hERG检测|hERG检测服务|钠通道检测|离子通道服务|钾离子通道

药物致心律失常的毒性,是新药研发征途中主要的潜在风险。它投下巨大的阴影,让人们忧虑:它掏出的老拳,会击碎那些如精灵般迷人的化合物。这,真是一出悲剧。于是,我们用hERG架起坚固的铁门,看上去简单而有效,结果却带来其他的烦恼: 这座巨门也阻挡了诸多安全有效的化合物。hERG是比较重要的衡量心脏毒性的标准,而且判断标准相对清晰。 学者做过总结: 20%+的 hERG 抑制率, 就可以在动作电位的 APD90 和心电图QT间期上产生可以检测到的延长。 对于单纯的hERG抑制剂,尤其如此。那么,在研发早期,该如何去合理地评价心脏毒性呢?背负hERG阴影的化合物能否得到救赎呢?

hERG抑制, QT间期延长 和TdP

  其实,hERG抑制和TdP的发生具有正相关,但非绝对的因果关系。

  首先: 仅凭hERG电生理的结果来评价化合物潜在的延长QT间隔的风险是远远不够的。有证据表明当药物hERG半抑制浓度超过其在血液中的浓度峰值的30倍左右时,是一个相对安全的范围。

  其次: 也是更为重要的如果化合物对Cav1.2.NaL (晚钠)的抑制效应,可以平衡或者抵消对hERG的作用,从而可宏观层面具有足够的安全边际(safety margin),结合动作电位的检测, 可以从作用机制是支持安全性的结论。

  多通道靶点检测

随机森林是一种集成学习方法,它由多个决策树组成。在随机森林中,每个决策树都是由随机选择的样本和特征训练而成的。这种随机性使得随机森林可以减少过拟合,并提高模型的泛化能力。 在sklearn中,可以使用RandomForestClassifier类来构建随机森林分类器。具体的步骤如下: 1. 导入数据 2. 划分数据集为训练集和测试集 3. 实例化RandomForestClassifier类 4. 训练模型 5. 预测测试集 6. 评估模型性能 下面是一个示例代码,用于基于随机森林模型预测hERG阻断剂活性: ```python from sklearn.ensemble import RandomForestClassifier from sklearn.model_selection import train_test_split from sklearn.metrics import accuracy_score import pandas as pd # 导入数据集 data = pd.read_csv('data.csv') # 划分数据集 X = data.drop(['hERG'], axis=1) y = data['hERG'] X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y, test_size=0.2, random_state=42) # 实例化随机森林分类器 rf = RandomForestClassifier(n_estimators=100, random_state=42) # 训练模型 rf.fit(X_train, y_train) # 预测测试集 y_pred = rf.predict(X_test) # 评估模型性能 print('Accuracy:', accuracy_score(y_test, y_pred)) ``` 在这个例子中,我们首先导入了数据集,然后将其划分为训练集和测试集。接着,我们实例化了一个随机森林分类器,并使用训练集训练了模型。最后,我们使用测试集进行预测,并计算了模型的准确率。 需要注意的是,这只是一个简单的示例代码,对于实际问题,需要根据具体情况进行调参和优化。
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