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allen_jinjie
这个作者很懒,什么都没留下…
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解决 devtools::install_github 的 SSL/TLS connection failed 问题
使用 devtools 的 install_github 命令安装一个 R 包报了如下错误:Installation failed: schannel: failed to receive handshake, SSL/TLS connection failed百度了下,[已解决]failed to receive handshake ssl/tls connection failed ...原创 2019-12-03 09:37:03 · 17155 阅读 · 4 评论 -
R语言:本地安装OHDSI在GITHUB的DatabaseConnector包
一个R程序使用了 library(SqlRender) 和 library(devtools) 包,本地的R Version是3.3.1,报错说 devtools 不在这个版本里。于是下了 R-3.4.0,由于同时安装了32-bit和64-bit,在下载 devtools 其从 i386 下面查找依赖包,但是依赖的包都被下载到 x64 所在的文件夹里。所以我重装了R-3.4.0,这次只安装 64-原创 2017-05-11 11:29:39 · 4439 阅读 · 0 评论 -
Java调用基于 R 的 One-Way ANOVA检测
本文主要说下面三点:1. R 的 ANOVA 测试默认是基于 Type I Sum of Squares,而 SPSS 默认则是 Type III 平方和的,所以需要对 R 做修改;2. 普通应用上,都是准备好一个 excel 文件,里面包含一个二维矩阵作为 SPSS / R 的数据输入;而 java 则是逐个计算变量 (列)的值,怎么构建 java -> R 的数据桥梁?3. jav原创 2017-09-14 17:03:53 · 1133 阅读 · 0 评论 -
使用 Rserve 实现 R 程序的复杂数据返回
在 RCaller 无法返回复杂数据的研究 我们知道 RCaller 无法处理复杂数据的返回,那么就看看其他工具吧,比如 Rserve。使用下来的感觉是 Rserve 虽然能把值都给你,但是怎么获取却是一个艰难的过程,比如和 RCaller 一样,对矩阵值的读取也是先列后行,定位到具体的值的变量上,API 显然没有与时俱进,不用泛型,使用古老的 Vector 类型,经常要强制转型,要不是 de原创 2017-09-22 16:10:32 · 999 阅读 · 0 评论 -
R 生成图片的中文问题
使用下面的命令生成图片的 PDF 文件,则中文无法显示,同时,如果使用 RCaller 的 java 库执行时,程序会直接报错的,大意就是无法识别中文字符。> pdf('logistic_roc_graph2.pdf')> plot(ss,main='logistic', xlab='1-specific', ylab='灵敏度')There were 18 warnings (u...原创 2018-04-10 15:55:56 · 1608 阅读 · 0 评论 -
install_github无法下载 R 包的变通方法
---------------update on 2019/12/03----------------今天要下载一个 fifer 的包,由于这个包已经不在 CRAN 上面了,无法按照下文从 github 上下载源码(找不到源码仓库)然后install.packages 的方式安装了。Google 了一下,How to install a package not located on ...原创 2018-04-03 16:47:55 · 20261 阅读 · 11 评论 -
使用SqlRender命令行将Sql Server语法的Sql转成Oracle
首先下载 SqlRender 包到本地,然后 Dos 进入 %R_HOME%/library/SqlRender/java 路径,可看见 SqlRender.jar :进入该目录,然后照着例子做就可以将 Sql 文件从 Sql Server 转成 Oracle,比如命令:java -jar SqlRender.jar D:/software/R-3.4.3/library/DrugsInPeds/...原创 2018-04-04 10:35:40 · 507 阅读 · 0 评论 -
自己碰到的 R : invalid multibyte string 的原因
今天替客户做一个研究,用的是一个开源的库,github: Participate on HypertensionCombination study代码有好几个 bug, 比如 CreateCohorts.R 文件的第 25 - 41 行是创建 EXPOSURETABLE / OUTCOMETABLE 表的,但是却被注释掉了,导致 ca_cohort_per_protocol.sql 第 619...原创 2018-09-28 16:41:23 · 11284 阅读 · 3 评论