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原创 IgBLAST本地化教程

第4步,然后在ncbi-igblast-1.21.0目录下创建一个database文件夹,然后找到第3步下载到的www.imgt.org文件夹,然后找到www.imgt.org/download/V-QUEST/IMGT_V-QUEST_reference_directory/Homo_sapiens/IG/IGHD.fasta这个文件,然后右键复制这个文件的地址替换掉下方代码文件的位置。第7步,在ncbi-igblast-1.21.0目录下运行代码。第2步,下载完之后进行解压缩。

2023-05-29 00:21:32 381

原创 DeepSpeed 安装

如果全部的都显示OKAY证明安装成功。如果有几个是NO的话那证明这几个文件安装失败,根据对应的WARNING在安装对应即可。例如我安装时sparse_attn显示NO,我就根据WARNING的提示输入。首先克隆github中的DeepSpeed文件。虚拟环境Python版本建议安装3.8版本。文件下载完毕后进入DeepSpeed文件夹。发现 sparse_attn变成了OKey。进入DeepSpeed文件夹后。

2023-04-14 14:55:49 7531 3

原创 IndexError: too many indices for array: array is 1-dimensional, but 2 were indexed

IndexError: too many indices for array: array is 1-dimensional, but 2 were indexed

2022-10-23 10:16:39 36021 3

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