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转载 质控软件fastp常用参数说明
写在前面 fastp是用于处理fastq文件,基于C++,支持多线程,包含fastQC和Trimmomatic的一些功能。这里主要给出常用参数的一些说明。 参数的说明主要参考githup上的使用说明,可能有翻译不到位或不恰当的情况,请以github上的说明为准。 参考文献 fastp工具...
2019-07-05 11:35:00
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转载 学习使用一款数据质控软件(Trimmomatic)
写在前面 Trimmomatic工具是用于illumina二代测序数据的reads处理,主要对接头(adapter)序列和低质量序列进行过滤。下面是使用该工具处理双端测序(PE)数据时,常用参数的一些说明。 参考文档 Trimmomatic工具的参考文献 Trimmomatic工具官网 Tr...
2019-06-24 15:08:00
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转载 mark几款质控软件fastp, trimmomatic, SOAPnuke
Fastp 参考文献 github Trimmomatic 参考文献 官方网站 使用手册 SOAPnuke 参考文献 github 一些介绍比较详细的文章: NGS 数据过滤之 Trimmomatic 详细说明 这篇文章介绍Trimmomatic软件说明参数比较详细 生信工具F...
2019-06-21 18:30:00
1494
空空如也
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