用SPS来存放内容还是用WSS来存放内容?

今天看到kaneboy的 一篇评论说: 
只所以当初这么设计，是不鼓励使用区域作为内容的“存放”地，而鼓励使用单独的站点来保存各个部门和组织的文档数据，区域只用来对所有站点中的内容进行分类、检索。

对于这一点我一直是有困惑的.用sps来存放和用wss来存放到底有什么本质的区别呢,仅仅只是在于对权限的管理?对性能有什么影响,所有的数据还是存放在SQL SERVER的同一个库里啊?他所说的对内容进行分类/检索是指什么方式的实现呢?插入数据视图?分组列表?

在我实施的两个项目中基本上到后来都被客户要求把内容放到区域下.