- 博客(2)
- 收藏
- 关注
RSS订阅原创 pysam - 多种格式基因组数据（sam/bam/vcf/bcf/cram/…）读写与处理模块（python）
pysam - 多种格式基因组数据（sam/bam/vcf/bcf/cram/…）读写与处理模块（python） 在开发基因组相关流程或工具时，经常需要读取、处理和创建bam、vcf、bcf文件。目前已经有一些主流的处理此类格式文件的工具，如samtools、picard、vcftools、bcftools，但此类工具集成的大多是标准功能，在编程时如果直接调用的话往往显得不够灵活。 本文介绍的是一个处理基因组数据的python模块，它打包了htslib-1.3、samtools-1.3 和 bcf.
2020-08-24 13:37:37
2232
原创 Perl中here文档（=<<符号）的使用简介
Perl中的 = Perl中的here文档又称作heredoc、here字串或here脚本，是可以在shell命令行和程序语言（像Perl、PHP、Python等）里定义一个字串的方法。 使用概述： 1.使用 =。起始标识符与 = 2.标识符可以用任意其它字符代替，只需保证结束标识与开始标识一致。 3.结束标识必须顶格独自占一行(即必须从行首开始，前后不能衔接任何空白和字符)。
2017-12-19 20:43:15
2440
空空如也
空空如也
TA创建的收藏夹 TA关注的收藏夹
TA关注的人