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原创 连锁不平衡LD
从Resources中的1000 Genomes phase 3下载all_hg38.pgen.zst、all_hg38_rs.pvar.zst 、hg38_corrected.psam,并将all_hg38_rs.pvar.zst 改名为all_hg38.pvar.zst ,hg38_corrected.psam改名为hg38.psam。得到plink2.prune.in文件。
2024-06-19 10:11:01
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原创 富集分析 软件 g:Profiler 用法
另外值得注意的是,它可以接受不同类型的输入。1、点击Detailed Results,可以看到详细的结果。该热图中,横轴是基因名,纵轴是生物学通路,每一行代表一个通路上的基因集。其中还有矫正后的p值和GO号。2、如果分析人类表达量数据,建议剔除基因集小于10 的基因和大于1000的基因。Ordered query选项,该选项将输入视为有序基因列表,并在列表开头优先考虑具有较高突变ES的基因。3、该结果的保存方式有三种:GEM,PNG,和CSV。富集分析的结果可以通过一个瀑布图和分布热图来进行可视化。
2024-06-17 12:23:41
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空空如也
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