NeuroImaging
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这个作者很懒,什么都没留下…
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神经纤维束配准
神经纤维束配准技术, 线性&非线性;plus RAS LPI影像空间,配准基础知识原创 2023-10-18 20:23:07 · 215 阅读 · 0 评论 -
transformconvert: [ERROR] invalid first line (expected “#Insight Transform File V1.0“)
仿射变换矩阵从ANTs格式转成MRtrix3格式原创 2023-09-01 11:22:34 · 125 阅读 · 0 评论 -
M1 Mac使用Mrivew 显示神经纤维
由于苹果🍎把GLSL geometry shaders 改成了Metal API,所以无法以默认的mrview神经纤维显示参数启动。要解决,首先要打开~/.mrtrix.conf。改成下面的参数:Lines。原创 2023-08-14 19:59:20 · 91 阅读 · 0 评论 -
DIPY - Bundle-based Analysis,AFQ和BUAN,更新ing
大脑白质分析,神经纤维束分割,比较等,碎碎念,流水账记录。原创 2023-07-09 20:50:28 · 265 阅读 · 0 评论 -
输出FSL源python文件的方法
定制FSL文件,获取对应文件路径的方法。原创 2023-05-23 20:12:33 · 179 阅读 · 0 评论 -
安装dmri-amico
noddi包安装原创 2022-12-14 16:58:50 · 493 阅读 · 2 评论 -
Tensorflow 图学习 模型保存,导入,再训练,再保存。
入坑了tensorflow,使用图学习模型做无监督特征提取。主要是使用graph autoencoder(GAE) 提特征,然后做分类。因为已经有了经过预训练的网络,就想要使用预训练的网络权值做初始化,然后利用新的数据集重新训练网络。自己花了五天,踩了挺多莫名奇妙的坑,看到网上的教程很多,但是还没有一个是我这样的需求,就记录一下,分享下 踩坑经验。总结了一下,大概有这么三个命令十分关键,大部分的问题都来自这三个命令。 1. saver = tf.train.Saver() # tf.trainable原创 2021-12-09 14:51:33 · 635 阅读 · 0 评论 -
AttributeError: module ‘matplotlib.cbook‘ has no attribute ‘is_string_like‘
在使用matplotlib包画Networkx生成的networks时,会报 AttributeError: module 'matplotlib.cbook' has no attribute 'is_string_like' 这样的错误。不少的帖子都说将matplotlib版本降低,然而这样就无法使用3d的layout。pip install matplotlib==2.2.3.而实际上,这个问题是由于matplotlib的版本和Networkx不匹配而产生的。都使用最新的版本就没问题了。参考原创 2021-11-12 18:38:23 · 2751 阅读 · 1 评论 -
FSL 报错 module not found error, no module named “dicom.values“
FSL bug correction原创 2021-10-06 18:15:53 · 551 阅读 · 0 评论