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进化树注释绘制
文章平均质量分 91
Chthollysage
这个作者很懒,什么都没留下…
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进化树绘制之使用ape包实现icamp结果可视化
之前学习了如何使用itol.toolkit添加进化树注释。本文主要使用r语言中的ape包来实现icamp结果可视化本文思路参考及主要代码来源于Nature Microbiology树形图的R语言可视化代码数据来源(由于文章还未发表,需要请私信)复现目标依然是Ning D, Wang Y, Fan Y, et al. Environmental stress mediates groundwater microbial community assembly中的Fig.4APE (Analysis of。原创 2024-05-06 22:59:05 · 900 阅读 · 1 评论 -
进化树绘制之使用itol.kit实现进化树注释
icamp分析后需要对进化树进行注释,把icamp的结果在进化树中表现出来。本文复现Ning D, Wang Y, Fan Y, et al. Environmental stress mediates groundwater microbial community assembly. Nat Microbiol. 2024;中的Fig.4本文使用的数据保存在其中包含一份树文件和两个数据文件,以及一个代码文件。原创 2024-05-06 11:36:40 · 1550 阅读 · 2 评论