 计算 Noise covariance
    在这里插入图片描述
    这里我虽然导入了多个文件,但是只计算了第一个文件的Noise covariance,后续也基本都是以第一个文件为例。
  • 计算 Data covariance
    在这里插入图片描述
  • Compute head model
    在这里插入图片描述
    这里我使用的是3-shell sphere,比较简单,不用额外下载
    点击OK
    在这里插入图片描述
  • 溯源
    前面步骤都完成,可以开始计算了
    在这里插入图片描述
    在这里插入图片描述
    选sLORETA,Loose constraints 可以选择要展示的阈值范围,越接近1,展示的数据越多,默认0.2,觉得效果一般可是设高点。

计算完毕
在这里插入图片描述

  • 双击,展示效果
    在这里插入图片描述
    3D效果图,可以拖动展示,这是某一时刻的,如果是ERP数据可能因为时间不同变化比较大。
  • 操作选项
    在这里插入图片描述
    右边侧栏,可以调时间点,滤波等等,我的数据已经预处理过,且是静息态的,所以就不动了。
  • 重点! 选择溯源的脑区模板
    在这里插入图片描述
    这里可以选择使用可用的脑区划分模板,本来想用AAL90发现好像默认模板,又没有找到,最后选择使用DK
    在这里插入图片描述
  • ROI脑区划分可视化
  • 在这里插入图片描述
    现在脑皮层有了区域划分,可以帮我们有效看到到底是哪个区域出现问题。
    这是默认显示全部ROI脑区的情况,可以选择sel只选择对比效果强烈的来展示。
    在这里插入图片描述
    还有很多操作,各位自行探索吧。

第一次使用Brainstorm,肯定有很多不准确的地方,希望各位批评指正。

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