R_JAVA_LIBRARY_PATH被修改

下面问题的原因找到了:是因为我在另一台机器上用root用户rsync了这台机器上的一些文件,在crontab中每半小时定时执行两个同步脚本,造成后者的anaconda3/lib/R/etc下的Makeconf被修改,有时甚至变为空文件,系统似乎自动执行了R CMD javareconf,生成了非预期的ldpaths。

rsync为何会这样,深层次的原因暂时未知。解决办法将那两个同步脚本放到别的用户下执行,没有root权限至少不会更改anaconda3/lib/R/etc/Makeconf。

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昨天linux上R程序用rJava包还正常,什么都没动过,今天library(rJava)报如下错误:

感觉是JAVA_LD_LIBRARY_PATH出了问题,运行 R RMD javareconf,看看配置,果然Java library path不对,应该是JAVA_HOME/lib/amd64/server

不知道配置为什么被改变,没辙。切换到anaconda3/lib/R/etc目录,查看Makeconf文件,居然没内容!随即从另一台机器拷贝了一个Makeconf文件过来(环境类似),再执行R CMD javareconf,看看配置,就正常了。

问题暂时解决,但原因未知,很诡异!

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