ITK
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吨吨不打野
不要慌,不要慌,太阳落下有月光
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ITK——6. 常见操作和概念(C++)
可以直接使用ITK里自带的一个time类,如果是多次执行的代码片段,会自动帮你求平均,最大和最小,调用也很简单。,这个例子中不仅有时间的,还有更详细的内存分析。在ITK的example-,看到了这样的写法,更简单。但是其实有简单一点的做法。原创 2023-04-25 21:59:17 · 568 阅读 · 0 评论 -
ITK——5. 利用ITK自身的多线程加速filter计算
ITK多线程原创 2023-02-03 12:22:21 · 631 阅读 · 0 评论 -
ITK——4. 医学影像坐标系问题(世界坐标系、解剖坐标系和图像坐标系)
还有点小问题,但是基本完成了原创 2022-09-16 23:37:01 · 2730 阅读 · 9 评论 -
SimpleITK使用——5. dicom转nifti,获取dicom的meta信息
记录一下原创 2022-09-28 14:15:36 · 537 阅读 · 0 评论 -
ITK——3. 编译remote库
ITK编译时包含Remote模块里内容的编译原创 2022-08-09 13:09:13 · 372 阅读 · 0 评论 -
SimpleITK使用——4. 奇怪的问题
numpy默认数据类型问题原创 2022-06-30 22:52:04 · 1354 阅读 · 0 评论 -
SimpleITK使用——3. 常见操作
常见操作原创 2022-06-30 22:08:51 · 2464 阅读 · 3 评论 -
SimpleITK使用——2. 进行crop操作
参考:Stack Oveflow:SimpleItk crop imageITK forum:Simple ITK Crop ImageITK forum:How to crop a 3D image with a specified size?Github issue:SimpleITK/SimpleITKSimpleITK document:Image Grid Manipulation原创 2022-05-06 15:45:16 · 3990 阅读 · 1 评论 -
SimpleITK使用——1. 进行Resample/Resize操作
文章目录1. 变换到一个新的spacing1.1 使用Resample()的方法1.1.1 完整代码1.1.2 转换前后图像1.2 使用ResampleImageFilter()的方法2. 已知原图和变换后目标图像的大小2.1 代码2.2 转换后图像3. 相关内容说明3.0 体素和spacing3.1 Resample() 函数说明3.2 itk::simple::ResampleImageFilter函数说明1. 变换到一个新的spacing1.1 使用Resample()的方法1.1.1原创 2022-05-02 22:50:24 · 7512 阅读 · 17 评论 -
SimpleITK使用——6. DICOM-RT格式转换为nii.gz格式
其实Github上有很多这样的库和脚本,但是都大同小异,掌握关键那部分代码就可以。要明确一点,SimpleITK不支持对DICOM-RT struct格式大部分脚本都是用pydicom读取,然后再用numpy等进行切片等操作。1. 使用MIScnn库来完成转换安装sudo pip install miscnn # linuxpip install miscnn --user # Windows使用from miscnn.data_loading.interfaces.dicom_io原创 2022-04-26 20:46:22 · 1653 阅读 · 0 评论 -
SimpleITK使用——5. threshold类的方法
文章目录0. 背景知识0.1 mask0.2 SimpleITK快速入门1. 使用Threshold类方法1.1 sitk.RescaleIntensityImageFilter1.1.1 代码1.1.2 函数说明1.2 sitk.Threshold1.2.1 代码1.2.2 sitk.Threshold函数说明1.3 sitk.BinaryThreshold1.3.1 代码1.3.2 sitk.BinaryThreshold函数说明1.4 使用`OtsuThreshold`1.4.1 代码1.4.2 s原创 2022-04-26 14:42:13 · 2191 阅读 · 2 评论 -
ITK——2. 在mac中配置及使用vscode示例
2. mac中使用vscode配置itk前提条件,已经配置好了C++环境,如果没有配置后,可以参考另一篇博客:mac下vscode配置c++环境参考:itk官方文档:Chapter 2——Configuring and Building ITK。其实就是那个指导手册里的内容itk官方wiki:https://itk.org/Wiki/ITK/Configuring_and_Building/VisualStudio某大学的课件:https://www.cs.cmu.edu/~galeotti/m原创 2022-03-29 22:16:54 · 1640 阅读 · 0 评论 -
ITK——1. 初步认识和配置编译
文章目录1. itk基本信息2. mac中使用vscode配置itk4. windows配置itk2.5 配置好测试3. 其他文档3.1 ITK3.2 C++1. itk基本信息官网:https://itk.org/库说明:— Insight Toolkit (ITK)是一个开源的、跨平台的库,向开发者提供了大量图像分析的软件工具。使用敏捷方法 (Extreme Programming)进行开发,ITK是基于一个成熟的,面向空间/3D的框架,用于处理(processing)、分隔(segment原创 2022-03-20 15:57:02 · 4964 阅读 · 2 评论