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转载最大值，最小值，平均值，标准差的计算

用numpy函数可实现快速计算n [23]: import numpy as npIn [24]: data = [1, 2, 3]In [25]: np.mean(data)Out[25]: 2.0In [26]: np.sum(data)Out[26]: 6In [27]: np.max(data)Out[27]: 3In ...

2018-03-26 14:00:00 5248

转载自动设计引物的Python小程序

continue转载于:https://www.cnblogs.com/Zhu-Xueming/p/8646205.html

2018-03-25 19:37:00 707

转载 2018回归

从今天起，每天打卡开始，所谓的成功就是对一个目标的坚持。转载于:https://www.cnblogs.com/Zhu-Xueming/p/8640978.html

2018-03-24 19:17:00 160

转载你好2018

学习编程大业要告一段落了，2.17-3.17该复习考博内容了先把必要紧急的事情做完吧，反正好不容易有个名额，不试一试，怕自己以后后悔，努力了，也就不后悔转载于:https://www.cnblogs.com/Zhu-Xueming/p/8452312.html...

2018-02-17 23:04:00 100

转载年前休息 2018新的开始，加油

新的征程 2018奋斗争取一年攒十万块钱转载于:https://www.cnblogs.com/Zhu-Xueming/p/8447406.html

2018-02-13 21:16:00 76

转载 socket tcp/ip 之简单ssh协议

看了python核心编程和大牛的视频之后，自己动手也试了一试，写写笔记，加深一下印象首先服务端要导入socket模块，然后绑定地址和端口，并监听，然后进入等待接收来自客户端请求的一个循环，如果有数据来连接，则接收数据，整理后把请求的数据发给客户端。客户端则也是导入socket模块，连接地址和端口，然后是一个发送请求的循环，然后接收来自服务器的信息。所有的数据的发送与接收都是采...

2018-02-12 23:10:00 527

转载漫漫python路

今天记录一下心得，学python已经半年了，零零散散的学习，现在能写个小脚本，感觉还不错。能省去好长的时间做重复性的劳动，但是如果想成为一个程序猿的话，还差的远，到毕竟是学无止境嘛，只要时刻学习，总会有收获的。祝大家新的一年收获多多。转载于:https://www.cnblogs.com/Zhu-Xueming/p/8439858.html...

2018-02-10 21:59:00 80

转载 C语言之数据类型（int float double char unsigned ）

C语言用之前要声明数据类型，否则会出现问题1.int, unsigned int, long int, long long intC语言中默认的int是signed int，及分配一半的空间给负数。比如int有4个字节，一个字节有8bit。那么int的取值范围为-2^31（4*8-1）到2^31-1.绝对值相加即2^32-1.unsgined int 则没有负数，所以...

2018-02-10 16:24:00 770

转载 c语言的第一个程序

Hello world!1,程序中所用的是英文状态下的输入 2，开头的声明必不可少 3.每行命令以；分号为结束符 4，最后要有return 0.#include <stdio.h> /*编译预处理命令，c所必须*/int main(){ printf("hello world\n");/*打印输出*/ return 0;}...

2018-02-09 17:19:00 100

转载 socket之udp服务器和客户端

无连接的套接字主要协议是用户数据报协议缩写UDP。必须用SOCK_DGRAM, 即datagram(数据报)。udp服务器端：from socket import *from time import ctimeHOST = ''PORT = 21567BUFSIZ = 1024ADDR = (HOST, PORT)udpSerSock =...

2018-02-09 15:24:00 97

转载 socket编程TCP之服务器和客户端

服务端和客户端就像银行出纳员和客户样，一个银行出纳员（服务器），不吃不睡的服务排队的客户，每个客户都会有要解决的问题，一旦完成，客户就会走开，出纳员等待下一个客户的到来。面向连接的套接字：在进行通讯之前必须建立连接，主要协议是传输控制协议，简称TCP，TCP套接字的名字是SOCK_STREAM服务器端：from socket import *from time imp...

2018-02-08 18:05:00 104

转载正则表达式之优美匹配，视前匹配，视后匹配（?x）(?=) (?=)

接着昨天的内容今天探讨，优美匹配和视前和视后匹配1.格式化匹配import rereg = r'''(?x)(\d{4})? #匹配前四个支持注释 (-)? (\d{8})'''num = '0571-88982571, 0572-05975867,057269781578, 0539-6...

2018-02-07 19:42:00 332

转载正则表达式之match，search，findall, sub及扩展符号

正则表达式功能强大，但学习起来比较费事，今天来探讨一下match，search，findall, sub匹配规则1.match 只匹配开头的部分并且只匹配一次，否则返回为None匹配全部：import rereg = r'\w+@(\w+).com'pat = re.match(reg,'hello@qq.com hello@qq.com')print(p...

2018-02-06 19:24:00 272

转载今天回家了，立个Flag

今天回家了，立个Flag2018.02.05-208.02.251.每天坚持英语打卡2.把python核心编程看完3.把重点项目草稿写完4，每天随笔坚持写5.抽空看看python视频matplotlib numpy 和web框架等，转载于:https://www.cnblogs.com/Zhu-Xueming/p/8419417.html...

2018-02-05 20:59:00 76

转载 BeautifulSoup之select find和find_all

select find和find_all有什么区别呢，请看代码：from bs4 import BeautifulSouphtml ='''<head>hello python</head><body> <div class='ming'> <div class='lily' id='b...

2018-02-04 22:03:00 518

转载如何快速的把所有蛋白质结构域信息爬取出来并保存到excel

接着昨天的问题，如果把所有的假定蛋白的信息全都找出来并把所有的结构域信息提取出来该怎么弄呢？方案：1，从基因组数据库中找出所有的基因序列以及标注信息2，提取所有假定蛋白以及序列号3，把所有假定蛋白的结构域信息写入excel前两步筛选后发现大约有7000多个基因组假定蛋白，用爬虫的话NCBI网又很慢，就算一个5s，5*7500/3600 = 10h,太慢了，再加上网络不...

2018-02-03 21:59:00 1460

转载两个python程序搞定NCBI数据搜索并将结果保存到excel里面

最近有一大堆质谱数据，但好多蛋白都是已经研究过得，为了寻找和bait蛋白相关，但又特异的假定蛋白，决定写个Python程序过滤掉不需要的信息，保留想要的信息。方案：1，找出所有质谱数据中特异蛋白中的假定蛋白并按得分高低排序。2，根据蛋白序列号找出假定蛋白可能含有的结构域，写入excel文件。3，说干就干第一步主要用集合的性质去重，用re正则表达式找出序列号，用open...

2018-02-02 21:47:00 998

转载在notepad++上如何配置Python C 以及 java

今天尝试了在notepad上运行Python 和C 以及 java，倒腾了好久终于成功了1.notepad上运行Python首先需要安装一个插件：NppExec，下载地址：https://sourceforge.net/projects/npp-plugins/files/NppExec/NppExec%20Plugin%20v0.5.3/下载后将里面的NppExec....

2018-02-01 21:48:00 122

转载初识pandas

今天看了pandas官方文档，全英文的2259页，其中有一章节叫做10min to pandas,觉得挺好，所以打算记上一记。import pandas as pdimport numpy as npdates = pd.date_range('20180101',periods=6)df = pd.DataFrame(np.random.rand(6,4), i...

2018-01-31 21:32:00 76

转载关于搜索全部文件和修改文件名的方法os.walk() 和os.listdir

os.walk()遍历所有的文件并列出各级，os.listdir()只列出当前文件下的条目，一个列表1.os.walk() 大材小用。import ospath = 'j:\\juypter\\爬虫\\百度图片\\'for dirnames, subnames, files in os.walk(path):#父目录，子目录，文件名称 for file in...

2018-01-30 21:44:00 283

转载关于几种打开csv文件的探讨

.csv文件的打开方式可以用csv模块，也可以用打开txt的内置模块，个人感觉用open函数更好用一些1.用csv模块　它的问题是不能一下全部输出整个内容,若果向输出整个还得用append获得　import csvdata = csv.reader(open('hello.csv','r'))for line in data: print(line)...

2018-01-29 21:14:00 499

转载两种下载图片或视频的方法 urllib.request.urlretrieve 和write

urllib.request.urlretrieve 和write都可以实现图片的下载1.urllib.request.urlretrieveimport urllib.requesturl = r'https://ss2.bdstatic.com/70cFvnSh_Q1YnxGkpoWK1HF6hhy/it/u=1419207701,4272270283&...

2018-01-28 16:13:00 1104

转载如何获得网页中的json数据

在python抓取图片的时候，有时候却找不到对应的网址，可能存在json中，所以如何用python解析json数据，小白看了几个论坛后自己总结一些以便加深印象。1.requests.get(url,params) 获得请求数据import requestsdef get_many_pages(keyword, page): params = []#收集不同页面的...

2018-01-27 23:20:00 6493

转载关于BeautifulSoup 和 re 的探讨

个人觉得使用BeautifulSoup匹配网页标签内容比re更容易一些，re的规则比较多而且有些使用方法比较难，很容易匹配不到而soup方法在处理网页标签就特别容易，这和urllib.request.urlopen()和request.get()一样，后者要容易一些：1.re 正则表达式编译模式：这个匹配模式多次被使用content = 'who is xxoo.jpg,...

2018-01-27 00:20:00 1581

转载 If测试语句

在Python中if测试语句有：if | else， if | elif | else，if语句一般要遵循缩进规则if | else：条件测试：每一句都进行判断，第一个if成立也向下判断，各个if是平级的。if 1 in m1: 　　print(m1.index(1))if 2 in m1: 　　print(m1.index(2))else: 　　print('...

2018-01-25 17:32:00 289

转载今天记录一下自己的心情吧

今天心情真的像个大杂烩，文章又要返修，女友莫名生气，一大堆烦心事情，真的不想搞了。断断续续学了半年的python感觉还是在初级水平，掌握了基本的命令和语句，但还是只能写个小小的脚本，任重道远啊。本来想学习点计算机语言搞生物信息学。奈何根基太浅人家不要，最后是干了老本行。老板一直让读博，签工作的事情还没跟他说，哎真的是愁啊，房价还死贵，生活如此艰辛。但是。。。2018还是得继续努力...

2018-01-24 21:53:00 100

转载 python的语句

2018-01-23 20:36:00 120

转载 Python 的内置对象

Python中一切皆是对象，主要的内置对象有：1. 数字（整型int、浮点型float）2. 字符串（不可变性） 3.列表 4.字典 5.元组（不可变性） 6.文件 7.集合（不重复性）数字：支持+-*/运算，有强大的math模块>>> round(3.1415926,2)3.14（保留小数点位数）>>> num = '%.2f' %3.1...

2018-01-22 20:54:00 137

转载两种获得网页的方法比较urllib和requests

1.urllib方法import urllib.request#导入模块res = urllib.request.urlopen('http://www.sina.com.cn/')#打开网页html = res.read()#读取内容，二进制形式html = html.decode('utf-8')#转换为utf-8print(html)#输出&gt...

2018-01-21 14:07:00 102

转载关于Python是不是脚本语言的探讨

很多人认为Python是单纯的脚本语言，认为它是一门简单的语言。其实，脚本语言并不是所谓的简单，而是简洁。Python可以使得一些复杂的编程任务变得简单而不是简单的编程语言。所以要是给Python一个定义的话，它是一门多用途的编程语言，而不是简单的脚本语言。越来越多的用户选择Python，之所以选择Python的因素有：1，软件的质量，Python注重代码的可读性、一致性和可...

2018-01-21 13:11:00 428

转载 python每日一记目标

从今天起，要养成每天记笔记的习惯，把学到的点点滴滴记录下来，也算是成长吧转载于:https://www.cnblogs.com/Zhu-Xueming/p/8323848.html

2018-01-21 12:25:00 125

转载碱基序列转换成氨基酸序列

#!coding:utf-8# Author:pymingmingimport pyperclipdef code_table(): f = open('code.txt','r') s = f.readlines() l1,l2 = [],[] for line in s: key = line.split()[...

2018-01-04 09:09:00 5205

转载 python 之装饰器的应用

装饰器的作用：用来装饰特定函数，原则：不改变原来的函数代码，不改变函数调用方式，为函数增加新的功能应用：假设我定义了一个登录页面的函数，登录后显示登录成功，我想，在不修改函数的同时让每次登录有个验证用户名和密码的过程，登录成功则执行函数，不成功提醒用户重新输入。分析：1，定义一个函数 2，定义另一个函数，验证成功后执行这个函数命令#!coding:utf-8...

2017-10-31 09:07:00 63

转载 python 批处理excel文件实现数据的提取

import reimport xlrdf1 = open("v9_c8_a3_a16.txt","w")f2 = open("a9_not_c8a3a16.txt","w")f3 = open("c8_not_v9a3a16.txt","w")f4 = open("a3_not_v9c8a16.txt","w")f5 = open("a16_not_v9c8a3...

2017-10-25 22:14:00 263

转载 python 实现excel数据的提取和整理

#!coding:utf-8# Author:pymingmingimport xlrdimport refrom xlrd import open_workbookfrom xlutils.copy import copydef read(file, sheet_index=0): workbook = xlrd.open_workbook(fil...

2017-10-25 22:13:00 1830

转载正则表达式

 ?匹配零次或一次前面的分组。  *匹配零次或多次前面的分组。  +匹配一次或多次前面的分组。  {n}匹配 n次前面的分组。  {n,}匹配 n次或更多前面的分组。  {,m}匹配零次到 m次前面的分组。  {n,m}匹配至少 n次、至多m次前面的分组。  {n,m}?或*?或+?对前面的分组进行非贪心匹配。  ^spam意味着字符串必...

2017-10-25 08:50:00 58

转载 The zen of python

Beautiful is better than ugly.Explicit is better than implicit.Simple is better than complex.Complex is better than complicated.Flat is better than nested.Sparse is better than dense.Readability ...

2017-10-20 21:40:00 69

asd4172855的博客