python之sklearn学习笔记

sklearn介绍

scikit-learn是数据挖掘与分析的简单而有效的工具。
依赖于NumPy， SciPy和matplotlib。

它主要包含以下几部分内容：

从功能来分：
classification
Regression
Clustering
Dimensionality reduction
Model selection

经常用到的有clustering, classification(svm, tree, linear regression 等), decomposition, preprocessing, metrics等

cluster

阅读sklearn.cluster的API，可以发现里面主要有两个内容：一个是各种聚类方法的class如cluster.KMeans，一个是可以直接使用的聚类方法的函数

sklearn.cluster.k_means(X, n_clusters, init='k-means++', 
    precompute_distances='auto', n_init=10, max_iter=300, 
    verbose=False, tol=0.0001, random_state=None, 
    copy_x=True, n_jobs=1, algorithm='auto', return_n_iter=False)

所以实际使用中，对应也有两种方法。

在sklearn.cluster共有9种聚类方法，分别是

AffinityPropagation: 吸引子传播
AgglomerativeClustering: 层次聚类
Birch
DBSCAN
FeatureAgglomeration: 特征聚集
KMeans: K均值聚类
MiniBatchKMeans
MeanShift
SpectralClustering: 谱聚类
拿我们最熟悉的Kmeans举例说明：

采用类构造器，来构造Kmeans聚类器

首先API中KMeans的构造函数为：

sklearn.cluster.KMeans(n_clusters=8,
     init='k-means++', 
    n_init=10, 
    max_iter=300, 
    tol=0.0001, 
    precompute_distances='auto', 
    verbose=0, 
    random_state=None, 
    copy_x=True, 
    n_jobs=1, 
    algorithm='auto'
    )

参数的意义：

n_clusters:簇的个数，即你想聚成几类
init: 初始簇中心的获取方法
n_init: 获取初始簇中心的更迭次数
max_iter: 最大迭代次数（因为kmeans算法的实现需要迭代）
tol: 容忍度，即kmeans运行准则收敛的条件
precompute_distances：是否需要提前计算距离
verbose: 冗长模式（不太懂是啥意思，反正一般不去改默认值）
random_state: 随机生成簇中心的状态条件。
copy_x: 对是否修改数据的一个标记，如果True，即复制了就不会修改数据。
n_jobs: 并行设置
algorithm: kmeans的实现算法，有：‘auto’, ‘full’, ‘elkan’, 其中 'full’表示用EM方式实现
下面给一个简单的例子：

import numpy as np
from sklearn.cluster import KMeans
data = np.random.rand(100, 3) #生成一个随机数据，样本大小为100, 特征数为3

#假如我要构造一个聚类数为3的聚类器
estimator = KMeans(n_clusters=3)#构造聚类器
estimator.fit(data)#聚类
label_pred = estimator.label_ #获取聚类标签
centroids = estimator.cluster_centers_ #获取聚类中心
inertia = estimator.inertia_ # 获取聚类准则的最后值

直接采用kmeans函数：

import numpy as np
from sklearn import cluster
data = np.random.rand(100, 3) #生成一个随机数据，样本大小为100, 特征数为3
k = 3 # 假如我要聚类为3个clusters
[centroid, label, inertia] = cluster.k_means(data, k)

classification

常用的分类方法有：

KNN最近邻:sklearn.neighbors
logistic regression逻辑回归: sklearn.linear_model.LogisticRegression
svm支持向量机: sklearn.svm
Naive Bayes朴素贝叶斯: sklearn.naive_bayes
Decision Tree决策树: sklearn.tree
Neural network神经网络: sklearn.neural_network
那么下面以KNN为例（主要是Nearest Neighbors Classification）来看看怎么使用这些方法：

from sklearn import neighbors, datasets

# import some data to play with
iris = datasets.load_iris()
n_neighbors = 15
X = iris.data[:, :2]  # we only take the first two features. We could
                      # avoid this ugly slicing by using a two-dim dataset
y = iris.target

weights = 'distance' # also set as 'uniform'
clf = neighbors.KNeighborsClassifier(n_neighbors, weights=weights)
clf.fit(X, y)

# if you have test data, just predict with the following functions
# for example, xx, yy is constructed test data
x_min, x_max = X[:, 0].min() - 1, X[:, 0].max() + 1
y_min, y_max = X[:, 1].min() - 1, X[:, 1].max() + 1
xx, yy = np.meshgrid(np.arange(x_min, x_max, h),
                         np.arange(y_min, y_max, h))
Z = clf.predict(np.c_[xx.ravel(), yy.ravel()]) # Z is the label_pred

再比如svm：

from sklearn import svm
X = [[0, 0], [1, 1]]
y = [0, 1]

#建立支持向量分类模型
clf = svm.SVC()

#拟合训练数据，得到训练模型参数
clf.fit(X, y)

#对测试点[2., 2.], [3., 3.]预测
res = clf.predict([[2., 2.],[3., 3.]])

#输出预测结果值
print (res)
#get support vectors
print ("support vectors:", clf.support_vectors_)

#get indices of support vectors
print ("indices of support vectors:", clf.support_ )

#get number of support vectors for each class
print ("number of support vectors for each class:", clf.n_support_ )

当然SVM还有对应的回归模型SVR

from sklearn import svm
X = [[0, 0], [2, 2]]
y = [0.5, 2.5]
clf = svm.SVR()
clf.fit(X, y) 
res = clf.predict([[1, 1]])
print(res)

逻辑回归

from sklearn import linear_model
X = [[0, 0], [1, 1]]
y = [0, 1]
logreg = linear_model.LogisticRegression(C=1e5)

#we create an instance of Neighbours Classifier and fit the data.
logreg.fit(X, y)

res = logreg.predict([[2, 2]])
print(res)

preprocessing

这一块通常我要用到的是Scale操作。而Scale类型也有很多，包括：

StandardScaler
MaxAbsScaler
MinMaxScaler
RobustScaler
Normalizer
等其他预处理操作
对应的有直接的函数使用：scale(), maxabs_scale(), minmax_scale(), robust_scale(), normaizer()。

import numpy as np
from sklearn import preprocessing
X = np.random.rand(3,4)

#用scaler的方法
scaler = preprocessing.MinMaxScaler()
X_scaled = scaler.fit_transform(X)

#用scale函数的方法
X_scaled_convinent = preprocessing.minmax_scale(X)

decomposition

NMF

import numpy as np
X = np.array([[1,1], [2, 1], [3, 1.2], [4, 1], [5, 0.8], [6, 1]])
from sklearn.decomposition import NMF
model = NMF(n_components=2, init='random', random_state=0)
model.fit(X)

print(model.components_)
print(model.reconstruction_err_)
print(model.n_iter_)

PCA

import numpy as np
X = np.array([[1,1], [2, 1], [3, 1.2], [4, 1], [5, 0.8], [6, 1]])
from sklearn.decomposition import PCA
model = PCA(n_components=2)
model.fit(X)

print(model.components_)
print(model.n_components_)
print(model.explained_variance_)
print(model.explained_variance_ratio_)
print(model.mean_)
print(model.noise_variance_)

datasets

sklearn本身也提供了几个常见的数据集，如iris, diabetes, digits, covtype, kddcup99, boson, breast_cancer，都可以通过sklearn.datasets.load_iris类似的方法加载相应的数据集。它返回一个数据集。采用下列方式获取数据与标签。

from sklearn.datasets import load_iris

iris = load_iris()
X = iris.data 
y = iris.target