序
最近在做LORETA脑电溯源,找了很多资料下了一些软件比如LORETA和一些matlab插件都难用的很,最后找到了brainstorm进行了一些溯源,最后效果还不错,记录一下操作过程。
一开始找到了2019版的brainstorm但是没办法更新,可能是因为网的原因一更新就卡死。
我又找到了2023最新的brainstorm,终于可以用了。
链接:https://pan.baidu.com/s/1G5gsA0sMHKaLJCcoasdyEA?pwd=515w
提取码:515w
使用教程
- 导入文件夹后命令行直接使用
- 界面
- 第一步创建protocol
File->Create protocol->
这里没有自己的anatomy,建议最好使用默认anatomy
- 导入脑电数据
导入数据可以是FMRI,可以是EEG,我是EEG数据。
选择自己数据的选项采样率单位什么的。
导入数据后格式如下:
- 选择电极文件
我的数据是128导的,所以我选择了默认提供的BioSemi 128 A1模板
- 计算 Noise covariance
这里我虽然导入了多个文件,但是只计算了第一个文件的Noise covariance,后续也基本都是以第一个文件为例。 - 计算 Data covariance
- Compute head model
这里我使用的是3-shell sphere,比较简单,不用额外下载
点击OK
- 溯源
前面步骤都完成,可以开始计算了
选sLORETA,Loose constraints 可以选择要展示的阈值范围,越接近1,展示的数据越多,默认0.2,觉得效果一般可是设高点。
计算完毕
- 双击,展示效果
3D效果图,可以拖动展示,这是某一时刻的,如果是ERP数据可能因为时间不同变化比较大。 - 操作选项
右边侧栏,可以调时间点,滤波等等,我的数据已经预处理过,且是静息态的,所以就不动了。 - 重点! 选择溯源的脑区模板
这里可以选择使用可用的脑区划分模板,本来想用AAL90发现好像默认模板,又没有找到,最后选择使用DK
- ROI脑区划分可视化
现在脑皮层有了区域划分,可以帮我们有效看到到底是哪个区域出现问题。
这是默认显示全部ROI脑区的情况,可以选择sel只选择对比效果强烈的来展示。
还有很多操作,各位自行探索吧。
第一次使用Brainstorm,肯定有很多不准确的地方,希望各位批评指正。