简单的生物信息开发平台-Bioperl+Visual Basic+Html

方案目的
========
    结合bioperl的生物信息处理能力,Visual Basic的GUI开发能力和html的报表能力,构建
简单的生物信息编程平台.

平台评述
========
bioperl
    优点:bioperl作为基于perl语言开发的模块库,是生物信息处理相关编程开发的利器.
缺点:perl的GUI不是很方便.

Visual Basic
    优点: Visual Basic 是常用的方便的GUI开发语言.
缺点: 没有好的用于进行生物信息处理的模块.

Html
    优点: 可以作为报表的载体,加上CSS,可以实现很漂亮的用于数据浏览的GUI.
缺点: 不适合数据处理.

解决方案
========
    用ActiveState的Perl Dev Kit将bioperl中的模块打包成一个独立的.dll文件,然后在
Visual Basic中调用.
    数据报表用Visual Basic的XML,HTML库来实现.

代码示例
========

   ...
     Dim seqproc
     Set seqproc = CreateObject("PerlDevKit.SeqProc") '<-

     Dim seqio
     Set seqio = seqproc.openseqfile("E:/XBIO/develop/PerlVB/test.fas") '<-
     Dim id

     id = "default"
     Dim leng

     Dim seq
     Dim flag

     flag = 1
     Do While (flag = 1)

    ...

    Set seq = seqio.next_seq '<-

        id = seq.id
        Set itmX = ListView1.ListItems.Add()
        itmX.Text = id
        leng = seq.length '<-

    ...



     Loop
   ...

疑难困惑
========

计划安排
========
    实现XML和RSS

Links
========

http://bioperl.org

http://bioinformatics.org

[bsmagic | wsmagic 原创, Creator of Tokamak Bioinformatics Suite ]
--