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转载 centos设置连续登录3次密码错误自动锁定账户3分钟

centos设置连续登录3次密码错误自动锁定账户3分钟 root下在/etc/pam.d/sshd文件的#%PAM-1.0下加一行:#%PAM-1.0auth required pam_tally2.so deny=3 unlock_time...

2019-09-09 15:23:00 2208

转载 ubuntu安装显卡驱动

ubuntu安装显卡驱动 首先,lshw -numeric -C display 可以查看显卡型号开始安装一,第2次尝试:使用新立得软件包管理器安装(推荐)1,首先下载新立得软件包管理器: sudo apt-get install synaptic...

2019-08-16 14:57:00 275

转载 ubuntu中查看u盘的方法

ubuntu中查看u盘的方法 https://jingyan.baidu.com/article/a3aad71ae5e6bbb1fb009694.html在某些情况下,U盘内的文件查看不到,像是被隐藏了,此时需要通过终端来操作,将U盘挂载到文件系统。挂载前需要...

2019-08-09 09:44:00 10713

转载 如何将U盘启动盘复原成普通U盘

如何将U盘启动盘复原成普通U盘 https://jingyan.baidu.com/article/2f9b480dedf94e41ca6cc272.html p...

2019-08-09 09:03:00 356

转载 ubuntu将中文改为英文

ubuntu将中文改为英文 自从卸载了系统自带的python3导致依赖python3的软件,最直接的比如桌面,崩了以后,找了网上好多办法都没解决,而且报错提示一部分是中文的都是显示不出来,错也不知道错在哪!所以需要先将系统显示改为英文。修改文件如下:cde...

2019-08-08 20:27:00 231

转载 编译环境及编译器介绍

编译环境及编译器介绍 一、基本编译器介绍 集群配置有三套基本的编译器:1、GCC编译器,2、PGI编译器,3、INTEL编译器。介绍如下:二、MPI编译器MPI编译器实际上是MPI编译MPI程序所使用的编译命令。这些命令在执行过程中仍然调用上个表格中的基...

2019-07-19 21:59:00 1147

转载 linux下同步window的firefox

linux下同步window的firefox 原因:因为Windows下的Firefox使用的是本地服务,也就是中国版,但是linux自带的是国际版,使用的全球服务,所有两者同步不了.解决:将原来linux下自带的Firefox卸载,安装中国版(官网下载),然后...

2019-07-16 21:31:00 1011

转载 非root安装openmpi

非root安装openmpi 1、首先去官网(https://www.open-mpi.org/software/ompi/v4.0/)下载所需要的版本,注意最新的不一定是最适合你的需要的。我之所以需要安装是因为之前安装的1.8.4版本的lib文件夹下貌似没有共享库...

2019-07-16 17:22:00 842

转载 VI编辑器学习

VI编辑器学习 1、光标移动h,j,k,l 左,上,下,右 #10j“表示向下移动10行CTRL-G“命令,可以查看光标在文件中的位置0 跳至行首,不管有无缩进,就是跳到第0个字符^ 跳至行首的第一个字符5gg/5G 调至第5行5l ...

2019-07-14 23:51:00 139

转载 linux根目录解释说明

linux根目录解释说明 本来想探究一下linux根目录下的文件说明,但是进入根目录发现了除了目录还有几个文件,一个只有root具有读写权限的core文件,以及四个连接文件,看颜色还是软链接(软链接硬链接见 https://www.cnblogs.com/jsz...

2019-07-13 21:39:00 182

转载 高斯进行激发态计算

高斯进行激发态计算 原理:激发态:原子或分子吸收一定的能量后,电子被激发到较高能级但尚未电离的状态。每个态都有各自的势能面,都是几何坐标的函数。振子强度小于0.01可以认为跃迁禁阻激发态和基态具有不同的位能曲线和平衡核间距。激发态去活的途径有:①...

2019-07-12 22:41:00 3595

转载 Charmm-note

Charmm-note charmm_executable < charmm_script.inp > charmm_output.outcharmm –i 1.inp –o 1.outRTF(residue topology file):...

2019-07-12 22:39:00 848

转载 PS-note

PS-note 1、把多张图片快速制成Gif动态图,注意:(1)2017版本的保存为web所用格式的时候按ctrl+alt+shift+s(2)4,“仿色”是让模拟电脑系统没有的颜色,因为gif格式只有256种颜色,表示不出来的颜色只能去模拟相拟的代替,不选...

2019-07-12 22:34:00 116

转载 NAMD-note

NAMD-note Namd2-gpu +p20 conf > logcharm_run ++nodelist nodelist namd_2 +p80 ++ppn 20 ../../../ante/allff3/complex_popc/n...

2019-07-12 22:33:00 632

转载 序列相似性比较与同源性分析

序列相似性比较与同源性分析 首先应该注意区分序列相似性与序列同源性的关系,序列相似不一定同源,但是判定同源性关系的时候有些算法(Maximum likelihood除外)要考虑到序列相似性。序列相似性是将待研究序列与DNA或蛋白质序列库进行比较,用于确定该序列的生物...

2019-07-12 22:18:00 26163

转载 GROMACS-note

GROMACS-note Note from> http://jerkwin.github.io/GMX/GMXtut-1/1、生成拓扑>gmx_mpi pdb2gmx -f pro2.pdb -o pro2.gro -water TIP3P...

2019-07-12 22:17:00 241

转载 R-note

R-note *一些操作:运行R脚本:source (“Rscript”)当前目录下的文件:dir()*画图########R语言画图###RMSDgetwd()file <- read.csv("backbone_rmsd.csv...

2019-07-12 22:16:00 136

转载 pymol-note

pymol-note 一、Snapshot(用不同颜色显示蛋白不同二级结构,用不同颜色显示不同小分子,显示连键)>load name.pdb,name#>fetch object#>disable object-name#>e...

2019-07-12 22:14:00 510

转载 windows-note

windows-note 一、Cmd知识1、 chdir == pwd2、 想要切换到d盘,直接输入d:就行3、 改变命令行字体颜色:color[1,2,3…],改变背景和字体color[11,12,23..]还原直接color。二、PPT...

2019-07-12 22:11:00 126

转载 linux中设置免密登录远程服务器

linux中设置免密登录远程服务器 使用密钥登录(不使用密码)1、首先生成密钥,在任意目录下输入命令:ssh-keygen -t rsa -P ''-P表示密码,-P ''表示空密码之后系统会提示输入生成的密钥文件的文件名,可以输入任意名称,比如id_rsa,回车系...

2019-07-12 21:35:00 191

转载 linux分屏之terminator

linux分屏之terminator 以前在linux上没有使用分屏操作,有些时候需要打开两个终端,还得把他们对齐,甚是不方便相比于tmux需要记一些简单的快捷命令,terminator甚至连快捷命令都不用记,相当于windows的软件,右键就有分屏操作不过...

2019-07-12 20:54:00 295

转载 amber初学……

amber初学…… 以下是分子动力学模拟的一般性步骤, 具体的步骤和过程依赖于你研究的体系和所用的软件, 但这并不影响我们把它当作一个入门指南.1. 评估体系首先需要对我们要进行模拟的体系做一个简单的评估, 有三个问题是我们必须要明确的:2. 选择工...

2019-07-12 11:12:00 2985

转载 anaconda使用

anaconda使用 (1)一个python环境中需要有一个解释器(python2和python3),一个包集合(自带包和第三方包,后者一般通过pip下载)。(2)常用命令首先激活anaconda才能使用: conda activate*Conda --ve...

2019-07-12 11:09:00 84

转载 python中的一些语法

python中的一些语法 7、Writelines可以把一个列表挨行写进文件6、函数startswith,判断开头5、接收命令行中的参数>>>>argparse模块参考: https://www.cnblogs.com/y...

2019-07-12 11:08:00 100

转载 python中的OOP

python中的OOP 到目前为止,在我们的程序中,我们都是根据操作数据的函数或语句块来设计程序的。这被称为面向过程的编程。还有一种把数据和功能结合起来,用称为对象的东西包裹起来组织程序的方法。这种方法称为面向对象的编程理念。在大多数时候你可以使用过程性编程...

2019-07-12 11:06:00 165

转载 python中的模块

python中的模块 2、查看模块中的方法:(1)命令行下:pydoc os(2)交互模式:help(“os”)1、导入第三方模块。#包含模块代码的文件名就是模块名。(1)告诉编译器去哪里找模块。将写好的程序放进一个文件夹下,用sys去appen...

2019-07-12 11:05:00 92

转载 将python程序打包成exe

将python程序打包成exe 用pip安装pyinstaller,然后执行pyinstaller.exe -F -i code.ico ttest1.pyPS:如果不想让程序运行完就退出cmd窗口,最后用os.system(“pause”)...

2019-07-12 11:03:00 95

转载 python-执行过程

python-执行过程 3、Python的种类以及其执行过程先说我的理解:python是一个先编译再解释型语言。python.exe(python解释器)先将源码编译成字节码(.pyc,不是二进制码), 然后通过解释器解释成机器文件(二进制)。所以说pytho...

2019-07-12 11:01:00 133

转载 python基础

python基础 学习自廖雪峰博客29、web开发如果要学习Web开发,首先要对HTML、CSS和JavaScript作一定的了解。HTML定义了页面的内容,CSS来控制页面元素的样式,而JavaScript负责页面的交互逻辑。讲解HTML、CSS和JavaSc...

2019-07-10 21:51:00 142

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