DUKE大学BOE数据集 OCT图像积液分割数据集

HanWang~

已于 2023-03-21 10:02:57 修改

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分类专栏：图像处理文章标签： OCT 积液分割

于 2021-05-26 15:47:29 首次发布

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使用此数据集用来做积液分割研究

地址：http://people.duke.edu/~sf59/Chiu_BOE_2014_dataset.htm
图片来源：https://joi.usst.edu.cn/html/2021/3/20210305.htm

使用python将.mat转换为图片格式

#对BOE .MAT格式文件处理成图片
import cv2
import scipy.io as scio
import os

# [0,1]=>[0,255]
def changeImg(gray):
    H, W = gray.shape
    for i in range(0, W):
        for j in range(0, H):
            if gray[j, i] != 0:
                gray[j, i] = 255
    return gray

folder = 'BOE/2015_BOE_Chiu'
path = os.listdir(folder)
srcdst = 'BOE/img/srcimg/'
m1dst = 'BOE/img/m1img/'
m2dst = 'BOE/img/m2img/'

for each_mat in path:
    print(each_mat)
    first_name, second_name = os.path.splitext(each_mat)
    print('mat名',first_name,first_name[-2:])
    # 拆分.mat文件的前后缀名字，注意是**路径**
    # break
    each_mat = os.path.join(folder, each_mat)
    array_struct = scio.loadmat(each_mat)

    img_data = array_struct['images'] # 原图像
    src_count = img_data.shape[2] #图像个数
    # print(img_data[0][0],img_data[1],img_data[2])
    for i in range(src_count):
        cv2.imwrite(srcdst + first_name[-2:] + '/img' + first_name[-2:] +'index'+str(i)+ '.jpg', img_data[:, :, i])

    manual1_data = array_struct['manualFluid1']  # 标注1
    m1_count = manual1_data.shape[2] #图像个数
    for i in range(m1_count):
        manual1_img = changeImg(manual1_data[:, :, i])
        cv2.imwrite(m1dst + first_name[-2:] + '/img' + first_name[-2:] + 'index' + str(i) + '.jpg', manual1_img)

    manual2_data = array_struct['manualFluid2']  # 标注2
    m2_count = manual2_data.shape[2] #图像个数
    for i in range(m2_count):
        manual2_img = changeImg(manual2_data[:, :, i])
        cv2.imwrite(m2dst + first_name[-2:] + '/img' + first_name[-2:] + 'index' + str(i) + '.jpg', manual2_img)
    # break