AI4S - CombFold: Predicting Structures of Large Protein Assemblies 推理流程 (3)

欢迎关注我的CSDN：https://spike.blog.csdn.net/
本文地址：https://spike.blog.csdn.net/article/details/136441046

免责声明：本文来源于个人知识与开源资料，仅用于学术交流，不包含任何商业技术，欢迎相互学习，不支持转载。

---

CombFold 是一种新的组装技术，可以利用 AlphaFold-Multimer 预测的可能的亚复合物的结构，来构建大型蛋白质复合物的结构。CombFold 的推理步骤如下：

• 第一步：定义亚单位。亚单位是指在组装过程中不会改变结构的单个结构域，例如 PDB: 6YBQ 中的 A0 和 G0。需要创建一个 subunits.json 文件，描述复合物中的所有亚单位的序列和链名。
• 第二步：使用 AlphaFold-Multimer 预测所有亚单位配对的结构。AlphaFold-Multimer 是一种可以预测多个亚单位之间相互作用的结构模型的方法。每个亚单位配对可以有多个结构模型，因为在组装时可以