Graphviz 和 pygraphviz 简述、安装、用法

最新推荐文章于 2025-03-13 16:43:52 发布

chirebingxue

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Graphviz 是一款强大的图形绘制工具，通过 DOT 语言编写脚本，轻松实现流程图、网络图等图形的绘制。本文详细介绍了 Graphviz 的使用方法、应用场景及安装步骤，包括 Windows 和 Linux 平台的安装指南。此外，通过实例演示了如何利用 pygraphviz 库在 Python 中绘制图形，并提供了二叉树绘制的示例代码。

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0x01 Graphviz简述

Graphviz是大名鼎鼎的贝尔实验室的几位牛人开发的一个画图工具，它提供了“所想即所得”的理念，通过dot语言来编写脚本并绘制图形，简单易懂。

官网：http://www.graphviz.org/

摘自维基百科的资料：https://zh.wikipedia.org/wiki/Graphviz

<span style="font-size:18px;">Graphviz由一种被称为DOT语言的图形描述语言 与一组可以生成和/或处理DOT文件的工具组成：

dot 
一个用来将生成的图形转换成多种输出格式的命令行工具。其输出格式包括PostScript，PDF，SVG，PNG，含注解的文本等等。
neato 
用于sprint model的生成（在Mac OS版本中称为energy minimized）。
twopi 
用于放射状图形的生成
circo 
用于圆形图形的生成。
fdp 
另一个用于生成无向图的工具。
dotty 
一个用于可视化与修改图形的图形用户界面程序。</span>

0x02 Graphviz能用来做什么

如果你想做数据分析，或者可视化处理，亦或是想在编程时动态的输出流程图，Graphvizs是一个好帮手。

文字描述就不多说了，主要看下面这些图：

0x03 为什么要用它？

用VISIO、excel、diagram这些工具不方便处理动态生成的流程图，不方便script kids去处理数据结果，经常要导入到这些静态分析的工具中

用html+js+css的方法可以处理，但是编程有十分麻烦，要考虑布局；又由于大部分的js脚本在处理绘图时要接收json格式的数据，处理起来比较麻烦。

但是Graphviz是支持所想即所得，他用图概念中的dot（节点）和edge（边）的概念来处理流程图。是高度封装好的（图类）（我这么理解的）

Graphviz使用的是dot语言，不过没关系，这种语言十分易懂。

dot语言：

片段代码1

<span style="font-size:18px;"> 1: digraph abc{
   2: node [shape="record"];
   3: edge [style="dashed"];
   4:  
   5: a [style="filled", color="black", fillcolor="chartreuse"];
   6: b;
   7: c;
   8: d;
   9:  
  10: a -> b;
  11: b -> d;
  12: c -> d [color="red"];
  13: }</span>

片段代码2

<span style="font-size:18px;">strict digraph  {
        graph [epsilon=0.001];
        a -> b;
        b -> c;
}</span>

代码中定义边的长度颜色由哪个点到哪个点就可以绘制简单的图形了。

如果还嫌麻烦，python 对graphviz 进行了一次封装使用pygraphviz就可以在python里面直接绘图啦，灰常贴心。

python 代码片段

<span style="font-size:18px;">import pygraphviz as pgv

A=pgv.AGraph()

A.add_edge(1,2)
A.add_edge(2,3)
A.add_edge(1,3)

print(A.string()) # print to screen
print("Wrote simple.dot")
A.write('simple.dot') # write to simple.dot

B=pgv.AGraph('simple.dot') # create a new graph from file
B.layout() # layout with default (neato)
B.draw('simple.png') # draw png
print("Wrote simple.png")
</span>

0x04 用Graphviz能做什么

对于网络安全来说，对时间的爆发，攻击的统计，攻击过程还原等等，这种需要在时间顺序中找出攻击规律，或者数据规律的地方是非常有用的。

比如对于一次攻击时间的还原，对于风控中盗号流程的还原。绘图给专家去观察事件爆发的先后顺序，再采用数据统计，或者先后验概率的归类方法，能够让分析者清晰的看到时间发生的前后情况。

0x05 HOW TO GET IT（安装方法）

Windows:

不建议用WINDOWS环境操作，python 可能会找不到Lib库，但是如果你只想用Graphviz那么Windows也是支持的，只是不再维护了，仍然可以下到msi的版本。

到官网下载http://www.graphviz.org/ windows版本的msi文件即可

Linux：

Step1:下载Graphviz http://www.graphviz.org/

</pre><span style="font-size:18px;"></span><pre name="code" class="html"><span style="font-size:18px;">tar -zxvf xxxxxxx.tar.gz
python setup.py install</span>

ubuntu可以直接apt-get install graphviz 和graphviz-dev

graphviz-dev是和Python库链接用的，需要下载

Step2:

pygraphviz下载：

方法1：可以到github下载源码也可以到pygraph官网去下载。https://github.com/pygraphviz/pygraphviz

下载后

<span style="font-size:18px;">python setup.py install </span>

安装

安装过程中可能会报错，可以尝试安装

sudo apt-get install python-dev

方法2：

片段代码1

参考资料：[1]

pygraphviz python库:https://github.com/pygraphviz/pygraphviz

官网:http://www.graphviz.org/

博客： http://www.cnblogs.com/rocketfan/archive/2009/09/09/1563628.html

http://blog.sina.com.cn/s/blog_6a6c136d0101eacr.html

http://icodeit.org/2012/01/%E4%BD%BF%E7%94%A8graphviz%E7%BB%98%E5%88%B6%E6%B5%81%E7%A8%8B%E5%9B%BE/

直接pip install安装

上述安装方法是在博客看到的，但是可能因为操作系统原因失败了，还是pip好

sudo pip install pygraphviz --install-option="--include-path=/usr/include/graphviz" --install-option="--library-path=/usr/lib/graphviz/"

*************************************************************************************************************************************************

附录：

以下是摘自其他博客的内容，非常有价值：

Graphviz 适合编程快速绘制流程图之类的图形。

而pygraphviz对graphviz进行了封装，提供python程序调用接口。网上有很多对graphiviz进行python封装的程序如pydot等等，个人觉得pygraphviz比较好用，有好的文档和示例程序。https://networkx.lanl.gov/trac/browser/pygraphviz/

在ubuntu下面安装 graphviz

sudo apt-get install graphviz, graphviz-dev

注意graphiviz-dev是pygraphviz所依赖的必须安装。

安装pygraphviz

注意不要sudo apt-get了，因为这样安装的不是最新版本，程序运行会有问题。

到这个地址下载最新的pygraphviz-0.99.1.tar.gz (md5)

http://pypi.python.org/pypi/pygraphviz/

解压缩，然后 sudo python2.6 setup.py install即可。

下面给个例子，如何利用graphiviz 的布局绘制下面的图形呢：

 
    
  
1//s.dot
 2//dot s.dot -Tpng -o s.png  -Gsplines=line  
 3digraph G {
 4  //a -> c;
 5  a -> b;
 6  b -> c;
 7  subgraph x{
 8      rank=same;
 9      b->d;
 10  }
 11  subgraph y{
 12      //rank = same;
 13      d->e;
 14  }
 15  subgraph z{
 16    rank=same;
 17    c->e;
 18  }
 19
 20 }
 21 
    
  

这里解释下，默认的图布局是自上到下的，TD，当然你可以改成自左向右布局,

digraph G {
rankdir=LR;

.....

}

但是一个时刻只能有一种布局方式,例如上图是采用从上到下的布局方式,为了使得边b->d能够水平,需要采用

subgraph 的方法添加子图,同时说明rank=same.

dot s.dot -Tpng -o s.png -Gsplines=line 中-Gsplines=line 表示强迫边是直线.

http://www.graphviz.org/mywiki/FaqBalanceTree

 
    
  
1digraph G {
 2a -> b0
 3xb [label="",width=.1,style=invis]
 4a -> xb [style=invis]
 5a -> b1
 6{rank=same b0 -> xb -> b1 [style=invis]}
 7b0 -> c0
 8xc [label="",width=.1,style=invis]
 9b0 -> xc [style=invis]
 10b0 -> c1
 11{rank=same c0 -> xc -> c1 [style=invis]}
 12} 
    
  

下面给出利用pygrahviz进行二叉树的绘制

首先给出最简单的绘制，然后是按照上面提到的利用invis属性，构造不可见的顶点和边强迫产生较合适的位置。

b0—t--b1 原理如昨图所示,对照上面的图示a到b0,a到b1是实边，t为不可见点，a到t，b0到t,t到b1都是不可见边，

这样强迫布局的时候对于横坐标，a尽量在b0,b1的中间。

1.不采用不可见点，边的二叉树绘制效果

1 #printTreeOld.py

 
    
  
 2import pygraphviz as pgv
  3
  4A=pgv.AGraph(directed=True,strict=True)
  5A.add_edge(1,2)
  6A.add_edge(1,3)
  7A.add_edge(2,4)
  8A.add_edge(2,5)
  9A.add_edge(5,6)
 10A.add_edge(5,7)
 11A.add_edge(3,8)
 12A.add_edge(3,9)
 13A.add_edge(8,10)
 14A.add_edge(8,11)
 15A.graph_attr['epsilon']='0.001'
 16print A.string() # print dot file to standard output
 17A.write('fooOld.dot')
 18A.layout('dot') # layout with dot
 19A.draw('fooOld.png') # write to file 
    
  

2.采用不可见点，边，绘制二叉树的效果,感觉稍微好一点,更像二叉树了:)

下面的代码仅仅是示例，可以提出子函数简化代码。

 
    
  
 1import pygraphviz as pgv
  2# strict (no parallel edges)
  3# digraph
  4# with attribute rankdir set to 'LR'
  5A=pgv.AGraph(directed=True,strict=True)
  6A.add_edge(1,2)
  7A.add_edge(1,3)
  8A.add_node('a',style='invis')
  9A.add_edge(1,'a',style='invis')
 10B=A.add_subgraph([2,3,'a'],rank='same')
 11B.add_edge(2,'a',style='invis')
 12B.add_edge('a',3,style='invis')
 13
 14A.add_edge(2,4)
 15A.add_edge(2,5)
 16A.add_node('b',style='invis')
 17A.add_edge(2,'b',style='invis')
 18C=A.add_subgraph([4,5,'b'],rank='same')
 19C.add_edge(4,'b',style='invis')
 20C.add_edge('b',5,style='invis')
 21
 22A.add_edge(5,6)
 23A.add_edge(5,7)
 24A.add_node('c',style='invis')
 25A.add_edge(5,'c',style='invis')
 26D=A.add_subgraph([6,7,'c'],rank='same')
 27D.add_edge(6,'c',style='invis')
 28D.add_edge('c',7,style='invis')
 29
 30A.add_edge(3,8)
 31A.add_edge(3,9)
 32A.add_node('d',style='invis')
 33A.add_edge(3,'d',style='invis')
 34E=A.add_subgraph([8,9,'d'],rank='same')
 35E.add_edge(8,'d',style='invis')
 36E.add_edge('d',9,style='invis')
 37
 38A.add_edge(8,10)
 39A.add_edge(8,11)
 40A.add_node('e',style='invis')
 41A.add_edge(8,'e',style='invis')
 42F=A.add_subgraph([10,11,'e'],rank='same')
 43F.add_edge(10,'e',style='invis')
 44F.add_edge('e',11,style='invis')
 45
 46
 47A.graph_attr['epsilon']='0.001'
 48print A.string() # print dot file to standard output
 49A.write('foo.dot')
 50A.layout('dot') # layout with dot
 51A.draw('foo.png') # write to file
 52 
    
  