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RSS订阅原创 基因组编辑技术如何实现从“精雕细琢“到“大刀阔斧“的跨越？
本文内容速览：01植物基因组编辑简介植物基因组编辑技术历经了三十余年迭代，从早期特异性重组酶（如Cre和Flp）技术，到归巢核酸酶（meganucleases）技术、锌指核酸酶（zinc-finger nucleases，ZFNs）技术和转录激活因子样效应物核酸酶（transcription activator-like effector nucleases，TALENs）技术，再到当前广泛应用的CRISPR-Cas技术。CRISPR-Cas能成为当前基因组编辑的首选技术，主要有三个关键特性：第一，20nt
2026-04-02 09:05:57
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原创 基因组的“开路先锋”-先锋转录因子
（b、c）上图：在DEX处理的样品（b）和模拟处理的样品（c）中，采用ChIP-seq检测LFY显著结合位点与MNase-seq检测的核小体显著占据区域在LFY结合峰顶的上下游各1kb域内的平均信号。结果显示，AP1WT能够优先结合到紧密的染色质区域（ATAC-seq信号低的区域），并诱导这些区域染色质开放，AP1tet在紧密的染色质区域的结合能力显著减弱，且无法有效诱导染色质开放（图10）。有趣的是，目前植物中报道的先锋转录因子均与植物开花调控相关，不过这恰恰印证了先锋因子在关键发育转变中的核心地位。
2026-04-01 10:18:41
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原创 植物如何给自己“刹车”？
植物中有一类基因被形象地称为“刹车基因”，这类基因的存在主要是为了实现对各种生命过程的精准调控，它们像“刹车”一样，在特定时间点抑制或终止某些生理活动，防止反应过度，确保植物以最经济、有效的方式生长发育和应对外界环境。昆虫与植物之间的博弈，是一场持续了数亿年的无声战争。作为首个被进行基因研究的专门代谢途径之一，玉米中主要BZX的生物合成机制已被阐明，其中包含14种苯并恶嗪合成酶（BX酶），它们将初始的吲哚-3-甘油磷酸底物转化为超过20种结构各异的BZX衍生物(Zhou et al., 2018)。
2026-03-30 13:43:01
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原创 致死基因≠研究死胡同！这些方法帮你搞定
另外2个T0代突变体为双等位基因杂合突变体（株系1-3-3和2-4-7），其两条染色体分别携带移码突变和框内突变（突变未导致基因编码区阅读框移位，仅导致少量氨基酸缺失，且缺失的碱基数目为3的倍数），这两个突变体可产生种子，且结实率较低（分别为7.3±2.2%和5.8±2.9%），其T1代均为纯合框内突变，且结实率恢复至与野生型相当水平，表明框内突变的等位基因可高效传递给子代，并且未对配子体发育造成致命影响（图1d）。株系花柱长度显著缩短，花柱细胞伸长受阻，细胞分化标记（蜡质/褶皱结构）缺失（图2a、d）；
2026-03-27 09:09:08
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原创 盘点那些提高作物耐盐性的方法（一）
（A-C）将野生型（WT）幼苗在½MS固体培养基上培养10天，然后将WT幼苗在补充200mM NaCl的½MS液体培养基中培养，通过风干（A，B）进行脱水胁迫，或在补充100μM ABA、10mM ACC、100μM 6-BAP、100μM GA3、100μM IAA的½MS液体培养基中培养0、1、3和6小时。GmNPF7.5HapA以一种依赖于 pH 的方式介导Cl-或NO3-的吸收，并且对Cl-的通透性高于NO3-，其增加了Cl-的积累和盐损伤；而在沉默株系中，这些基因的表达变化趋势相反（图18）。
2026-03-26 13:44:48
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原创 盘点那些提高作物耐盐性的方法（一）
（A-C）将野生型（WT）幼苗在½MS固体培养基上培养10天，然后将WT幼苗在补充200mM NaCl的½MS液体培养基中培养，通过风干（A，B）进行脱水胁迫，或在补充100μM ABA、10mM ACC、100μM 6-BAP、100μM GA3、100μM IAA的½MS液体培养基中培养0、1、3和6小时。GmNPF7.5HapA以一种依赖于 pH 的方式介导Cl-或NO3-的吸收，并且对Cl-的通透性高于NO3-，其增加了Cl-的积累和盐损伤；而在沉默株系中，这些基因的表达变化趋势相反（图18）。
2026-03-25 10:22:49
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原创 保护我方“地三鲜”
病菌从根部伤口或直接从幼根及根毛表皮侵入寄主，初期菌丝体在皮层薄壁细胞间扩展，产生果胶酶分解破坏寄主细胞间的中胶层，进入维管束内繁殖，以后随液流向地上部扩展，到达茎秆、叶片、果实和种子内，引起发病，形成系统侵染。（c-h）接种后7天测量病斑直径（c）、丙二醛含量（d）、过氧化氢含量（e）、过氧化氢酶活性（f）、过氧化物酶活性（g）、超氧化物歧化酶活性（h）。（c-h）接种后7天测量病斑直径（c）、丙二醛含量（d）、过氧化氢含量（e）、过氧化氢酶活性（f）、过氧化物酶活性（g）、超氧化物歧化酶活性（h）。
2026-03-24 09:03:00
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原创 揭秘植物表型——通过相关指标明确基因功能（二）
结果显示，在淹水胁迫及恢复阶段，转基因株系的最大光化学效率（Fv/Fm）、光系统II最大光化学量子产额（Phi (P0)）、光系统II实际光化学量子产额（Phi (E0)）、光系统II调节性能量耗散量子产额（Phi (R0)）、总性能指数（PItotal）这些关键光合参数均高于野生型，证明。（A-H1）2周龄水稻幼苗分别在28℃常温培养及45℃高温处理4天后，NBT、DAB染色结果（A、B）、H2O2积累水平（C）、程序性细胞死亡的观察结果（D-H1）。（A2-J2）图A1-J1中红色方框区域的放大图像。
2026-03-24 08:59:38
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原创 保护我方“地三鲜”
丙二醛含量（d）、过氧化氢含量（e）、过氧化氢酶活性（f）、过氧化物酶活性（g）、超氧化物歧化酶活性（h）。发病以后，病斑上产生新的分生孢子，通过气流、雨水、昆虫和农事操作等传播，在田间频繁发生再侵染，扩大危害。（c-h）接种后7天测量病斑直径（c）、丙二醛含量（d）、过氧化氢含量（e）、过氧化氢酶活性（f）、过氧化物酶活性（g）、超氧化物歧化酶活性（h）。（c-h）接种后7天测量病斑直径（c）、丙二醛含量（d）、过氧化氢含量（e）、过氧化氢酶活性（f）、过氧化物酶活性（g）、超氧化物歧化酶活性（h）。
2026-03-19 09:03:32
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原创 保护我方“地三鲜”
病菌从根部伤口或直接从幼根及根毛表皮侵入寄主，初期菌丝体在皮层薄壁细胞间扩展，产生果胶酶分解破坏寄主细胞间的中胶层，进入维管束内繁殖，以后随液流向地上部扩展，到达茎秆、叶片、果实和种子内，引起发病，形成系统侵染。（c-h）接种后7天测量病斑直径（c）、丙二醛含量（d）、过氧化氢含量（e）、过氧化氢酶活性（f）、过氧化物酶活性（g）、超氧化物歧化酶活性（h）。（c-h）接种后7天测量病斑直径（c）、丙二醛含量（d）、过氧化氢含量（e）、过氧化氢酶活性（f）、过氧化物酶活性（g）、超氧化物歧化酶活性（h）。
2026-03-18 09:22:45
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原创 EMSA分子互作研发EMSA分子互作伯远
EMSA（Electrophoretic Mobility Shift Assay，电泳迁移率变动实验）是一种经典技术，用于检测转录因子、DNA结合蛋白等与特定DNA/RNA序列的直接相互作用，常作为Pull-down等生化实验的互补验证。EMSA 序列特异性强，直观定性/半定量 需纯蛋白/核提取物，无法鉴定未知蛋白 EMSA验证序列特异性，Pull-down鉴定互作蛋白。探针制备：20-50bp双链寡核苷酸（含结合基序如NF-κB、AP-1），5'端标记32P/生物素/DIG。
2026-03-10 16:08:22
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原创 新视角下的转录因子与启动子互作
本文内容速览：在植物基因功能研究中，转录因子的鉴定与功能研究始终占据着重要位置。围绕转录因子展开的功能研究，通常会聚焦其下游靶基因，并借助酵母单杂、双荧光素酶报告系统、EMSA等实验，验证转录因子与靶基因启动子/motif之间的互作。最终，我们得到的结论是，转录因子可以结合靶基因的启动子/某个motif，从而调控靶基因的表达。然而，在植物体内，转录因子与启动子的互作调控真的如此“简单粗暴”吗？2025年11月，Schaepe等人在Cell杂志上发表了一篇题为“Thermodynamic principles
2026-02-27 09:11:58
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原创 WRKY家族想做个自我介绍（二）
在本次的推文中小远主要是和大家一起回顾了WRKY转录因子响应非生物胁迫（干旱、高温、低温、盐胁迫、氧化应激、机械损伤以及紫外辐射）和生物胁迫（病原菌、虫害）的分子机制，因为篇幅有限，小远仅列举了其中的一部分研究成果，希望大家通过阅读本文可以对这方面的内容有一个初步的了解，大家如果感兴趣的话，还可以检索相关文献进行深入的学习哦，关于“WRKY家族想做个自我介绍”到这里就结束啦，期待伯小远后面更精彩的文章噢！并且，干旱胁迫还会导致活性氧（ROS）产生，氧化损伤，离子毒性等损害植物的生长发育（图2）。
2026-02-26 14:07:59
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原创 解析表观组学工具——Hi-C
本文内容速览：此前，小远给大家介绍了ATAC-seq与3C（染色质构象捕获技术）的基本知识，相关推文“解析表观遗传学的工具——ATAC-seq（一）”，“解析表观遗传学的工具——ATAC-seq（二）”，“植物学家们的美好愿景——建立植物ENCODE（pENCODE）”，“如何研究“暗物质”——增强子？（一）”。ATAC-seq能够在全基因组范围内精确检测染色质的开放程度，通过分析不同条件下染色质开放程度的动态变化，我们可以获取大量与基因表达调控相关的关键信息。而染色质构象捕获技术及其衍生技术，则主要用于解
2026-02-25 14:06:03
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原创 荧光蛋白的升级用法
有研究者通过对SMXL7蛋白的详细研究，使用SMXL7-YFP作为间接代表SLs的荧光探针（图10）。YC3.6（Yellow cameleon 3.6）是植物中常见的基于FRET的荧光钙指示剂，由青色荧光蛋白CFP、黄色荧光蛋白YFP、钙调蛋白CaM和肌球蛋白轻链激酶片段M13（M13为CaM靶蛋白序列）构成的，当CaM结合钙离子后，与M13紧密结合，CaM-M13的区域构象由松散变得紧密，使位于Ca2+结合区域两端的CFP和YFP距离变近，发生荧光共振能量转移，FRET信号值变高（图2）。
2026-02-24 13:28:30
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原创 盘点那些提高植物基因编辑效率的方法
本文内容速览：自CRISPR/Cas基因编辑技术引入植物研究体系以来，因其操作简便、靶向性强、适用物种广，迅速成为植物基因功能研究和分子育种领域的核心工具。尽管基因编辑在植物功能基因组学研究和精准育种中取得了诸多成功应用，但相比于“能否编辑”，更具挑战性的问题在于“能否稳定、高效地编辑”。在植物体系中，不同的编辑载体、靶点序列，实验批次、组织来源、基因组背景下的编辑效率往往存在显著差异，而编辑效率的高低，直接决定了突变体获取的成本、周期以及实验成功率。小远在这里为大家总结了几个提高植物基因编辑效率的方法，一
2026-02-11 09:59:43
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