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RSS订阅转载 用FastQC检查高通量测序原始数据的质量
本篇文章，主要参考了阳光1986的博文（http://www.dxy.cn/bbs/topic/31324367），自己测序的分析结果作为对比，加在其中了。 1.简介 当二代测序的原始数据拿到手之后，第一步要做的就是看一看原始reads的质量。常用的工具就是fastqc (http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fas...
2015-12-26 20:09:00
1509
转载 BWA manual reference page
1. 简介: BWA 是一种能够将差异度较小的序列比对到一个较大的参考基因组上的软件包。它由三个不同的算法：BWA-backtrack, BWA-SW 和 BWA-MEM; BWA-backtrack 是用来比对 Illumina 的序列的，reads 长度最长能到 100bp，而 BWA-SW 和 BWA-MEM 适用于更长一点的序列，可以从 70bp 到 1Mbp. BWA-S...
2015-12-24 15:05:00
248
空空如也
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