最长公共子序列(易理解)

最长公共子串(Longest Common Substirng)和最长公共子序列(Longest Common Subsequence,LCS)的区别为:子串是串的一个连续的部分,子序列则是从不改变序列的顺序,而从序列中去掉任意的元素而获得新的序列;也就是说,子串中字符的位置必须是连续的,子序列则可以不必连续。

一: 作用

       最长公共子序列的问题常用于解决字符串的相似度,是一个非常实用的算法,作为码农,此算法是我们的必备基本功。

二:概念

     举个例子,cnblogs这个字符串中子序列有多少个呢?很显然有27个,比如其中的cb,cgs等等都是其子序列,我们可以看出

子序列不见得一定是连续的,连续的那是子串。

     我想大家已经了解了子序列的概念,那现在可以延伸到两个字符串了,那么大家能够看出:cnblogs和belong的公共子序列吗?

在你找出的公共子序列中,你能找出最长的公共子序列吗?

从图中我们看到了最长公共子序列为blog,仔细想想我们可以发现其实最长公共子序列的个数不是唯一的,可能会有两个以上,

但是长度一定是唯一的,比如这里的最长公共子序列的长度为4。

 

三:解决方案

<1> 枚举法

       这种方法是最简单,也是最容易想到的,当然时间复杂度也是龟速的,我们可以分析一下,刚才也说过了cnblogs的子序列

个数有27个 ,延伸一下:一个长度为N的字符串,其子序列有2N个,每个子序列要在第二个长度为N的字符串中去匹配,匹配一次

需要O(N)的时间,总共也就是O(N*2N),可以看出,时间复杂度为指数级,恐怖的令人窒息。

 

<2> 动态规划

      既然是经典的题目肯定是有优化空间的,并且解题方式是有固定流程的,这里我们采用的是矩阵实现,也就是二维数组。

第一步:先计算最长公共子序列的长度。

第二步:根据长度,然后通过回溯求出最长公共子序列。

现有两个序列X={x1,x2,x3,...xi},Y={y1,y2,y3,....,yi},

设一个C[i,j]: 保存Xi与Yj的LCS的长度。

递推方程为:

不知道大家看懂了没?动态规划的一个重要性质特点就是解决“子问题重叠”的场景,可以有效的避免重复计算,根据上面的

公式其实可以发现C[i,j]一直保存着当前(Xi,Yi)的最大子序列长度。

复制代码
 1 using System;
 2 namespace ConsoleApplication2
 3 {
 4     public class Program
 5     {
 6         static int[,] martix;
 7 
 8         static string str1 = "cnblogs";
 9         static string str2 = "belong";
10 
11         static void Main(string[] args)
12         {
13             martix = new int[str1.Length + 1, str2.Length + 1];
14 
15             LCS(str1, str2);
16 
17             //只要拿出矩阵最后一个位置的数字即可
18             Console.WriteLine("当前最大公共子序列的长度为:{0}", martix[str1.Length, str2.Length]);
19 
20             Console.Read();
21         }
22 
23         static void LCS(string str1, string str2)
24         {
25             //初始化边界,过滤掉0的情况
26             for (int i = 0; i <= str1.Length; i++)
27                 martix[i, 0] = 0;
28 
29             for (int j = 0; j <= str2.Length; j++)
30                 martix[0, j] = 0;
31 
32             //填充矩阵
33             for (int i = 1; i <= str1.Length; i++)
34             {
35                 for (int j = 1; j <= str2.Length; j++)
36                 {
37                     //相等的情况
38                     if (str1[i - 1] == str2[j - 1])
39                     {
40                         martix[i, j] = martix[i - 1, j - 1] + 1;
41                     }
42                     else
43                     {
44                         //比较“左边”和“上边“,根据其max来填充
45                         if (martix[i - 1, j] >= martix[i, j - 1])
46                             martix[i, j] = martix[i - 1, j];
47                         else
48                             martix[i, j] = martix[i, j - 1];
49                     }
50                 }
51             }
52         }
53     }
54 }
复制代码

图大家可以自己画一画,代码完全是根据上面的公式照搬过来的,长度的问题我们已经解决了,这次要解决输出最长子序列的问题,

我们采用一个标记函数Flag[i,j],当

①:C[i,j]=C[i-1,j-1]+1  时 标记Flag[i,j]="left_up";    (左上方箭头)

②:C[i-1,j]>=C[i,j-1]   时 标记Flag[i,j]="left";          (左箭头)

③: C[i-1,j]<C[i,j-1]     时 标记Flag[i,j]="up";            (上箭头)

 

例如:我输入两个序列X=acgbfhk,Y=cegefkh。

复制代码
 1 using System;
 2 
 3 namespace ConsoleApplication2
 4 {
 5     public class Program
 6     {
 7         static int[,] martix;
 8 
 9         static string[,] flag;
10 
11         static string str1 = "acgbfhk";
12 
13         static string str2 = "cegefkh";
14 
15         static void Main(string[] args)
16         {
17             martix = new int[str1.Length + 1, str2.Length + 1];
18 
19             flag = new string[str1.Length + 1, str2.Length + 1];
20 
21             LCS(str1, str2);
22 
23             //打印子序列
24             SubSequence(str1.Length, str2.Length);
25 
26             Console.Read();
27         }
28 
29         static void LCS(string str1, string str2)
30         {
31             //初始化边界,过滤掉0的情况
32             for (int i = 0; i <= str1.Length; i++)
33                 martix[i, 0] = 0;
34 
35             for (int j = 0; j <= str2.Length; j++)
36                 martix[0, j] = 0;
37 
38             //填充矩阵
39             for (int i = 1; i <= str1.Length; i++)
40             {
41                 for (int j = 1; j <= str2.Length; j++)
42                 {
43                     //相等的情况
44                     if (str1[i - 1] == str2[j - 1])
45                     {
46                         martix[i, j] = martix[i - 1, j - 1] + 1;
47                         flag[i, j] = "left_up";
48                     }
49                     else
50                     {
51                         //比较“左边”和“上边“,根据其max来填充
52                         if (martix[i - 1, j] >= martix[i, j - 1])
53                         {
54                             martix[i, j] = martix[i - 1, j];
55                             flag[i, j] = "left";
56                         }
57                         else
58                         {
59                             martix[i, j] = martix[i, j - 1];
60                             flag[i, j] = "up";
61                         }
62                     }
63                 }
64             }
65         }
66 
67         static void SubSequence(int i, int j)
68         {
69             if (i == 0 || j == 0)
70                 return;
71 
72             if (flag[i, j] == "left_up")
73             {
74                 Console.WriteLine("{0}: 当前坐标:({1},{2})", str2[j - 1], i - 1, j - 1);
75 
76                 //左前方
77                 SubSequence(i - 1, j - 1);
78             }
79             else
80             {
81                 if (flag[i, j] == "up")
82                 {
83                     SubSequence(i, j - 1);
84                 }
85                 else
86                 {
87                     SubSequence(i - 1, j);
88                 }
89             }
90         }
91     }
92 }
复制代码

由于直接绘图很麻烦,嘿嘿,我就用手机拍了张:

好,我们再输入两个字符串:

1         static string str1 = "abcbdab";
2 
3         static string str2 = "bdcaba";

通过上面的两张图,我们来分析下它的时间复杂度和空间复杂度。

时间复杂度:构建矩阵我们花费了O(MN)的时间,回溯时我们花费了O(M+N)的时间,两者相加最终我们花费了O(MN)的时间。

空间复杂度:构建矩阵我们花费了O(MN)的空间,标记函数也花费了O(MN)的空间,两者相加最终我们花费了O(MN)的空间。



最长公共子序列的长度的动态规划方程

    设有字符串a[0...n]b[0...m],下面就是递推公式。字符串a对应的是二维数组num的行,字符串b对应的是二维数组num的列。

 


最长公共子序列的长度的动态规划方程

    设有字符串a[0...n]b[0...m],下面就是递推公式。字符串a对应的是二维数组num的行,字符串b对应的是二维数组num的列。

 

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