Linux性能优化从入门到实战：15 文件系统篇：磁盘 I/O

磁盘

  磁盘是可以持久化存储的设备，按照存储介质来分类：
  （1）机械磁盘（硬盘驱动器，Hard Disk Driver，HDD），主要由盘片和读写磁头组成，数据就存储在盘片的环状磁道中。在读写数据前，需要移动读写磁头，定位到数据所在的磁道，然后才能访问数据。如果 I/O 请求刚好连续，那就不需要磁道寻址，自然可以获得最佳性能，这就是连续 I/O 的工作原理。与之相对应的，当然就是随机 I/O，它需要不停地移动磁头，来定位数据位置，所以读写速度就会比较慢。机械磁盘的最小读写单位是 512 字节的扇区，但对逻辑块的管理是 4KB。
  （2）固态磁盘（Solid State Disk，SSD），由固态电子元器件组成。固态磁盘不需要磁道寻址，所以，不管是连续 I/O，还是随机 I/O 的性能，都比机械磁盘要好得多。但固态磁盘也存在“先擦除再写入”的限制，随机读写会导致大量的垃圾回收，所以相对应的，随机 I/O 的性能比起连续 I/O 来，也还是差了很多。固态磁盘的最小读写单位是 4KB、8KB等的页。

  综上，无论机械磁盘，还是固态磁盘，相同磁盘的随机 I/O 都要比连续 I/O 慢很多。并且连续 I/O 还可以通过预读的方式，来减少 I/O 请求的次数，这也是其性能优异的一个原因。

  按照接口来分类，可以把硬盘分为 IDE（Integrated Drive Electronics）、SCSI（Small Computer System Interface） 、SAS（Serial Attached SCSI） 、SATA（Serial ATA） 、FC（Fibre Channel） 等。不同的接口，往往分配不同的设备名称。比如， IDE 设备会分配一个 hd 前缀的设备名，SCSI 和 SATA 设备会分配一个 sd 前缀的设备名。如果是多块同类型的磁盘，就会按照 a、b、c 等的字母顺序来编号。

  按照使用方式来分类，又可以把它们划分为多种不同的架构：
  （1）作为独立磁盘设备来使用，往往还需要进行逻辑分区，每个分区再用数字编号： /dev/sda 设备分为 /dev/sda1 和 /dev/sda2。
  （2）把多块磁盘组合成一个逻辑磁盘，构成冗余独立磁盘阵列，RAID（Redundant Array of Independent Disks），从而可以提高数据访问的性能，并且增强数据存储的可靠性。根据容量、性能和可靠性需求的不同，RAID 一般可以划分为多个级别，如 RAID0、RAID1、RAID5、RAID10 等。RAID0 有最优的读写性能，但不提供数据冗余的功能。而其他级别的 RAID，在提供数据冗余的基础上，对读写性能也有一定程度的优化。
  （3）将磁盘组合成一个网络存储集群，NFS、SMB、iSCSI。

  磁盘是作为一个块设备来管理的，也就是以块为单位读写数据，并且支持随机读写。每个块设备都会被赋予两个设备号，分别是主、次设备号。主设备号用在驱动程序中，用来区分设备类型；而次设备号则是用来给多个同类设备编号。

通用块层

  为了减小不同块设备的差异带来的影响，Linux 通过一个统一的通用块层，来管理各种不同的块设备，是处在文件系统和磁盘驱动中间的一个块设备抽象层，有两功能：
  （1）跟虚拟文件系统的功能类似。向上，为文件系统和应用程序，提供访问块设备的标准接口；向下，把各种异构的磁盘设备抽象为统一的块设备，并提供统一框架来管理这些设备的驱动程序。
  （2）通用块层还会给文件系统和应用程序发来的 I/O 请求排队（ I/O 调度），并通过重新排序、请求合并等方式，提高磁盘读写的效率。

四种 I/O 调度算法：
   （1）NONE ，完全不使用任何 I/O 调度器，对文件系统和应用程序的 I/O 其实不做任何处理，常用在虚拟机中（此时磁盘 I/O 调度完全由物理机负责）。
   （2）NOOP ，是最简单的一种 I/O 调度算法。它实际上是一个先入先出的队列，只做一些最基本的请求合并，常用于 SSD 磁盘。
   （3）CFQ（Completely Fair Scheduler），也被称为完全公平调度器，是现在很多发行版的默认 I/O 调度器，它为每个进程维护了一个 I/O 调度队列，并按照时间片来均匀分布每个进程的 I/O 请求，CFQ 还支持进程 I/O 的优先级调度，所以它适用于运行大量进程的系统，像是桌面环境、多媒体应用等。
   （4）DeadLine 调度算法，分别为读、写请求创建了不同的 I/O 队列，可以提高机械磁盘的吞吐量，并确保达到最终期限（deadline）的请求被优先处理。DeadLine 调度算法，多用在 I/O 压力比较重的场景，比如数据库等。

I/O 栈

  由上到下分为三个层次，分别是文件系统层、通用块层和设备层。
  （1）文件系统层，包括虚拟文件系统和其他各种文件系统的具体实现。它为上层的应用程序，提供标准的文件访问接口；对下会通过通用块层，来存储和管理磁盘数据。
  （2）通用块层，包括块设备 I/O 队列和 I/O 调度器。它会对文件系统的 I/O 请求进行排队，再通过重新排序和请求合并，然后才要发送给下一级的设备层。
  （3）设备层，包括存储设备和相应的驱动程序，负责最终物理设备的 I/O 操作。

  存储系统的 I/O ，通常是整个系统中最慢的一环。所以， Linux 通过多种缓存机制来优化 I/O 效率：
  （1）使用页缓存、索引节点缓存、目录项缓存等多种缓存机制优化文件访问的性能；
  （2）使用缓冲区，来缓存块设备的数据的访问效率。

磁盘性能指标

• 使用率，是指磁盘处理 I/O 的时间百分比。过高的使用率（比如超过 80%），通常意味着磁盘 I/O 存在性能瓶颈。使用率只考虑有没有 I/O，而不考虑 I/O 的大小，即当使用率是 100% 的时候，磁盘依然有可能接受新的 I/O 请求。
• 饱和度，是指磁盘处理 I/O 的繁忙程度。过高的饱和度，意味着磁盘存在严重的性能瓶颈。当饱和度为 100% 时，磁盘无法接受新的 I/O 请求。
• IOPS（Input/Output Per Second），是指每秒的 I/O 请求数。
• 吞吐量，是指每秒的 I/O 请求大小。
• 响应时间，是指 I/O 请求从发出到收到响应的间隔时间。

  不要孤立地去比较某一指标，而要结合读写比例、I/O 类型（随机还是连续）以及 I/O 的大小，综合来分析。比如：在数据库、大量小文件等这类随机读写比较多的场景中，IOPS 更能反映系统的整体性能；而在多媒体等顺序读写较多的场景中，吞吐量才更能反映系统的整体性能。

  磁盘 I/O 性能基准测试：fio（https://linux.die.net/man/1/fio），测试出不同 I/O 大小（一般是 512B 至 1MB 中间的若干值）分别在随机读、顺序读、随机写、顺序写等各种场景下的性能情况。通过用性能工具得到的这些指标，可以作为后续分析应用程序性能的依据。

（1）iostat 分析系统整体 io 情况

  iostat 是磁盘 I/O 性能观测工具，指标来自 /proc/diskstats。

• %util ，就是我们前面提到的磁盘 I/O 使用率；
• r/s+ w/s ，就是 IOPS；
• rkB/s+wkB/s ，就是吞吐量；
• r_await+w_await ，就是响应时间。
• 结合请求的大小（ rareq-sz 和 wareq-sz）一起分析

$ iostat -d -x 1  -d -x 表示显示所有磁盘 I/O 的指标
Device            r/s     w/s     rkB/s     wkB/s   rrqm/s   wrqm/s  %rrqm  %wrqm r_await w_await aqu-sz rareq-sz wareq-sz  svctm  %util 
loop0            0.00    0.00      0.00      0.00     0.00     0.00   0.00   0.00    0.00    0.00   0.00     0.00     0.00   0.00   0.00 
loop1            0.00    0.00      0.00      0.00     0.00     0.00   0.00   0.00    0.00    0.00   0.00     0.00     0.00   0.00   0.00 
sda              0.00    0.00      0.00      0.00     0.00     0.00   0.00   0.00    0.00    0.00   0.00     0.00     0.00   0.00   0.00 
sdb              0.00    0.00      0.00      0.00     0.00     0.00   0.00   0.00    0.00    0.00   0.00     0.00     0.00   0.00   0.00 

（2）pidstat、iotop 定位具体的进程 io 情况

  pidstat 实时查看具体进程的磁盘 I/O 情况：

$ pidstat -d 1 
13:39:51      UID       PID   kB_rd/s   kB_wr/s kB_ccwr/s iodelay  Command 
13:39:52      102       916      0.00      4.00      0.00       0  rsyslogd

• 用户 ID（UID）和进程 ID（PID） 。
• 每秒读取的数据大小（kB_rd/s） ，单位是 KB。
• 每秒发出的写请求数据大小（kB_wr/s） ，单位是 KB。
• 每秒取消的写请求数据大小（kB_ccwr/s） ，单位是 KB。
• 块 I/O 延迟（iodelay），包括等待同步块 I/O 和换入块 I/O 结束的时间，单位是时钟周期。

  iotop 按照 I/O 大小对进程排序：
  因为缓存、缓冲区、I/O 合并等因素的影响，它们可能并不相等，进程的磁盘读写大小总数和磁盘真实的读写大小总数并不相等。

$ iotop
Total DISK READ :       0.00 B/s | Total DISK WRITE :       7.85 K/s 
Actual DISK READ:       0.00 B/s | Actual DISK WRITE:       0.00 B/s 
  TID  PRIO  USER     DISK READ  DISK WRITE  SWAPIN     IO>    COMMAND 
15055 be/3 root        0.00 B/s    7.85 K/s  0.00 %  0.00 % systemd-journald 

  线程 ID、I/O 优先级、每秒读磁盘的大小、每秒写磁盘的大小、换入和等待 I/O 的时钟百分比。

（3）strace 、lsof 定位具体进程的系统调用 和 打开的文件

  strace 查看指定进程的系统调用情况，查看 write 函数的情况：
  -f 可以追踪多线程和多进程：写文件是由子线程执行的，所以直接strace跟踪进程没有看到write系统调用，可以通过pstree查看进程的线程信息，再用strace跟踪。或者，通过strace -fp pid 跟踪所有线程。
  -e fdatasync 追踪具体的 fdatasync 函数

$ strace -f -T -tt -p 9085  # -f 表示跟踪子进程和子线程，-T 表示显示系统调用的时长，-tt 表示显示跟踪时间
[pid  9085] 14:20:16.826131 epoll_pwait(5, [{EPOLLIN, {u32=8, u64=8}}], 10128, 65, NULL, 8) = 1 <0.000055>
[pid  9085] 14:20:16.826301 read(8, "*2\r\n$3\r\nGET\r\n$41\r\nuuid:5b2e76cc-"..., 16384) = 61 <0.000071>
[pid  9085] 14:20:16.826477 read(3, 0x7fff366a5747, 1) = -1 EAGAIN (Resource temporarily unavailable) <0.000063>
[pid  9085] 14:20:16.826645 write(8, "$3\r\nbad\r\n", 9) = 9 <0.000173>
[pid  9085] 14:20:16.826907 epoll_pwait(5, [{EPOLLIN, {u32=8, u64=8}}], 10128, 65, NULL, 8) = 1 <0.000032>
[pid  9085] 14:20:16.827030 read(8, "*2\r\n$3\r\nGET\r\n$41\r\nuuid:55862ada-"..., 16384) = 61 <0.000044>
[pid  9085] 14:20:16.827149 read(3, 0x7fff366a5747, 1) = -1 EAGAIN (Resource temporarily unavailable) <0.000043>
[pid  9085] 14:20:16.827285 write(8, "$3\r\nbad\r\n", 9) = 9 <0.000141>
[pid  9085] 14:20:16.827514 epoll_pwait(5, [{EPOLLIN, {u32=8, u64=8}}], 10128, 64, NULL, 8) = 1 <0.000049>
[pid  9085] 14:20:16.827641 read(8, "*2\r\n$3\r\nGET\r\n$41\r\nuuid:53522908-"..., 16384) = 61 <0.000043>
[pid  9085] 14:20:16.827784 read(3, 0x7fff366a5747, 1) = -1 EAGAIN (Resource temporarily unavailable) <0.000034>
[pid  9085] 14:20:16.827945 write(8, "$4\r\ngood\r\n", 10) = 10 <0.000288>
[pid  9085] 14:20:16.828339 epoll_pwait(5, [{EPOLLIN, {u32=8, u64=8}}], 10128, 63, NULL, 8) = 1 <0.000057>
[pid  9085] 14:20:16.828486 read(8, "*3\r\n$4\r\nSADD\r\n$4\r\ngood\r\n$36\r\n535"..., 16384) = 67 <0.000040>
[pid  9085] 14:20:16.828623 read(3, 0x7fff366a5747, 1) = -1 EAGAIN (Resource temporarily unavailable) <0.000052>
[pid  9085] 14:20:16.828760 write(7, "*3\r\n$4\r\nSADD\r\n$4\r\ngood\r\n$36\r\n535"..., 67) = 67 <0.000060>
[pid  9085] 14:20:16.828970 fdatasync(7) = 0 <0.005415>
[pid  9085] 14:20:16.834493 write(8, ":1\r\n", 4) = 4 <0.000250>

  lsof 查看指定进程打开的文件：

$ lsof -p 18940 
COMMAND   PID USER   FD   TYPE DEVICE  SIZE/OFF    NODE NAME 
python  18940 root  cwd    DIR   0,50      4096 1549389 / 
python  18940 root  rtd    DIR   0,50      4096 1549389 / 
… 
python  18940 root    2u   CHR  136,0       0t0       3 /dev/pts/0 
python  18940 root    3w   REG    8,1 117944320     303 /tmp/logtest.txt 

（4）filetop、opensnoop 动态追踪临时文件情况（追踪快速完成文件操作的情况）

  若上述工具不能定位出 write 函数，可能是快速完成文件操作的情况，则需要采用这两工具。
  filetop 动态跟踪内核中文件的读写情况，并输出线程ID（TID）、读写大小、读写类型以及文件名称，就可以找出调用频繁的文件。

$ sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys 4052245BD4284CDD 
$ echo "deb https://repo.iovisor.org/apt/$(lsb_release -cs) $(lsb_release -cs) main" | sudo tee /etc/apt/sources.list.d/iovisor.list 
$ sudo apt-get update 
$ sudo apt-get install bcc-tools libbcc-examples linux-headers-$(uname -r)
$ cd /usr/share/bcc/tools  # 切换到工具目录 
$ ./filetop -C  # -C 选项表示输出新内容时不清空屏幕 

TID    COMM             READS  WRITES R_Kb    W_Kb    T FILE 
514    python           0      1      0       2832    R 669.txt 
514    python           0      1      0       2490    R 667.txt 
514    python           0      1      0       2685    R 671.txt 
514    python           0      1      0       2392    R 670.txt 
514    python           0      1      0       2050    R 672.txt 

  opensnoop 动态跟踪内核中的 open 系统调用，这样就可以找出文件的路径。

$ opensnoop 
12280  python              6   0 /tmp/9046db9e-fe25-11e8-b13f-0242ac110002/650.txt 
12280  python              6   0 /tmp/9046db9e-fe25-11e8-b13f-0242ac110002/651.txt 
12280  python              6   0 /tmp/9046db9e-fe25-11e8-b13f-0242ac110002/652.txt 

PS

  nsenter - run program with namespaces of other processes

# 由于这两个容器共享同一个网络命名空间，所以我们只需要进入 app 的网络命名空间即可
$ PID=$(docker inspect --format {{.State.Pid}} app)
# -i 表示显示网络套接字信息
$ nsenter --target $PID --net -- lsof -i
COMMAND    PID            USER   FD   TYPE   DEVICE SIZE/OFF NODE NAME
redis-ser 9085 systemd-network    6u  IPv4 15447972      0t0  TCP localhost:6379 (LISTEN)
redis-ser 9085 systemd-network    8u  IPv4 15448709      0t0  TCP localhost:6379->localhost:32996 (ESTABLISHED)
python    9181            root    3u  IPv4 15448677      0t0  TCP *:http (LISTEN)
python    9181            root    5u  IPv4 15449632      0t0  TCP localhost:32996->localhost:6379 (ESTABLISHED)

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